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牛分枝杆菌BCG菌株3-甲基腺嘌呤糖基化酶AAG的调控机制研究

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩略语Abbreviation第10-11页
1 前言第11-29页
   ·结核病与结核分枝杆菌第11页
   ·结核分枝杆菌与DNA损伤修复第11-13页
   ·碱基切除修复途径(BER)和糖基化酶第13-18页
   ·真核生物AAG研究概况第18-22页
     ·人AAG结构第18-19页
     ·AAG底物结合位点和催化机制第19-20页
     ·真核生物AAG的生理功能第20-22页
   ·结核分枝杆菌AAG研究概况第22页
   ·TetR类型转录因子第22-25页
     ·TetR类型转录因子的一般特征第22-24页
     ·分枝杆菌TetR类型转录因子研究概况第24-25页
   ·BCG菌株的模式地位第25-26页
   ·本研究的目的、意义、内容和技术路线第26-29页
     ·研究目的和意义第26-27页
     ·研究内容和技术路线第27-29页
2 材料与方法第29-40页
   ·材料与试剂第29-32页
     ·菌株,质粒第29页
     ·引物、酶、试剂盒第29-31页
     ·单双杂交培养基配方第31页
     ·EMSA相关试剂第31页
     ·ChIP实验相关试剂第31页
     ·其他第31-32页
   ·方法第32-40页
     ·引物设计和PCR扩增反应第32页
     ·重组质粒的构建第32页
     ·大肠杆菌质粒抽提、感受态细胞制备和转化第32-34页
     ·重组蛋白的诱导、表达和透析第34-35页
     ·抗体制备第35-36页
     ·凝胶迁移阻滞实验(EMSA)第36页
     ·细菌单杂交和双杂交第36页
     ·染色质免疫共沉淀(ChIP)第36-37页
     ·构建BCG0878c敲除菌株及Southern blot验证第37页
     ·实时定量PCR(RT-PCR)第37-38页
     ·β-半乳糖苷酶活性分析第38页
     ·Dnase Ⅰ足迹实验第38页
     ·免疫共沉淀实验(Co-IP)第38-39页
     ·表面等离子共振分析第39页
     ·DNA糖基化酶切割次黄嘌呤实验第39-40页
3 结果与分析第40-58页
   ·BCG0878c蛋白质在转录水平上调控mbaag基因表达第40-48页
     ·BCG0878c蛋白质能够识别mbaag基因的上游序列第40-41页
     ·BCG0878c在体内能够特异性地结合mbaag启动子序列第41-43页
     ·鉴定BCG0878c所识别的DNA基序第43-46页
     ·BCG0878c负调控mbaag的表达第46-48页
   ·BCG0878c通过蛋白质相互作用调控MbAAG的酶活性第48-54页
     ·BCG0878c能够与MbAAG相互作用第48-51页
     ·BCG0878c能够刺激MbAAG对损伤DNA的结合活性第51-52页
     ·BCG0878c能够刺激MbAAG对损伤DNA的切割活性第52-53页
     ·MbAAG促进BCG0878c结合启动子第53-54页
   ·MbAAG和BCG0878c的相互作用影响分枝杆菌生长第54-56页
   ·BCG0878c的表达水平以及启动子结合活性并不受亚硝酸损伤剂的影响第56-58页
4 总结与讨论第58-64页
   ·总结第58-59页
   ·讨论第59-64页
     ·MbAAG表达水平对细菌生理的影响第59-60页
     ·BCG0878c作为TetR类型转录因子的独特调控机制第60-62页
     ·研究展望第62-64页
参考文献第64-72页
硕士期间发表论文情况第72-73页
附录第73-76页
致谢第76页

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