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鳝鱼、泥鳅颚口线虫感染调查及分类鉴定与LAMP方法的建立

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
常用缩略词(Abbreviation)第7-10页
1 前言第10-24页
    1.1 颚口线虫病原第10-11页
        1.1.1 分类地位第10页
        1.1.2 生活史第10-11页
    1.2 流行病学第11-14页
    1.3 颚口线虫分类鉴别方法第14-16页
    1.4 分子生物学的发展第16-19页
        1.4.1 核酸扩增技术的发展历程第16-17页
        1.4.2 常见的变温核酸扩增技术第17-18页
        1.4.3 常见的恒温核酸扩增技术第18-19页
    1.5 LAMP检测技术第19-23页
    1.6 研究目的和意义第23-24页
2 材料和方法第24-34页
    2.1 材料第24-26页
        2.1.1 虫体的采集第24页
        2.1.2 虫体样本第24页
        2.1.3 主要试剂第24页
        2.1.4 试剂的配制第24-25页
        2.1.5 主要材料和仪器第25-26页
        2.1.6 主要生物信息学数据库及软件第26页
    2.2 方法第26-34页
        2.2.1 颚口线虫的流行病学调查和形态学鉴定第26页
        2.2.2 虫体DNA的提取第26-27页
        2.2.3 PCR扩增rDNA-ITS2基因鉴定颚口线虫第27-32页
        2.2.4 PCR检测方法的建立第32-33页
        2.2.5 LAMP方法的建立第33-34页
3 结果与分析第34-52页
    3.1 镜检结果第34-39页
        3.1.1 体视显微镜镜检第34-35页
        3.1.2 生物显微镜镜检第35-39页
    3.2 黄鳝和泥鳅中颚口线虫的检出情况第39-41页
        3.2.1 国内部分省市市售黄鳝和泥鳅中颚口线虫的检出情况第39-40页
        3.2.2 广州口岸进境黄鳝中颚口线虫的检出情况第40-41页
    3.3 rDNA-ITS2基因鉴定颚口线虫PCR扩增结果第41-42页
    3.4 rDNA-ITS2基因序列分析结果第42-45页
        3.4.1 rDNA-ITS2序列在NCBI上比对第42页
        3.4.2 对不同的碱基变异位点分析第42-43页
        3.4.3 进化树分析第43-45页
    3.5 COX1 PCR方法的建立结果与分析第45-48页
        3.5.1 温度优化结果第45页
        3.5.2 Mg2+浓度优化的结果与分析第45-46页
        3.5.3 特异性实验结果与分析第46-47页
        3.5.4 颚口线虫重复性实验结果与分析第47-48页
        3.5.5 测序结果与分析第48页
    3.6 颚口线虫LAMP方法建立的结果与分析第48-52页
        3.6.1 引物设计结果第48-49页
        3.6.2 LAMP反应条件结果与分析第49页
        3.6.3 特异性试验结果与分析第49-50页
        3.6.4 灵敏度试验结果与分析第50页
        3.6.5 与PCR对比结果与分析第50-51页
        3.6.6 重复性和稳定性试验第51-52页
        3.6.7 实际样品检测的结果与分析第52页
4 讨论与结论第52-57页
    4.1 讨论第52-55页
        4.1.1 国内外黄鳝中颚口线虫抽样调查情况的讨论第52-53页
        4.1.2 颚口线虫PCR鉴定结果讨论第53-54页
        4.1.3 颚口线虫LAMP方法建立结果的讨论第54-55页
    4.2 结论第55-57页
致谢第57-58页
参考文献第58-63页
附录:攻读硕士学位期间取得的研究成果第63页

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