摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
常用缩略词(Abbreviation) | 第7-10页 |
1 前言 | 第10-24页 |
1.1 颚口线虫病原 | 第10-11页 |
1.1.1 分类地位 | 第10页 |
1.1.2 生活史 | 第10-11页 |
1.2 流行病学 | 第11-14页 |
1.3 颚口线虫分类鉴别方法 | 第14-16页 |
1.4 分子生物学的发展 | 第16-19页 |
1.4.1 核酸扩增技术的发展历程 | 第16-17页 |
1.4.2 常见的变温核酸扩增技术 | 第17-18页 |
1.4.3 常见的恒温核酸扩增技术 | 第18-19页 |
1.5 LAMP检测技术 | 第19-23页 |
1.6 研究目的和意义 | 第23-24页 |
2 材料和方法 | 第24-34页 |
2.1 材料 | 第24-26页 |
2.1.1 虫体的采集 | 第24页 |
2.1.2 虫体样本 | 第24页 |
2.1.3 主要试剂 | 第24页 |
2.1.4 试剂的配制 | 第24-25页 |
2.1.5 主要材料和仪器 | 第25-26页 |
2.1.6 主要生物信息学数据库及软件 | 第26页 |
2.2 方法 | 第26-34页 |
2.2.1 颚口线虫的流行病学调查和形态学鉴定 | 第26页 |
2.2.2 虫体DNA的提取 | 第26-27页 |
2.2.3 PCR扩增rDNA-ITS2基因鉴定颚口线虫 | 第27-32页 |
2.2.4 PCR检测方法的建立 | 第32-33页 |
2.2.5 LAMP方法的建立 | 第33-34页 |
3 结果与分析 | 第34-52页 |
3.1 镜检结果 | 第34-39页 |
3.1.1 体视显微镜镜检 | 第34-35页 |
3.1.2 生物显微镜镜检 | 第35-39页 |
3.2 黄鳝和泥鳅中颚口线虫的检出情况 | 第39-41页 |
3.2.1 国内部分省市市售黄鳝和泥鳅中颚口线虫的检出情况 | 第39-40页 |
3.2.2 广州口岸进境黄鳝中颚口线虫的检出情况 | 第40-41页 |
3.3 rDNA-ITS2基因鉴定颚口线虫PCR扩增结果 | 第41-42页 |
3.4 rDNA-ITS2基因序列分析结果 | 第42-45页 |
3.4.1 rDNA-ITS2序列在NCBI上比对 | 第42页 |
3.4.2 对不同的碱基变异位点分析 | 第42-43页 |
3.4.3 进化树分析 | 第43-45页 |
3.5 COX1 PCR方法的建立结果与分析 | 第45-48页 |
3.5.1 温度优化结果 | 第45页 |
3.5.2 Mg2+浓度优化的结果与分析 | 第45-46页 |
3.5.3 特异性实验结果与分析 | 第46-47页 |
3.5.4 颚口线虫重复性实验结果与分析 | 第47-48页 |
3.5.5 测序结果与分析 | 第48页 |
3.6 颚口线虫LAMP方法建立的结果与分析 | 第48-52页 |
3.6.1 引物设计结果 | 第48-49页 |
3.6.2 LAMP反应条件结果与分析 | 第49页 |
3.6.3 特异性试验结果与分析 | 第49-50页 |
3.6.4 灵敏度试验结果与分析 | 第50页 |
3.6.5 与PCR对比结果与分析 | 第50-51页 |
3.6.6 重复性和稳定性试验 | 第51-52页 |
3.6.7 实际样品检测的结果与分析 | 第52页 |
4 讨论与结论 | 第52-57页 |
4.1 讨论 | 第52-55页 |
4.1.1 国内外黄鳝中颚口线虫抽样调查情况的讨论 | 第52-53页 |
4.1.2 颚口线虫PCR鉴定结果讨论 | 第53-54页 |
4.1.3 颚口线虫LAMP方法建立结果的讨论 | 第54-55页 |
4.2 结论 | 第55-57页 |
致谢 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-63页 |
附录:攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第63页 |