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家畜布鲁氏菌病流行病学调查及布鲁氏菌单核苷酸多态性分子分型研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词表第11-12页
第一部分 文献综述第12-36页
 第一章 布鲁氏菌病研究进展第12-18页
  1 布鲁氏菌病原学第12-13页
  2 布鲁氏菌病流行病学第13-18页
   ·诊断方法第13-14页
   ·免疫接种第14页
   ·疫情防控第14-18页
 第二章 布鲁氏菌分子分型研究进展第18-28页
  1 脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)第18-19页
  2 插入序列711(insert sequence 711,IS 711)第19页
  3 多重PCR(Multiplex Polymerase Chain Reaction,Multiplex PCR)第19-20页
  4 限制性酶切片段长度多态性(Restriction Fragment polymorphism,RFLP)第20页
  5 扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)第20-21页
  6 随机扩增多态性(randomly amplified polymorphic DNA,RAPD)第21页
  7 重复短序列(enterobacterial repetitive intergenic consensus ,ERIC和repetitiveextragenic palindromic,REP)第21-22页
  8 rpoB基因多态性第22页
  9 多位点可变数目串联重复序列(VNTR)分析(Multiple-locus variable-numbertandem repeat analysis,MLVA)第22-24页
   ·MLVA-8第23页
   ·MLVA-15第23页
   ·MLVA-21第23-24页
  10 多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)第24-25页
  11 单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism,SNP)第25-28页
 参考文献第28-36页
第二部分 试验部分第36-84页
 第一章 布鲁氏菌实时荧光定量PCR单核苷酸多态性分型方法的建立第36-60页
  1 材料与方法第38-47页
   ·材料第38-40页
     ·菌种第38页
     ·主要试剂第38页
     ·主要仪器第38-40页
   ·方法第40-47页
     ·基因序列比对第40页
     ·单核苷酸多态性位点(SNP)的筛查与确认第40-41页
     ·探针引物的设计合成第41页
     ·基因组DNA的提取第41页
     ·实时荧光定量PCR分型方法的建立第41-47页
  2 结果第47-55页
   ·基因序列比对结果第47-48页
     ·区分布鲁氏菌属第47页
     ·区分布鲁氏菌亚种第47页
     ·区分布鲁氏菌生物亚型第47-48页
     ·区分布鲁氏菌疫苗株第48页
   ·单核苷酸多态性位点(SNP)确认结果第48-49页
   ·实时荧光定量PCR分型方法的建立和初步评价结果第49-55页
     ·实时荧光定量PCR分型方法的体系优化结果第49-50页
     ·实时荧光定量PCR分型方法的特异性试验结果第50-51页
     ·实时荧光定量PCR分型方法的敏感性试验结果第51页
     ·实时荧光定量PCR分型方法的重现性试验结果第51-53页
     ·实时荧光定量PCR分型方法阳性质控标准品的制备结果第53-55页
  3 讨论第55-57页
  参考文献第57-60页
 第二章 家畜布鲁氏菌流行病学调查第60-84页
  1 材料与方法第61-64页
   ·材料第61-62页
     ·样品采集第61-62页
     ·主要试剂第62页
     ·主要仪器第62页
   ·方法第62-64页
     ·血清学检测流程第62页
     ·分离菌株的鉴定和分型第62-63页
     ·分离株的基因扩增测序及系统进化分析第63-64页
  2 结果第64-80页
   ·家畜布鲁氏菌病流行病学调查结果第64-67页
     ·三间分布第64-66页
     ·重点地区牛羊布病抽样调查结果第66-67页
   ·病原分离鉴定结果第67-70页
     ·生化鉴定结果第67-69页
     ·常规PCR鉴定结果第69-70页
   ·部分临床分离株实时荧光定量PCR方法鉴定和分型结果第70-76页
     ·布鲁氏菌属水平的鉴定结果第70-71页
     ·布鲁氏菌亚种水平的鉴定结果第71-73页
     ·布鲁氏菌生物亚型水平的鉴定结果第73-76页
   ·临床分离株基因扩增测序和系统进化分析结果第76-80页
     ·omp25基因扩增结果第76-77页
     ·系统进化分析结果第77-80页
  3 讨论第80-81页
  参考文献第81-84页
全文总结第84-86页
附录第86-88页
致谢第88页

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