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酵母端粒酶延伸端粒DNA分子机制的研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 文献综述第12-23页
    1.1 端粒酶生物学特征第12-14页
        1.1.1 端粒和端粒酶的发现第12-13页
        1.1.2 端粒与端粒酶的关系第13-14页
    1.2 端粒、端粒酶的结构第14-19页
        1.2.1 端粒酶催化亚基TERT的结构第14-16页
        1.2.2 端粒酶模板RNA(TER)的结构特点第16页
        1.2.3 端粒酶TERT和TER-DNA的结合第16-17页
        1.2.4 端粒酶各亚基的功能及正负调节第17-18页
        1.2.5 端粒酶结构进展第18-19页
    1.3 端粒DNA延伸的校对研究第19-20页
        1.3.1 核酸酶研究进展第19页
        1.3.2 具有核酸酶功能的解旋酶研究进展第19-20页
    1.4 本课题的研究目的和意义第20-23页
第二章 实验材料、方法与机理第23-34页
    2.1 实验材料第23-25页
        2.1.1 实验试剂第23页
        2.1.2 生物材料第23页
        2.1.3 生化与分子生物学试剂第23-24页
        2.1.4 常规生化实验溶液第24页
        2.1.5 配制的主要反应缓冲液(Buffer)第24-25页
    2.2 实验仪器设备第25-26页
    2.3 实验方法第26-31页
        2.3.1 蛋白质的表达与纯化第26-27页
        2.3.2 质粒载体的构建第27页
        2.3.3 质粒纯化及线性化第27-28页
        2.3.4 RNA的转录及纯化第28-30页
        2.3.5 核酸底物的制备第30-31页
    2.4 实验机理第31-34页
        2.4.1 动态光散射(DLS)技术分析Ca TERT寡聚状态第31-32页
        2.4.2 蛋白-核酸的结合反应测试第32-33页
        2.4.3 快速停留技术(Stopped-Flow)观察RNA径环打开实验第33-34页
第三章C.Albicans基本生化活性第34-41页
    3.1 CN与核酸的亲核性第34-37页
    3.2 CaTERT端粒酶的寡聚状态分析第37-38页
    3.3 C.Albicans基本生化特性第38-41页
第四章 模板RNA序列中含有调控延伸的信号第41-47页
    4.1 端粒酶复合物可以识别rC~(261)-rC~(262)氨基酸序列作为一个调控信号第41-42页
    4.2 不同结构域的RNA对活力的影响第42-44页
    4.3 rC~(261)-rC~(262)的不同突变对活力的影响第44-47页
第五章 CaTERT可以调控模板RNA结构的改变第47-53页
    5.1 端粒DNA越过rC~(261)-rC~(262)后会超越端粒RNA重复序列继续延伸第47-48页
    5.2 用stop flow的方法观察径环被打开的过程第48-50页
    5.3 DNA、RNA、Ca端粒酶共同调控RNA径环结构的改变第50-53页
第六章 CaTERT是典型的逆转录酶、聚合酶、加尾酶第53-65页
    6.1 CaTERT以非端粒RNA为模板延伸DNA,是典型的逆转录酶第53-55页
    6.2 CaTERT以DNA为模板是典型的聚合酶第55-59页
        6.2.1 CaTERT端粒酶依然可以识别DNA模板中的“CC”第55-56页
        6.2.2 CaTERT端粒酶以DNA和RNA为模板活力的比较第56-59页
    6.3 CaTERT是以Mn~(2+)离子调控的加尾酶第59-65页
第七章 Capif1对端粒DNA错配碱基的剪切第65-85页
    7.1 Capif1蛋白的纯化及解旋活力验证第65-71页
        7.1.1 Pif1蛋白的表达与纯化第65-69页
        7.1.2 Capif1蛋白质解旋活力验证第69-71页
    7.2 Capif1兼具有解旋酶与核酸酶两种活力第71-74页
    7.3 Capif1为外切酶活力而不是内切酶活力第74-75页
    7.4 Capif为 3’-5’的核酸外切酶活力第75-76页
    7.5 Capif在不同条件下的核酸外切酶活力第76-78页
    7.6 Capif1对不同结构的DNA底物的外切特性第78-79页
    7.7 Capif1序列的不同区段对外切活力的影响第79-81页
    7.8 突变Capif外切活性位点第81-82页
    7.9 在同一条件下比较外切与解旋两种活力第82-83页
    7.10 8种野生型pif1的纯化与外切活力比较第83-85页
第八章 富含G的序列可以激活Pif1解下游的DNA双链第85-91页
    8.1 pif1在解旋双链DNA时会有一个等待时间第85-87页
    8.2 高浓度的pif1蛋白浓度将减少解旋等待时间第87-88页
    8.3 Fork结构的DNA底物将有利于pif1蛋白解旋第88-89页
    8.4 富含“G”的序列可以促进pif1解旋双链DNA第89-91页
第九章 讨论第91-95页
参考文献第95-103页
附录第103-118页
缩略词表第118-120页
致谢第120-121页
作者简介第121-122页

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