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大豆株型突变体it1的鉴定与图位克隆

摘要第8-9页
英文摘要第9-10页
1 前言第11-24页
    1.1 株型的概念第11页
    1.2 主要粮食作物株型遗传育种研究概况第11-15页
        1.2.1 水稻第12-14页
        1.2.2 小麦第14页
        1.2.3 玉米第14-15页
    1.3 作物株型的基因挖掘第15-18页
        1.3.1 水稻株型基因定位与克隆第15-17页
        1.3.2 其它作物株型相关基因定位与克隆第17-18页
    1.4 大豆株型研究及相关基因定位第18-22页
        1.4.1 株高第18-20页
        1.4.2 分枝第20页
        1.4.3 叶片性状第20-22页
        1.4.4 大豆高产理想株型研究的发展趋势第22页
    1.5 研究的目的和意义第22-23页
    1.6 本研究的技术路线第23-24页
2 材料与方法第24-29页
    2.1 试验材料第24-25页
        2.1.1 野生型及突变体来源第24页
        2.1.2 定位群体的构建第24-25页
    2.2 实验方法第25-29页
        2.2.1 突变体农艺性状考察第25页
        2.2.2 叶绿素总含量以及光合色素含量的测定第25页
        2.2.3 茎杆成份的测定第25页
        2.2.4 半薄切片制备及电镜观察第25-26页
        2.2.5 大豆基因组DNA提取第26页
        2.2.6 PCR反应和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳程序第26-27页
        2.2.7 大豆总RNA的提取、cDNA的合成第27页
        2.2.8 转录组测序及分析第27-29页
3 结果与分析第29-59页
    3.1 突变体的特征第29页
    3.2 突变体与野生型重要性状比较第29-34页
        3.2.1 突变体与野生型的茎部性状比较第29-30页
        3.2.2 突变体与野生型产量相关性状比较第30-31页
        3.2.3 突变体与野生型产量性状相关性分析第31-34页
    3.3 it1突变体与野生型生理性状比较第34-36页
        3.3.1 it1突变体与野生型叶绿素含量测定第34-35页
        3.3.2 it1突变体与野生型叶绿素组分测定第35页
        3.3.3 it1突变体与野生型茎杆组分测定第35-36页
    3.4 it1的细胞学分析第36-38页
    3.5 突变体表型遗传分析第38页
    3.6 株型突变基因初定位第38-41页
        3.6.1 多态性标记的筛选第38-39页
        3.6.2 株型基因连锁标记的的筛选第39-40页
        3.6.3 株型基因的初步定位第40页
        3.6.4 定位区间在中黄13群体中的验证第40-41页
    3.7 精细定位第41-42页
    3.8 野生型和突变体叶片的转录组分析第42-59页
        3.8.1 总RNA质量检测第42页
        3.8.2 测序数据产出统计第42-43页
        3.8.3 测序数据及其质量控制第43-46页
        3.8.4 差异表达筛选第46-47页
        3.8.5 差异表达基因数目统计第47页
        3.8.6 差异表达基因聚类分析第47-48页
        3.8.7 差异表达基因功能注释和富集分析第48-49页
        3.8.8 差异表达基因GO分类第49-53页
        3.8.9 差异表达基因KEGG注释第53-55页
        3.8.10 差异表达基因KEGG通路富集分析第55-57页
        3.8.11 定位区段内基因表达分析第57-59页
4 讨论第59-61页
    4.1 株型突变体的特性第59页
    4.2 株型相关基因定位第59-60页
    4.3 转录组候选基因分析第60-61页
5 结论第61-63页
    5.1 突变体特征第61页
    5.2 突变体基因定位及基因预测第61页
    5.3 突变体与野生型转录表达差异第61-63页
致谢第63-64页
参考文献第64-71页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第71页

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