| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-16页 |
| 引言 | 第16-26页 |
| 1 魁蚶生物学概述 | 第16-18页 |
| ·分类地位及地理分布 | 第16页 |
| ·形态特征 | 第16-17页 |
| ·栖息习性 | 第17页 |
| ·摄食习性 | 第17页 |
| ·运动习性 | 第17页 |
| ·敌害生物 | 第17-18页 |
| ·生殖习性 | 第18页 |
| 2 魁蚶遗传学研究进展 | 第18-21页 |
| ·染色体研究 | 第18页 |
| ·魁蚶线粒体DNA分析 | 第18-19页 |
| ·魁蚶核糖体RNA分析 | 第19页 |
| ·魁蚶微卫星DNA分析 | 第19-20页 |
| ·魁蚶功能基因研究 | 第20页 |
| ·魁蚶大数据遗传信息研究概况 | 第20-21页 |
| 3 双壳贝类高通量转录组研究概况 | 第21-22页 |
| 4 贝类的免疫防御 | 第22-24页 |
| ·细胞免疫 | 第22-23页 |
| ·体液免疫 | 第23-24页 |
| 5 选题依据和研究目的意义 | 第24-26页 |
| ·选题依据 | 第24页 |
| ·研究目的及意义 | 第24-26页 |
| 第一章 魁蚶高通量测序转录组文库的构建及分析 | 第26-45页 |
| ·材料与方法 | 第26-32页 |
| ·实验材料 | 第26页 |
| ·建库测序流程 | 第26-27页 |
| ·总RNA的提取 | 第27-28页 |
| ·总RNA检测 | 第28页 |
| ·文库构建及库检 | 第28-29页 |
| ·上机测序 | 第29页 |
| ·测序错误率分布检查 | 第29-30页 |
| ·测序数据过滤 | 第30页 |
| ·转录本拼接 | 第30-31页 |
| ·生物信息分析流程 | 第31-32页 |
| ·结果 | 第32-45页 |
| ·总RNA提取结果 | 第32-33页 |
| ·测序数据质量评估 | 第33-34页 |
| ·测序数据质量情况 | 第34-35页 |
| ·拼接转录本长度分布 | 第35-36页 |
| ·基因功能注释 | 第36-45页 |
| 第二章 魁蚶锰超氧化物歧化酶基因（Sb Mn SOD）c DNA的克隆、表达和抗菌活性研究 | 第45-82页 |
| ·材料与方法 | 第46-68页 |
| ·实验材料 | 第46-54页 |
| ·试验方法 | 第54-68页 |
| ·结果 | 第68-80页 |
| ·RNA及c DNA质量 | 第68页 |
| ·Sb Mn SOD基因全长c DNA序列分析 | 第68-70页 |
| ·Sb Mn SOD基因同源性分析 | 第70-73页 |
| ·Sb Mn SOD基因组织表达分析 | 第73-74页 |
| ·Sb Mn SOD基因在鳗弧菌感染后的表达分布 | 第74-75页 |
| ·重组蛋白Sb Mn SOD的表达、纯化和Western blot分析 | 第75-76页 |
| ·重组蛋白Sb Mn SOD的浓度测定 | 第76-77页 |
| ·重组蛋白Sb Mn SOD的抑菌活性 | 第77-78页 |
| ·温度对重组蛋白Sb Mn SOD酶活的影响 | 第78-79页 |
| ·p H对重组蛋白Sb Mn SOD酶活的影响 | 第79-80页 |
| 讨论与小结 | 第80-82页 |
| 第三章 魁蚶铁蛋白基因（Sb Fer）的克隆及表达分析 | 第82-101页 |
| ·材料与方法 | 第82-85页 |
| ·实验材料 | 第82页 |
| ·试验方法 | 第82-85页 |
| ·结果 | 第85-98页 |
| ·Sb Fer基因全长c DNA序列分析 | 第85-89页 |
| ·Sb Fer基因同源性分析 | 第89-94页 |
| ·Sb Fer基因组织表达 | 第94-95页 |
| ·Sb Fer基因在鳗弧菌感染后的表达分布 | 第95-96页 |
| ·重组蛋白Sb Fer的表达、纯化和Western blot分析 | 第96-97页 |
| ·重组蛋白Sb Fer的浓度测定 | 第97页 |
| ·重组蛋白Sb Fer的抑菌活性 | 第97-98页 |
| 讨论与小结 | 第98-101页 |
| 第四章 魁蚶热休克蛋白 90 (HSP90) 基因（Sb HSP90）的克隆及转录表达分析 | 第101-113页 |
| ·材料与方法 | 第102-103页 |
| ·实验材料 | 第102页 |
| ·试验方法 | 第102-103页 |
| ·结果 | 第103-111页 |
| ·Sb HSP90基因c DNA序列分析 | 第103-105页 |
| ·Sb HSP90基因同源性分析 | 第105-109页 |
| ·Sb HSP90基因的组织分布 | 第109-110页 |
| ·Sb HSP90在鳗弧菌感染后的表达模式 | 第110-111页 |
| 讨论与小结 | 第111-113页 |
| 第五章 魁蚶半乳糖凝集素（Sb Gal）基因c DNA的克隆及表达分析 | 第113-125页 |
| ·材料与方法 | 第114-115页 |
| ·实验材料 | 第114页 |
| ·试验方法 | 第114-115页 |
| ·结果 | 第115-123页 |
| ·Sb Gal基因c DNA序列分析 | 第115-118页 |
| ·Sb Gal基因同源性分析 | 第118-121页 |
| ·Sb Gal基因组织分布 | 第121-122页 |
| ·Sb Gal在鳗弧菌感染后的表达模式 | 第122-123页 |
| 讨论与小结 | 第123-125页 |
| 总结与展望 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-141页 |
| 缩略语表 | 第141-142页 |
| 硕士期间论文发表和获奖情况 | 第142-143页 |
| 致谢 | 第143页 |
