| 中文摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 引言 | 第10-16页 |
| 1.1 种子萌发与活力 | 第10页 |
| 1.2 DNA甲基化概述 | 第10-11页 |
| 1.3 DNA甲基化的生物学意义 | 第11-13页 |
| 1.3.1 调节植物的生长与发育 | 第11-12页 |
| 1.3.2 调节基因表达 | 第12-13页 |
| 1.4 DNA甲基化检测技术 | 第13-15页 |
| 1.4.1 甲基化敏感扩增多肽性技术 | 第14页 |
| 1.4.2 甲基化免疫共沉淀法 | 第14-15页 |
| 1.4.3 重亚硫酸盐测序 | 第15页 |
| 1.4.4 McrBC-PCR | 第15页 |
| 1.5 本研究的目的意义 | 第15-16页 |
| 2 试验材料、试剂与方法 | 第16-21页 |
| 2.1 试验材料 | 第16页 |
| 2.2 试验试剂 | 第16-17页 |
| 2.2.1 常用试剂 | 第16页 |
| 2.2.2 常用溶液试剂配制方法 | 第16页 |
| 2.2.3 主要仪器 | 第16-17页 |
| 2.3 试验方法 | 第17-21页 |
| 2.3.1 玉米种子的取样方法 | 第17页 |
| 2.3.2 玉米果穗不同部位吸胀不同时间甲基化免疫共沉淀 | 第17-19页 |
| 2.3.2.1 DNA的提取与纯化 | 第17页 |
| 2.3.2.2 DNA的检测及浓度的测定 | 第17页 |
| 2.3.2.3 MeDIP-seq及Solexa测序 | 第17-18页 |
| 2.3.2.4 序列筛选和比对 | 第18页 |
| 2.3.2.5 数据分析 | 第18-19页 |
| 2.3.3 DNA甲基化验证 | 第19-20页 |
| 2.3.3.1 McrBC | 第19页 |
| 2.3.3.2 DNA甲基化PCR | 第19-20页 |
| 2.3.4 候选基因的表达分析 | 第20-21页 |
| 2.3.4.1 引物设计和内参基因选择 | 第20页 |
| 2.3.4.2 RNA抽提 | 第20页 |
| 2.3.4.3 cDNA第一条链合成 | 第20页 |
| 2.3.4.4 qRT-PCR反应 | 第20-21页 |
| 3 结果与分析 | 第21-30页 |
| 3.1 MeDIP-seq数据分析 | 第21-24页 |
| 3.1.1 原始数据分析 | 第21-22页 |
| 3.1.2 DNA甲基化Peaks分析 | 第22-24页 |
| 3.2 DNA甲基化区的特征 | 第24页 |
| 3.3 玉米甲基化差异基因分析 | 第24-26页 |
| 3.4 甲基化基因的功能注释 | 第26-27页 |
| 3.5 差异甲基化基因的验证McrBC-PCR | 第27-28页 |
| 3.6 甲基化差异基因表达分析 | 第28-30页 |
| 4 讨论 | 第30-35页 |
| 4.1 能量代谢相关的甲基化基因与种子萌发 | 第30-31页 |
| 4.2 DNA复制和修复相关的甲基化基因与种子萌发 | 第31-32页 |
| 4.3 转录和翻译相关的甲基化基因与种子萌发 | 第32-33页 |
| 4.4 调节植物激素相关的甲基化基因与种子萌发 | 第33-34页 |
| 4.5 其他甲基化基因 | 第34-35页 |
| 5 结论 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-43页 |
| 附录 | 第43-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
