| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 绪论 | 第14-31页 |
| 1.1 引言 | 第14页 |
| 1.2 研究背景 | 第14-29页 |
| 1.2.1 基因组序列k-mer的研究 | 第14-17页 |
| 1.2.2 核小体研究进展 | 第17-26页 |
| 1.2.3 CpG岛序列 | 第26-29页 |
| 1.3 论文主要内容 | 第29-31页 |
| 第二章 研究方法 | 第31-36页 |
| 2.1 8-mer频谱 | 第31页 |
| 2.2 8-mer子集中m-mer的相对频率 | 第31-32页 |
| 2.3 新对称相对熵 | 第32-33页 |
| 2.4 特征量构建 | 第33页 |
| 2.5 ROC分析 | 第33-34页 |
| 2.6 相关分析 | 第34页 |
| 2.7 模体搜索 | 第34-36页 |
| 第三章 人类1号染色体序列中k-mer频谱 | 第36-40页 |
| 3.1 数据集 | 第36页 |
| 3.2 结果和讨论 | 第36-40页 |
| 第四章 酵母基因组序列的8-mer频谱 | 第40-46页 |
| 4.1 数据集 | 第40页 |
| 4.2 结果和讨论 | 第40-46页 |
| 4.2.1 XY二核苷分类下的8-mer频谱 | 第40-42页 |
| 4.2.2 三个CG模体子集中m-mer使用偏好 | 第42-43页 |
| 4.2.3 XY_1模体子集中m-mer使用偏差 | 第43-46页 |
| 第五章 CG_1模体生物功能的验证 | 第46-53页 |
| 5.1 数据集 | 第46-47页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第47-53页 |
| 5.2.1 CG_1模体信息与核小体结合模体的相关性 | 第47-50页 |
| 5.2.2 CG_1模体信息在核小体中心序列上的分布 | 第50-53页 |
| 第六章 挤压核小体和连接序列的特征分析 | 第53-59页 |
| 6.1 数据集 | 第53-54页 |
| 6.2 结果和讨论 | 第54-59页 |
| 6.2.1 挤压核小体的序列特征 | 第54-56页 |
| 6.2.2 连接序列上保守模体分析 | 第56-59页 |
| 第七章 CG_2模体生物功能的验证 | 第59-62页 |
| 7.1 数据集 | 第59-60页 |
| 7.2 结果和讨论 | 第60-62页 |
| 第八章 总结和展望 | 第62-65页 |
| 8.1 工作总结 | 第62-63页 |
| 8.2 工作展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-79页 |
| 附录 | 第79-84页 |
| 附录1 酵母全体8-mer和三个CG子集中2-mer的相对频率 | 第79-80页 |
| 附录2 酵母全体8-mer和三个CG子集中3-mer的相对频率 | 第80-82页 |
| 附录3 酵母全体8-mer和三个CG子集中4-mer的相对频率 | 第82-84页 |
| 致谢 | 第84-85页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第85页 |
