摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第一章 文献综述 | 第12-23页 |
1.1 端粒酶生物学特征 | 第12-14页 |
1.1.1 端粒和端粒酶的发现 | 第12-13页 |
1.1.2 端粒与端粒酶的关系 | 第13-14页 |
1.2 端粒、端粒酶的结构 | 第14-19页 |
1.2.1 端粒酶催化亚基TERT的结构 | 第14-16页 |
1.2.2 端粒酶模板RNA(TER)的结构特点 | 第16页 |
1.2.3 端粒酶TERT和TER-DNA的结合 | 第16-17页 |
1.2.4 端粒酶各亚基的功能及正负调节 | 第17-18页 |
1.2.5 端粒酶结构进展 | 第18-19页 |
1.3 端粒DNA延伸的校对研究 | 第19-20页 |
1.3.1 核酸酶研究进展 | 第19页 |
1.3.2 具有核酸酶功能的解旋酶研究进展 | 第19-20页 |
1.4 本课题的研究目的和意义 | 第20-23页 |
第二章 实验材料、方法与机理 | 第23-34页 |
2.1 实验材料 | 第23-25页 |
2.1.1 实验试剂 | 第23页 |
2.1.2 生物材料 | 第23页 |
2.1.3 生化与分子生物学试剂 | 第23-24页 |
2.1.4 常规生化实验溶液 | 第24页 |
2.1.5 配制的主要反应缓冲液(Buffer) | 第24-25页 |
2.2 实验仪器设备 | 第25-26页 |
2.3 实验方法 | 第26-31页 |
2.3.1 蛋白质的表达与纯化 | 第26-27页 |
2.3.2 质粒载体的构建 | 第27页 |
2.3.3 质粒纯化及线性化 | 第27-28页 |
2.3.4 RNA的转录及纯化 | 第28-30页 |
2.3.5 核酸底物的制备 | 第30-31页 |
2.4 实验机理 | 第31-34页 |
2.4.1 动态光散射(DLS)技术分析Ca TERT寡聚状态 | 第31-32页 |
2.4.2 蛋白-核酸的结合反应测试 | 第32-33页 |
2.4.3 快速停留技术(Stopped-Flow)观察RNA径环打开实验 | 第33-34页 |
第三章C.Albicans基本生化活性 | 第34-41页 |
3.1 CN与核酸的亲核性 | 第34-37页 |
3.2 CaTERT端粒酶的寡聚状态分析 | 第37-38页 |
3.3 C.Albicans基本生化特性 | 第38-41页 |
第四章 模板RNA序列中含有调控延伸的信号 | 第41-47页 |
4.1 端粒酶复合物可以识别rC~(261)-rC~(262)氨基酸序列作为一个调控信号 | 第41-42页 |
4.2 不同结构域的RNA对活力的影响 | 第42-44页 |
4.3 rC~(261)-rC~(262)的不同突变对活力的影响 | 第44-47页 |
第五章 CaTERT可以调控模板RNA结构的改变 | 第47-53页 |
5.1 端粒DNA越过rC~(261)-rC~(262)后会超越端粒RNA重复序列继续延伸 | 第47-48页 |
5.2 用stop flow的方法观察径环被打开的过程 | 第48-50页 |
5.3 DNA、RNA、Ca端粒酶共同调控RNA径环结构的改变 | 第50-53页 |
第六章 CaTERT是典型的逆转录酶、聚合酶、加尾酶 | 第53-65页 |
6.1 CaTERT以非端粒RNA为模板延伸DNA,是典型的逆转录酶 | 第53-55页 |
6.2 CaTERT以DNA为模板是典型的聚合酶 | 第55-59页 |
6.2.1 CaTERT端粒酶依然可以识别DNA模板中的“CC” | 第55-56页 |
6.2.2 CaTERT端粒酶以DNA和RNA为模板活力的比较 | 第56-59页 |
6.3 CaTERT是以Mn~(2+)离子调控的加尾酶 | 第59-65页 |
第七章 Capif1对端粒DNA错配碱基的剪切 | 第65-85页 |
7.1 Capif1蛋白的纯化及解旋活力验证 | 第65-71页 |
7.1.1 Pif1蛋白的表达与纯化 | 第65-69页 |
7.1.2 Capif1蛋白质解旋活力验证 | 第69-71页 |
7.2 Capif1兼具有解旋酶与核酸酶两种活力 | 第71-74页 |
7.3 Capif1为外切酶活力而不是内切酶活力 | 第74-75页 |
7.4 Capif为 3’-5’的核酸外切酶活力 | 第75-76页 |
7.5 Capif在不同条件下的核酸外切酶活力 | 第76-78页 |
7.6 Capif1对不同结构的DNA底物的外切特性 | 第78-79页 |
7.7 Capif1序列的不同区段对外切活力的影响 | 第79-81页 |
7.8 突变Capif外切活性位点 | 第81-82页 |
7.9 在同一条件下比较外切与解旋两种活力 | 第82-83页 |
7.10 8种野生型pif1的纯化与外切活力比较 | 第83-85页 |
第八章 富含G的序列可以激活Pif1解下游的DNA双链 | 第85-91页 |
8.1 pif1在解旋双链DNA时会有一个等待时间 | 第85-87页 |
8.2 高浓度的pif1蛋白浓度将减少解旋等待时间 | 第87-88页 |
8.3 Fork结构的DNA底物将有利于pif1蛋白解旋 | 第88-89页 |
8.4 富含“G”的序列可以促进pif1解旋双链DNA | 第89-91页 |
第九章 讨论 | 第91-95页 |
参考文献 | 第95-103页 |
附录 | 第103-118页 |
缩略词表 | 第118-120页 |
致谢 | 第120-121页 |
作者简介 | 第121-122页 |