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携带blaIMP和1型整合子的多个IncN2型质粒的测序和比较基因组学分析

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
缩略词第11-12页
前言第12-24页
    1 肺炎克雷伯菌、产酸克雷伯菌和弗氏柠檬酸杆菌及细菌耐药现状第12-13页
        1.1 肺炎克雷伯菌第12页
        1.2 产酸克雷伯菌第12页
        1.3 弗氏柠檬酸杆菌第12-13页
    2 碳青霉烯酶简介第13-16页
        2.1 A类碳青霉烯酶第13-14页
        2.2 B类碳青霉烯酶第14-15页
            2.2.1 VIM第15页
            2.2.2 NDM第15页
            2.2.3 其他第15页
        2.3 D类碳青霉烯酶第15-16页
    3 IMP研究进展第16-17页
        3.1 IMP特征和流行病学第16-17页
        3.2 IMP型MBLs耐药基因的传播与转移方式第17页
    4 整合子第17-21页
        4.1 整合子分类第17-18页
        4.2 1型整合子第18-21页
            4.2.1 1型整合子结构第18-19页
            4.2.2 1型整合子进化第19-21页
    5 IncN型质粒第21-22页
        5.1 IncN1型质粒的参考质粒第22页
        5.2 IncN2型质粒的参考质粒第22页
        5.3 IncN3型质粒的参考质粒第22页
    6 IncN型质粒中IMP研究现状第22-23页
    7 本研究的目的、意义第23-24页
1 引言第24页
2 材料与方法第24-47页
    2.1 实验材料第24-26页
        2.1.1 实验菌株第24页
        2.1.2 试剂第24-25页
        2.1.3 主要仪器第25-26页
    2.2 实验方法第26-47页
        2.2.1 菌株的分纯与保种第26页
        2.2.2 改良Carba NP法检测碳青霉烯酶类型第26-28页
        2.2.3 碳青霉烯酶基因的筛查第28-30页
        2.2.4 ESBLs基因筛查第30-31页
        2.2.5 待测菌株菌种鉴定第31-32页
        2.2.6 接合转移实验第32-34页
        2.2.7 药物敏感性实验第34页
        2.2.8 利用Qiagen Large-Construct Kit从接合子中提取质粒DNA第34-36页
        2.2.9 Nextera Mate Pair大片段文库构建第36-45页
        2.2.10 质粒测序与生物信息学分析第45-47页
3 结果与讨论第47-70页
    3.1 产碳青霉烯酶菌株的筛查与鉴定第47-50页
        3.1.1 选定深入研究3株菌株的临床详细背景资料第47-48页
        3.1.2 菌种鉴定(16S rRNA)第48页
        3.1.3 产酶实验第48-49页
        3.1.4 碳青霉烯酶基因筛查第49页
        3.1.5 ESBLs基因筛查第49-50页
    3.2 相关实验菌株获得及其耐药表型与遗传背景分析第50-55页
        3.2.1 系列实验菌株获得:接合转移第50页
        3.2.2 耐药基因筛查第50-51页
        3.2.3 产酶实验第51-52页
        3.2.4 药敏实验第52-55页
    3.3 碳青霉烯耐药机制研究第55-70页
        3.3.1 p0801-IMP,p7121-IMP和p17285-IMP质粒测序与精细注释第55-62页
        3.3.2 纳入分析的质粒第62-64页
        3.3.3 p0801-IMP系列质粒骨架区比较第64-67页
        3.3.4 p0801-IMP系列质粒外源插入区第67-70页
4 讨论第70-72页
5 结论第72-73页
参考文献第73-77页
附录第77-80页
    主要试剂、溶液配制方法第77-78页
    个人简历第78-79页
    在学期间的研究成果目录第79-80页
致谢第80-81页
综述 IMP 型金属 β-内酰胺酶研究进展第81-87页
    参考文献第85-87页
发表文章第87-100页

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