| 中文摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第一章 前言 | 第9-19页 |
| 1.1 伪狂犬病毒（pseudorabies virus,PRV） | 第9-10页 |
| 1.1.1 PRV发现历史 | 第9页 |
| 1.1.2 PRV感染症状 | 第9页 |
| 1.1.3 PRV潜伏期 | 第9-10页 |
| 1.2 转录组测序 | 第10-11页 |
| 1.2.1 RNA-Seq技术 | 第10页 |
| 1.2.2 RNA-Seq技术在宿主猪研究中的应用 | 第10-11页 |
| 1.3 自噬 | 第11-18页 |
| 1.3.1 自噬简介 | 第11-12页 |
| 1.3.2 自噬的选择性 | 第12-13页 |
| 1.3.3 自噬分子机制 | 第13-15页 |
| 1.3.4 自噬信号调控 | 第15-16页 |
| 1.3.5 自噬与病毒 | 第16-18页 |
| 1.4 研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 材料和方法 | 第19-26页 |
| 2.1 试验材料 | 第19页 |
| 2.1.1 细胞系 | 第19页 |
| 2.1.2 试剂和仪器 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-26页 |
| 2.2.1 主要溶液配制 | 第19-20页 |
| 2.2.2 细胞的复苏、传代、冻存 | 第20页 |
| 2.2.3 TCID50的测定 | 第20页 |
| 2.2.4 病毒感染 | 第20-21页 |
| 2.2.5 RNA提取 | 第21页 |
| 2.2.6 cDNA合成 | 第21-22页 |
| 2.2.7 qRT-PCR | 第22-23页 |
| 2.2.8 转录组实验流程 | 第23-25页 |
| 2.2.9 western blot | 第25-26页 |
| 第三章 实验结果 | 第26-43页 |
| 3.1 RNA质量检测结果 | 第26-28页 |
| 3.1.1 琼脂糖凝胶 | 第26页 |
| 3.1.2 Agilent 2100 检测结果 | 第26-27页 |
| 3.1.3 Nanodrop定量 | 第27-28页 |
| 3.2 测序数据统计和评估 | 第28-30页 |
| 3.2.1 测序质量分布 | 第28-29页 |
| 3.2.2 测序碱基分布 | 第29-30页 |
| 3.2.3 测序整体质量评估 | 第30页 |
| 3.3 测序比对质量评估 | 第30-31页 |
| 3.4 基因表达水平及差异分析 | 第31-35页 |
| 3.4.1 转录本表达估计质量评估 | 第31-33页 |
| 3.4.2 转录本表达量统计 | 第33-34页 |
| 3.4.3 表达水平差异分析 | 第34-35页 |
| 3.5 差异表达基因InterProScan功能注释 | 第35-37页 |
| 3.6 差异表达基因GO功能分析 | 第37-38页 |
| 3.7 差异表达基因KEGG通路分析 | 第38-40页 |
| 3.8 qRT-PCR验证结果 | 第40页 |
| 3.9 自噬实验结果 | 第40-43页 |
| 3.9.1 TCID50测定 | 第40-41页 |
| 3.9.2 病毒感染 | 第41-42页 |
| 3.9.3 western blot结果 | 第42-43页 |
| 第四章 讨论与展望 | 第43-46页 |
| 第五章 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-54页 |
| 英文缩略词表 | 第54-55页 |
| 在学期间的研究成果 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
