摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
第一章 文献综述 | 第9-22页 |
1 肠道菌群的概况 | 第9-16页 |
·肠道菌群的概念 | 第9页 |
·肠道菌群的分类和分布 | 第9-11页 |
·肠道菌群的功能 | 第11-14页 |
·促进肠道发育 | 第11-12页 |
·营养功能 | 第12页 |
·免疫屏障功能 | 第12-13页 |
·其他生理功能 | 第13-14页 |
·肠道菌群结构和多样性的影响因素 | 第14-16页 |
·宿主的年龄 | 第14页 |
·宿主的饮食 | 第14-15页 |
·宿主的基因型 | 第15页 |
·其他因素 | 第15-16页 |
2 肠道菌群的研究方法 | 第16-19页 |
·传统研究方法 | 第16页 |
·现代分子生物学研究方法 | 第16-19页 |
·指纹图谱技术 | 第17页 |
·核酸探针技术 | 第17页 |
·实时荧光定量 PCR 技术 | 第17-18页 |
·16S rRNA 基因克隆文库技术 | 第18页 |
·元基因组技术 | 第18-19页 |
3 肠道菌群的研究前景 | 第19-20页 |
4 本论文的研究对象和研究内容 | 第20-22页 |
·研究对象 | 第20-21页 |
·研究内容 | 第21-22页 |
第二章 实验材料与方法 | 第22-29页 |
1 实验材料 | 第22-24页 |
·实验动物 | 第22页 |
·实验的主要仪器 | 第22页 |
·实验的主要试剂及溶液配制 | 第22-24页 |
·实验的主要试剂 | 第22-23页 |
·实验的主要溶液配制 | 第23-24页 |
·PCR 引物 | 第24页 |
·实验数据分析软件 | 第24页 |
2 实验步骤 | 第24-29页 |
·雪豹粪便样品采集与预处理 | 第24-25页 |
·粪便基因组 DNA 的提取与检测 | 第25页 |
·16S rRNA 基因的 PCR 扩增及产物纯化 | 第25-26页 |
·16S rRNA 基因克隆文库的构建 | 第26-27页 |
·目的片段与 T 载体的连接 | 第26-27页 |
·转化 | 第27页 |
·阳性克隆子的筛选和测序 | 第27页 |
·16S rDNA 系统发育分析 | 第27-28页 |
·克隆文库的统计分析 | 第28-29页 |
·覆盖度(Coverage C) | 第28页 |
·物种多样性指数 | 第28页 |
·Chao 1 物种丰富度指数(Schao1) | 第28-29页 |
第三章 实验结果与分析 | 第29-45页 |
1 雪豹粪便基因组 DNA 的提取 | 第29页 |
2 16S rRNA 基因的 PCR 扩增 | 第29-30页 |
3 16S rRNA 基因的纯化回收 | 第30页 |
4 16S rRNA 基因克隆文库构建及测序 | 第30页 |
5 对所构建文库的统计分析 | 第30-31页 |
6 代表序列的在线比对 | 第31-34页 |
7 系统发育分析及进化树的构建 | 第34-45页 |
·放线菌门(Actinobacteria) | 第36-37页 |
·拟杆菌门(Bacteroidetes) | 第37-38页 |
·厚壁菌门(Firmicutes) | 第38-41页 |
·变形菌门(Proteobacteria) | 第41-45页 |
第四章 讨论 | 第45-50页 |
第五章 小结与展望 | 第50-52页 |
1 小结 | 第50页 |
2 展望 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-62页 |
致谢 | 第62页 |