RNA编辑事件的识别算法与特性分析
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 课题的研究目的和意义 | 第9-10页 |
| 1.2 分子遗传学背景简介 | 第10-14页 |
| 1.2.1 中心法则 | 第12页 |
| 1.2.2 RNA在遗传中的作用 | 第12-13页 |
| 1.2.3 单核苷酸多态性与RNA编辑 | 第13-14页 |
| 1.3 论文工作 | 第14-15页 |
| 1.4 论文章节安排 | 第15-17页 |
| 第二章 RNA编辑事件概要 | 第17-25页 |
| 2.1 RNA编辑事件综述 | 第17-19页 |
| 2.1.1 RNA编辑产生原理 | 第17-18页 |
| 2.1.2 RNA编辑事件的研究 | 第18-19页 |
| 2.2 RNA编辑事件处理方法的分类 | 第19-20页 |
| 2.2.1 De novo分析模式 | 第19页 |
| 2.2.2 DNA-RNA分析模式 | 第19-20页 |
| 2.3 RNA编辑事件数据处理背景 | 第20-21页 |
| 2.3.1 两代测序 | 第20页 |
| 2.3.2 测序相关文件类型 | 第20-21页 |
| 2.4 假设检验 | 第21-22页 |
| 2.4.1 卡方检验 | 第21-22页 |
| 2.4.2 著性检验 | 第22页 |
| 2.5 RNA编辑结果精确性评价 | 第22-24页 |
| 2.6 RNA编辑事件的特性分析意义 | 第24页 |
| 2.7 本章小结 | 第24-25页 |
| 第三章 RNA编辑事件的识别研究 | 第25-37页 |
| 3.1 RNA编辑事件算法研究 | 第25-27页 |
| 3.2 规则型滤除算法 | 第27-32页 |
| 3.2.1 指定型滤除算法 | 第28页 |
| 3.2.2 质量控制滤除算法 | 第28-29页 |
| 3.2.3 重复区域滤除算法 | 第29-30页 |
| 3.2.4 测序连接区域滤除算法 | 第30-31页 |
| 3.2.5 核苷酸多态性滤除算法 | 第31页 |
| 3.2.6 专有规则型滤除算法 | 第31-32页 |
| 3.3 统计型滤除算法 | 第32-35页 |
| 3.3.1 专有统计型滤除算法 | 第32-33页 |
| 3.3.2 共有统计型滤除算法 | 第33-35页 |
| 3.4 本章小结 | 第35-37页 |
| 第四章 RNA编辑事件识别算法和特性分析的实现 | 第37-45页 |
| 4.1 识别算法和特性分析的实现概述 | 第37-38页 |
| 4.2 识别算法的数据处理和优化 | 第38-42页 |
| 4.2.1 识别算法的数据处理 | 第38-41页 |
| 4.2.2 识别算法的处理优化 | 第41-42页 |
| 4.3 识别算法的跨平台构建 | 第42-43页 |
| 4.4 识别算法的统计学计算和特性分析 | 第43页 |
| 4.5 特性分析的大型文本处理 | 第43-44页 |
| 4.6 本章小结 | 第44-45页 |
| 第五章 RNA编辑事件特性分析 | 第45-57页 |
| 5.1 特性分析概述 | 第45-46页 |
| 5.1.1 研究目的 | 第45页 |
| 5.1.2 分析数据和硬件环境 | 第45-46页 |
| 5.2 分析结果对比呈现 | 第46-49页 |
| 5.2.1 位点数量和运行时间对比 | 第46-48页 |
| 5.2.2 位点重合对比 | 第48-49页 |
| 5.3 RNA编辑位点功能分布 | 第49-53页 |
| 5.4 RNA编辑在不同组织的分布 | 第53-55页 |
| 5.4.1 癌组织和正常组织的分布对比 | 第53-54页 |
| 5.4.2 癌组织和正常组织编辑水平的区别 | 第54-55页 |
| 5.5 本章小结 | 第55-57页 |
| 第六章 总结与展望 | 第57-59页 |
| 6.1 论文工作总结 | 第57页 |
| 6.2 信息处理与医学信息的结合的未来发展前景 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 致谢 | 第63-65页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文及申请专利 | 第65页 |
