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抗体亲和力的体外定向进化及一种连续定向进化系统的搭建

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第一部分第12-54页
 第一章 绪论第14-28页
   ·ErbB2过表达与肿瘤发生第14-19页
     ·ErbB家族结构和功能第14-16页
     ·ErbB家族与肿瘤发生第16页
     ·ErbB2过表达与乳腺癌第16-17页
     ·ErbB2为靶标的肿瘤治疗和抗体药物开发第17-19页
   ·噬菌体展示及抗体工程化第19-23页
     ·噬菌体展示技术第19-20页
     ·抗体工程化第20-23页
   ·高通量芯片合成及高通量测序技术第23-28页
     ·高通量芯片合成概要第23-24页
     ·高通量测序技术概要第24-28页
 第二章 实验材料和方法第28-36页
   ·实验材料,仪器和试剂第28页
   ·实验方法第28-36页
     ·数据库分析和CDR多样化第28-29页
     ·寡聚核苷酸库设计和微流体芯片合成第29页
     ·构建突变体scFv库第29-32页
     ·样品准备和Illumina测序第32页
     ·序列数据分析第32页
     ·表达纯化重组抗原第32-33页
     ·噬菌体淘洗第33页
     ·噬菌体酶联免疫吸附试验第33页
     ·ScFv-Fc表达和扫描ELISA第33-34页
     ·离子表面等离子共振第34-36页
 第三章 实验结果第36-50页
   ·实验背景简介第36-37页
   ·实验结果第37-50页
     ·芯片合成寡核苷酸用于抗体库构建第37-39页
     ·高通量测序鉴定库各项参数第39-42页
     ·库筛选和靶标结合扫描第42-44页
     ·高通量测序分析筛选后序列进化第44-47页
     ·高通量测序数据用于氨基酸富集分析第47-48页
     ·高通量测序方法对候选克隆的鉴定第48页
     ·构建并筛选组合库第48-50页
 第四章 讨论及总结第50-54页
   ·讨论第50-52页
   ·总结第52-54页
第二部分第54-90页
 第一章 绪论第56-68页
   ·细菌转录装置关键元件第56-60页
     ·细菌RNA核心聚合酶第56-57页
     ·细菌sigma因子第57-59页
     ·细菌σ 70-RNAP全酶第59-60页
   ·实验室经典定向进化第60-65页
     ·定向进化中的策略和技术第60-63页
     ·定向进化中的screening和slection第63-65页
   ·噬菌体辅助连续定向进化第65-68页
 第二章 实验材料和方法第68-76页
   ·实验材料,仪器和试剂第68-69页
   ·实验方法第69-76页
     ·DNA克隆第69-70页
     ·Top10化学感受态制备第70页
     ·TG1电转感受态制备和转化第70-71页
     ·不连续侵染实验第71-72页
     ·恒化器装置组装第72页
     ·PACE实验第72页
     ·突变率检测实验第72-73页
     ·体内Sigma 70突变体活性检测第73-76页
 第三章 实验结果、讨论及总结第76-90页
   ·前期研究背景及噬菌体系统第76-77页
   ·实验结果第77-88页
     ·定向进化靶标基因的选择第77页
     ·与Sigma70无/有相互作用靶标启动子的选择第77-79页
     ·M13噬菌体修饰第79-81页
     ·辅助质粒上靶标启动子对宿主外噬菌体的影响第81-82页
     ·PACE系统进化RpoD-R588H蛋白及其报告系统第82-84页
     ·PACE系统中突变质粒促突变效率检测第84-87页
     ·PACE系统中对靶标基因体外建库第87-88页
   ·讨论第88-89页
   ·总结第89-90页
参考文献第90-110页
致谢第110-112页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第112页

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