| 缩略语表 | 第6-8页 |
| 中文摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 前言 | 第14-15页 |
| 文献回顾 | 第15-25页 |
| 1. 乙型肝炎病毒的流行病学 | 第15-16页 |
| 2. 乙肝病毒的复制 | 第16-17页 |
| 3. HBV的结构 | 第17-19页 |
| 4. HBV的基因型 | 第19-20页 |
| 5. HBV的耐药 | 第20-23页 |
| 6. HBV BCP/Pre C区突变与病情发展的关系 | 第23-25页 |
| 第一部分 乙型病毒性肝炎个体化检测平台优化升级 | 第25-38页 |
| 1 材料 | 第25-26页 |
| 1.1 标准序列 | 第25页 |
| 1.2 软件 | 第25-26页 |
| 2 方法 | 第26-27页 |
| 2.1 HBV DNA序列分析及HBV基因分型PCR扩增引物优化 | 第26页 |
| 2.2 HBV基因分型软件优化 | 第26页 |
| 2.3 软件整合升级 | 第26页 |
| 2.4 HBV分型分析软件功能验证 | 第26-27页 |
| 3 结果 | 第27-36页 |
| 3.1 HBV基因分型标准序列选择 | 第27页 |
| 3.2 HBV 基因分型与耐药突变检测共用序列的分析与 PCR 扩增引物设计 | 第27-30页 |
| 3.3 软件升级整合 | 第30-33页 |
| 3.5 优化后的HBV基因分型功能的理论验证 | 第33-36页 |
| 4 讨论 | 第36-38页 |
| 第二部分 乙肝病毒逆转录酶基因突变分析 | 第38-49页 |
| 1 材料和仪器 | 第38-39页 |
| 1.1 临床样本 | 第38页 |
| 1.2 试剂与材料 | 第38页 |
| 1.3 主要仪器 | 第38-39页 |
| 1.4 常用试剂配制 | 第39页 |
| 2 实验方法 | 第39-42页 |
| 2.1 引物合成 | 第39页 |
| 2.2 组织样本HBV DNA提取 | 第39-40页 |
| 2.3 RT区外巢PCR及电泳 | 第40-41页 |
| 2.4 RT区内巢PCR及电泳 | 第41页 |
| 2.5 HBV基因分型和RT区序列突变分析 | 第41-42页 |
| 2.6 统计分析 | 第42页 |
| 3 结果 | 第42-46页 |
| 3.1 RT基因目的片段扩增效率统计及产物电泳检测结果 | 第42页 |
| 3.2 DNA测序及HBV基因分型分析 | 第42-44页 |
| 3.3 RT基因耐药相关突变分析 | 第44-45页 |
| 3.4 rt169和rt180位点突变与疾病发展的关系 | 第45-46页 |
| 4 讨论 | 第46-49页 |
| 第三部分 乙肝病毒BCP/PRE C区基因序列常见突变与基因突变多样性分析 | 第49-66页 |
| 1 材料和仪器 | 第49-50页 |
| 1.1 临床样本 | 第49页 |
| 1.2 试剂与材料 | 第49-50页 |
| 1.3 主要仪器 | 第50页 |
| 1.4 常用试剂配制 | 第50页 |
| 2 实验方法 | 第50-54页 |
| 2.1 引物合成 | 第50-51页 |
| 2.2 样本处理 | 第51页 |
| 2.3 BCP/Pre C区外巢PCR及电泳 | 第51-52页 |
| 2.4 BCP/Pre C区内巢PCR及电泳 | 第52页 |
| 2.5 部分测序失败样本重新进行PCR扩增并胶回收 | 第52-53页 |
| 2.6 T-A克隆 | 第53-54页 |
| 2.7 HBV BCP/Pre C区序列分析 | 第54页 |
| 2.8 统计分析 | 第54页 |
| 3 结果 | 第54-63页 |
| 3.1 BCP/Pre C区目的片段扩增效率统计及产物电泳检测结果 | 第54-55页 |
| 3.2 DNA测序及序列分析 | 第55-56页 |
| 3.3 HBV BCP区1799位点突变分析 | 第56-57页 |
| 3.4 BCP/Pre C区测序失败样本的克隆测序结果 | 第57-60页 |
| 3.5 BCP/Pre C区突变多样性分析 | 第60-63页 |
| 4 讨论 | 第63-66页 |
| 小结 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-77页 |
| 研究成果 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
