| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 引言 | 第13-15页 |
| 第一章 文献研究 | 第15-21页 |
| 1.1 茶枝柑及近缘种植物研究进展 | 第15-17页 |
| 1.1.1 茶枝柑及近缘种植物的资源分布概况 | 第15页 |
| 1.1.2 茶枝柑的分子标记研究现状 | 第15-16页 |
| 1.1.3 茶枝柑的嫁接机理研究现状 | 第16-17页 |
| 1.2 遗传标记研究进展 | 第17-20页 |
| 1.2.1 ISSR分子标记 | 第17-18页 |
| 1.2.2 SCoT分子标记 | 第18页 |
| 1.2.3 DNA条形码标记 | 第18-20页 |
| 1.3 小结 | 第20-21页 |
| 第二章 茶枝柑及近缘种的ISSR分子鉴定 | 第21-33页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第21-23页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.2 仪器和试剂 | 第23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 样品DNA提取及检测 | 第23-24页 |
| 2.2.2 正交优化ISSR-PCR反应体系 | 第24页 |
| 2.2.3 引物筛选 | 第24-26页 |
| 2.2.4 退火温度优化 | 第26页 |
| 2.2.5 多态性筛选 | 第26页 |
| 2.2.6 数据分析 | 第26-27页 |
| 2.3 结果与分析 | 第27-31页 |
| 2.3.1 DNA提取结果 | 第27页 |
| 2.3.2 PCR反应体系正交优化结果分析 | 第27-28页 |
| 2.3.3 引物筛选及退火温度优化 | 第28-29页 |
| 2.3.4 ISSR-PCR扩增的多态性筛选 | 第29-30页 |
| 2.3.5 ISSR标记的遗传相似性分析 | 第30页 |
| 2.3.6 ISSR标记UPMGA聚类分析 | 第30-31页 |
| 2.4 小结与讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 ScoT结合ISSR分析茶枝柑及近缘种遗传多态性 | 第33-43页 |
| 3.1 材料与试剂 | 第33页 |
| 3.1.1 材料 | 第33页 |
| 3.1.2 仪器和试剂 | 第33页 |
| 3.2 实验方法 | 第33-36页 |
| 3.2.1 基因组DNA提取与检测 | 第33页 |
| 3.2.2 SCoT-PCR反应体系的正交试验设计 | 第33-34页 |
| 3.2.3 SCoT-PCR扩增与检测 | 第34-35页 |
| 3.2.4 SCoT-PCR引物筛选 | 第35页 |
| 3.2.5 退火温度筛选 | 第35-36页 |
| 3.2.6 SCoT-PCR多态性引物筛选 | 第36页 |
| 3.2.7 数据分析 | 第36页 |
| 3.3 结果与分析 | 第36-41页 |
| 3.3.1 DNA提取结果 | 第36页 |
| 3.3.2 SCoT-PCR反应体系正交优化结果分析 | 第36-37页 |
| 3.3.3 引物筛选及退火温度优化 | 第37页 |
| 3.3.4 SCoT扩增的多态性分析 | 第37-39页 |
| 3.3.5 SCoT标记的遗传相似性分析 | 第39页 |
| 3.3.6 SCoT标记聚类分析 | 第39-40页 |
| 3.3.7 SCoT和ISSR标记聚类结果比较 | 第40页 |
| 3.3.8 SCoT和ISSR标记综合分析 | 第40-41页 |
| 3.4 小结与讨论 | 第41-43页 |
| 第四章 SCoT结合克隆测序对茶枝柑及近缘种鉴定 | 第43-52页 |
| 4.1 材料与试剂 | 第43-44页 |
| 4.1.1 材料 | 第43页 |
| 4.1.2 仪器和试剂 | 第43-44页 |
| 4.2 实验方法 | 第44-46页 |
| 4.2.1 基因组DNA提取与检测 | 第44页 |
| 4.2.2 SCoT引物筛选与扩增 | 第44页 |
| 4.2.3 克隆与测序 | 第44-46页 |
| 4.2.4 序列分析 | 第46页 |
| 4.3 结果与分析 | 第46-49页 |
| 4.3.1 DNA提取结果 | 第46-47页 |
| 4.3.2 SCoT扩增结果 | 第47页 |
| 4.3.3 凝胶回收浓度 | 第47-48页 |
| 4.3.4 克隆电泳结果分析 | 第48页 |
| 4.3.5 基于SCoT19序列的遗传距离及同源性分析 | 第48-49页 |
| 4.3.6 基于SCoT19序列的系统进化树分析 | 第49页 |
| 4.4 小结与讨论 | 第49-52页 |
| 第五章 茶枝柑及近缘种的条形码鉴别研究 | 第52-59页 |
| 5.1 材料与试剂 | 第52页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第52页 |
| 5.1.2 仪器与试剂 | 第52页 |
| 5.2 实验方法 | 第52-53页 |
| 5.2.1 样品DNA的提取 | 第52页 |
| 5.2.2 PCR扩增 | 第52-53页 |
| 5.2.3 电泳检测及测序 | 第53页 |
| 5.2.4 数据处理 | 第53页 |
| 5.3 结果与分析 | 第53-58页 |
| 5.3.1 材料DNA提取 | 第53页 |
| 5.3.2 PCR扩增结果 | 第53-54页 |
| 5.3.3 序列分析及鉴定效率评价 | 第54-55页 |
| 5.3.4 条形码序列种间、种内距离分析及barcoding gap检验 | 第55-56页 |
| 5.3.5 茶枝柑及近缘种的NJ聚类分析 | 第56-58页 |
| 5.4 小结与讨论 | 第58-59页 |
| 第六章 基于条形码对茶枝柑驳枝与芽枝的区分 | 第59-63页 |
| 6.1 仪器与试剂 | 第59-60页 |
| 6.1.1 材料 | 第59页 |
| 6.1.2 仪器和试剂 | 第59-60页 |
| 6.2 方法 | 第60页 |
| 6.2.1 PCR扩增 | 第60页 |
| 6.2.2 电泳检测及测序 | 第60页 |
| 6.2.3 序列分析 | 第60页 |
| 6.3 结果与分析 | 第60-62页 |
| 6.3.1 DNA提取结果 | 第60页 |
| 6.3.2 扩增结果 | 第60-61页 |
| 6.3.3 测序结果 | 第61-62页 |
| 6.4 讨论与小结 | 第62-63页 |
| 第七章 茶枝柑果皮的DNA提取优化及含量对比 | 第63-69页 |
| 7.1 材料与方法 | 第63-64页 |
| 7.1.1 材料 | 第63页 |
| 7.1.2 仪器和试剂 | 第63-64页 |
| 7.2 实验方法 | 第64-65页 |
| 7.2.1 缓冲液的配制 | 第64页 |
| 7.2.2 DNA提取步骤 | 第64-65页 |
| 7.2.3 DNA产率和质量检测 | 第65页 |
| 7.3 结果与分析 | 第65-67页 |
| 7.3.1 不同提取方法优化结果对比 | 第65-66页 |
| 7.3.2 不同贮存年限茶枝柑果皮的DNA质量与含量对比 | 第66页 |
| 7.3.3 PCR检测 | 第66-67页 |
| 7.3.4 trnH/psbA-PCR序列验证 | 第67页 |
| 7.4 讨论与小结 | 第67-69页 |
| 结语 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-76页 |
| 附录 | 第76-77页 |
| 在校期间发表论文情况 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 统计学审核证明 | 第79页 |
