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鸭瘟病毒UL41基因原核表达、转录时相及亚细胞定位

中文摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
缩略词表第7-11页
一、引言第11-16页
    1. UL41基因及其编码蛋白的特点第11-12页
        1.1 UL41基因的特点第11页
        1.2 UL41基因编码蛋白的特点第11-12页
    2. VHS蛋白的功能第12-13页
    3. VHS与其他蛋白的相互作用第13-14页
        3.1 VHS与VP16的相互作用第13-14页
        3.2 VHS与细胞内翻译起始因子的相互作用第14页
    4. UL41基因工程(缺失)疫苗第14-15页
    5. 展望第15页
    6. 选题目的及意义第15-16页
二、试验研究第16-50页
    1. 材料第16-19页
        1.1 基因序列第16页
        1.2 生物信息学相关分析工具第16页
        1.3 毒株、菌株及载体第16页
        1.4 实验动物第16-17页
        1.5 主要试剂第17-18页
        1.6 主要溶液的配制第18-19页
            1.6.1 细胞培养相关溶液第18页
            1.6.2 核酸电泳相关溶液第18页
            1.6.3 细菌培养相关溶液第18页
            1.6.4 SDS-PAGE电泳相关溶液第18-19页
            1.6.5 Western-blot试剂第19页
        1.7 主要仪器设备第19页
    2. 方法第19-30页
        2.1 生物信息学分析第19页
        2.2 鸭瘟病毒UL41基因的克隆、表达和抗血清制备第19-27页
            2.2.1 DPV-CHv株基因组DNA的提取第19-21页
            2.2.2 PCR扩增UL41基因及产物鉴定第21-22页
            2.2.3 UL41基因T克隆及鉴定第22-23页
            2.2.4 UL41基因重组表达质粒的构建第23-24页
            2.2.5 表达质粒pET-32a(+)/UL41在大肠杆菌BL21(DE3)中表达第24-25页
            2.2.6 重组UL41编码蛋白表达条件的优化第25页
            2.2.7 UL41重组蛋白的纯化第25-26页
            2.2.8 UL41表达蛋白的Western-blot鉴定第26页
            2.2.9 兔抗UL41重组蛋白多克隆抗体的制备第26-27页
            2.2.10 兔抗DPV UL41 IgG的粗提和鉴定第27页
        2.3 鸭瘟病毒UL41基因转录时相分析第27-29页
            2.3.1 FQ-PCR检测DPV感染DEF后UL41基因的转录第27-29页
            2.3.2 核酸蛋白合成抑制试验分析UL41基因类型第29页
        2.4 间接免疫荧光法动态检测UL41编码蛋白的亚细胞定位第29-30页
    3. 结果第30-45页
        3.1 生物信息学分析第30-36页
            3.1.1 DPV UL41基因的核苷酸序列分析第30-31页
            3.1.2 UL41基因编码氨基酸翻译和蛋白质组分分析第31页
            3.1.3 氨基酸序列对比及系统进化分析第31-32页
            3.1.4 信号肽预测第32-33页
            3.1.5 跨膜区域的预测第33页
            3.1.6 疏水性分析第33页
            3.1.7 抗原性分析第33-34页
            3.1.8 磷酸化位点预测第34页
            3.1.9 蛋白质二级结构预测第34页
            3.1.10 细胞亚定位分析第34-35页
            3.1.11 蛋白质三级结构预测第35页
            3.1.12 保守结构域CDD分析第35页
            3.1.13 稀有密码子分析结果第35-36页
        3.2 鸭瘟病毒UL41基因的克隆、表达和抗血清制备第36-40页
            3.2.1 鸭瘟病毒UL41基因的扩增第36-37页
            3.2.2 鸭瘟病毒UL41基因的T克隆与鉴定第37页
            3.2.3 UL41基因重组表达质粒的构建第37页
            3.2.4 UL41重组蛋白的诱导表达及条件优化第37-39页
            3.2.5 重组蛋白纯化第39页
            3.2.6 UL41重组蛋白的Western-blot第39页
            3.2.7 兔抗DPV UL41血清抗体效价的琼扩试验第39页
            3.2.8 Western-Blotting鉴定兔抗UL41多克隆抗体特异性第39-40页
            3.2.9 兔抗DPV UL41 IgG的粗提第40页
        3.3 鸭瘟病毒UL41基因转录时相分析第40-44页
            3.3.1 RNA完整性及纯度检测第40页
            3.3.2 引物特异性检测第40-41页
            3.3.3 绘制实时荧光定量PCR标准曲线第41-42页
            3.3.4 DPV感染DEF后UL41基因转录情况第42-43页
            3.3.5 数据分析第43页
            3.3.6 核酸蛋白合成抑制实验第43-44页
        3.4 间接免疫荧光法动态检测UL41编码蛋白的亚细胞定位第44-45页
    4. 讨论第45-50页
        4.1 生物信息学第45-46页
            4.1.1 关于生物信息学第45页
            4.1.2 鸭瘟病毒UL41基因及其编码蛋白特征分析第45-46页
        4.2 鸭瘟病毒UL41基因的克隆、表达和抗血清制备第46-48页
            4.2.1 UL41基因引物设计及T克隆第46页
            4.2.2 外源基因的融合表达第46-47页
            4.2.3 UL41抗血清的制备第47-48页
        4.3 鸭瘟病毒UL41基因转录时相分析第48-49页
            4.3.1 实时荧光定量PCR法检测DPV UL41基因转录情况第48页
            4.3.2 核酸蛋白合成抑制试验分析UL41基因类型第48-49页
        4.4 DPV体外感染DEF UL41蛋白的亚细胞定位第49-50页
三、结论第50-51页
参考文献第51-58页
致谢第58-59页
攻读学位期间发表的学术论文目录第59页

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