| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1 自然界生物矿化的研究进展 | 第12-17页 |
| ·贝壳的生物矿化 | 第12-15页 |
| ·鱼耳石生物生物矿化 | 第15页 |
| ·骨的生物矿化 | 第15-16页 |
| ·牙齿的生物矿化 | 第16页 |
| ·病理结石的生物矿化 | 第16-17页 |
| 2 实时定量PCR技术的应用 | 第17-19页 |
| ·病原菌检测 | 第18页 |
| ·病毒检测 | 第18页 |
| ·检测基因突变及临床应用 | 第18-19页 |
| ·基因表达检测和流行病学中的应用 | 第19页 |
| 3. 本研究的目的与意义 | 第19-21页 |
| 第二章 马氏珠母贝外套膜的转录组测序与分析 | 第21-36页 |
| 1 材料与方法 | 第22-25页 |
| ·实验材料 | 第22-23页 |
| ·样品来源 | 第22-23页 |
| ·主要实验试剂及配制方法 | 第23页 |
| ·主要实验仪器 | 第23页 |
| ·实验方法 | 第23-25页 |
| ·RNA的提取和cDNA文库的准备 | 第23页 |
| ·焦磷酸测序 | 第23-24页 |
| ·序列加工和组装 | 第24页 |
| ·序列注释 | 第24-25页 |
| ·生物矿化相关的转录的鉴别 | 第25页 |
| ·鉴别SNPs、缺失多态性、SSR标记 | 第25页 |
| 2 结果 | 第25-34页 |
| ·454焦磷酸测序生成表达序列数据 | 第25页 |
| ·测序数据的组装 | 第25页 |
| ·基因注释 | 第25-26页 |
| ·高水平表达基因 | 第26-29页 |
| ·生物矿化相关的转录 | 第29-33页 |
| ·分子标记 | 第33-34页 |
| 3 讨论 | 第34-36页 |
| 第三章 马氏珠母贝珍珠囊转录组测序及分析 | 第36-48页 |
| 1 实验材料 | 第37-38页 |
| ·样品来源 | 第37-38页 |
| ·主要实验试剂及配制方法 | 第38页 |
| ·主要实验仪器 | 第38页 |
| 2 实验方法 | 第38-39页 |
| ·RNA提取和焦磷酸测序 | 第38页 |
| ·序列装配和注释 | 第38页 |
| ·鉴别潜在的分子标记序列 | 第38-39页 |
| ·生物矿化相关转录的鉴定 | 第39页 |
| 3 结果 | 第39-46页 |
| ·序列组装 | 第39页 |
| ·基因注释 | 第39-40页 |
| ·高表达水平基因 | 第40页 |
| ·生物矿化相关转录及其表达特性分析 | 第40页 |
| ·分子标记 | 第40-46页 |
| 4 讨论 | 第46-48页 |
| 第四章 不同家系马氏珠母贝中矿化基因的表达比较 | 第48-63页 |
| 1 材料与方法 | 第49-54页 |
| ·材料 | 第49-50页 |
| ·样品来源 | 第49页 |
| ·实验仪器设备 | 第49页 |
| ·试剂与耗材 | 第49-50页 |
| ·实验方法 | 第50-54页 |
| ·RNA提取 | 第50-51页 |
| ·RNA浓度和质量检测 | 第51页 |
| ·纯化mRNA与cDNA合成 | 第51页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第51-52页 |
| ·熔解曲线分析 | 第52-53页 |
| ·数据分析 | 第53-54页 |
| 2. 结果 | 第54-61页 |
| ·四个矿化基因表达水平与家系、发育时期和外套膜不同部位的相关性 | 第54页 |
| ·矿化基因在家系间表达水平的差异性 | 第54页 |
| ·矿化基因在马氏珠母贝外套膜不同部位表达水平的差异性 | 第54-58页 |
| ·不同取材时期矿化基因在马氏珠母贝外套膜中的表达水平差异性 | 第58页 |
| ·四个矿化基因间表达水平的相关性 | 第58-59页 |
| ·四个矿化基因表达水平与家系表型性状之间的相关性 | 第59-61页 |
| 3 讨论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-67页 |
| 在校期间科研成果 | 第67-68页 |
| 资助项目 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
