摘要 | 第1-9页 |
ABSTRACT | 第9-11页 |
缩略词表 | 第11-12页 |
第一部分 文献综述 | 第12-36页 |
第一章 布鲁氏菌病研究进展 | 第12-18页 |
1 布鲁氏菌病原学 | 第12-13页 |
2 布鲁氏菌病流行病学 | 第13-18页 |
·诊断方法 | 第13-14页 |
·免疫接种 | 第14页 |
·疫情防控 | 第14-18页 |
第二章 布鲁氏菌分子分型研究进展 | 第18-28页 |
1 脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE) | 第18-19页 |
2 插入序列711(insert sequence 711,IS 711) | 第19页 |
3 多重PCR(Multiplex Polymerase Chain Reaction,Multiplex PCR) | 第19-20页 |
4 限制性酶切片段长度多态性(Restriction Fragment polymorphism,RFLP) | 第20页 |
5 扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP) | 第20-21页 |
6 随机扩增多态性(randomly amplified polymorphic DNA,RAPD) | 第21页 |
7 重复短序列(enterobacterial repetitive intergenic consensus ,ERIC和repetitiveextragenic palindromic,REP) | 第21-22页 |
8 rpoB基因多态性 | 第22页 |
9 多位点可变数目串联重复序列(VNTR)分析(Multiple-locus variable-numbertandem repeat analysis,MLVA) | 第22-24页 |
·MLVA-8 | 第23页 |
·MLVA-15 | 第23页 |
·MLVA-21 | 第23-24页 |
10 多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST) | 第24-25页 |
11 单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism,SNP) | 第25-28页 |
参考文献 | 第28-36页 |
第二部分 试验部分 | 第36-84页 |
第一章 布鲁氏菌实时荧光定量PCR单核苷酸多态性分型方法的建立 | 第36-60页 |
1 材料与方法 | 第38-47页 |
·材料 | 第38-40页 |
·菌种 | 第38页 |
·主要试剂 | 第38页 |
·主要仪器 | 第38-40页 |
·方法 | 第40-47页 |
·基因序列比对 | 第40页 |
·单核苷酸多态性位点(SNP)的筛查与确认 | 第40-41页 |
·探针引物的设计合成 | 第41页 |
·基因组DNA的提取 | 第41页 |
·实时荧光定量PCR分型方法的建立 | 第41-47页 |
2 结果 | 第47-55页 |
·基因序列比对结果 | 第47-48页 |
·区分布鲁氏菌属 | 第47页 |
·区分布鲁氏菌亚种 | 第47页 |
·区分布鲁氏菌生物亚型 | 第47-48页 |
·区分布鲁氏菌疫苗株 | 第48页 |
·单核苷酸多态性位点(SNP)确认结果 | 第48-49页 |
·实时荧光定量PCR分型方法的建立和初步评价结果 | 第49-55页 |
·实时荧光定量PCR分型方法的体系优化结果 | 第49-50页 |
·实时荧光定量PCR分型方法的特异性试验结果 | 第50-51页 |
·实时荧光定量PCR分型方法的敏感性试验结果 | 第51页 |
·实时荧光定量PCR分型方法的重现性试验结果 | 第51-53页 |
·实时荧光定量PCR分型方法阳性质控标准品的制备结果 | 第53-55页 |
3 讨论 | 第55-57页 |
参考文献 | 第57-60页 |
第二章 家畜布鲁氏菌流行病学调查 | 第60-84页 |
1 材料与方法 | 第61-64页 |
·材料 | 第61-62页 |
·样品采集 | 第61-62页 |
·主要试剂 | 第62页 |
·主要仪器 | 第62页 |
·方法 | 第62-64页 |
·血清学检测流程 | 第62页 |
·分离菌株的鉴定和分型 | 第62-63页 |
·分离株的基因扩增测序及系统进化分析 | 第63-64页 |
2 结果 | 第64-80页 |
·家畜布鲁氏菌病流行病学调查结果 | 第64-67页 |
·三间分布 | 第64-66页 |
·重点地区牛羊布病抽样调查结果 | 第66-67页 |
·病原分离鉴定结果 | 第67-70页 |
·生化鉴定结果 | 第67-69页 |
·常规PCR鉴定结果 | 第69-70页 |
·部分临床分离株实时荧光定量PCR方法鉴定和分型结果 | 第70-76页 |
·布鲁氏菌属水平的鉴定结果 | 第70-71页 |
·布鲁氏菌亚种水平的鉴定结果 | 第71-73页 |
·布鲁氏菌生物亚型水平的鉴定结果 | 第73-76页 |
·临床分离株基因扩增测序和系统进化分析结果 | 第76-80页 |
·omp25基因扩增结果 | 第76-77页 |
·系统进化分析结果 | 第77-80页 |
3 讨论 | 第80-81页 |
参考文献 | 第81-84页 |
全文总结 | 第84-86页 |
附录 | 第86-88页 |
致谢 | 第88页 |