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帘蛤科贝类分子系统学研究

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
第一章 文献综述第13-44页
 1 生物系统学第14-18页
   ·生物系统学的概念及其基本原理第14页
   ·生物系统学与分类学的关系第14-16页
   ·生物系统学的研究理论第16-18页
 2 分子系统学第18-28页
   ·分子系统学的研究内容第18页
   ·分子系统学研究的基本方法及理论第18-28页
     ·种上阶元第18-22页
     ·种及其以下阶元第22-28页
 3 帘蛤科贝类概况第28-30页
   ·帘蛤科贝类的形态特征第29-30页
   ·帘蛤科贝类的生态习性第30页
   ·帘蛤科贝类的地理分布第30页
 4 帘蛤科贝类分类学研究简史第30-33页
   ·帘蛤科贝类分类系统的演化及现行分类系统第30-32页
   ·帘蛤科贝类α分类中存在的问题第32-33页
   ·中国沿海分布的帘蛤科贝类分类历史及现状第33页
 5 帘蛤科分子系统学研究概况第33-41页
   ·国际研究概况第35-38页
   ·国内研究概况第38-41页
 6 本研究的目的、内容及其意义第41-44页
第二章 帘蛤科贝类系统发生学研究第44-68页
 0 引言第44-46页
 1 材料与方法第46-59页
   ·样品的采集第46页
   ·DNA 提取、PCR 扩增和测序第46-56页
   ·序列编辑、排序和分析第56-57页
   ·模型选择和系统发生关系重建第57-59页
     ·贝叶斯法分析第57页
     ·最大简约法分析第57-59页
     ·最大似然法分析第59页
 2 结果第59-64页
   ·序列变化及其遗传多样性第59页
   ·系统发生学关系第59-64页
     ·基于全数据库的分析结果第60-64页
     ·基于其他数据库的分析结果第64页
 3 讨论第64-68页
   ·分子标记和种类的数量变化对系统发生学信号的影响第64-65页
   ·ILD 分析的有效性第65-66页
   ·帘蛤科贝类间的进化关系第66-68页
第三章 中国沿海帘蛤科分类学修订第68-76页
 0 引言第68页
 1 材料与方法第68-70页
   ·样品选取第68页
   ·形态学分析第68-70页
 2 结果与讨论第70-76页
   ·雪蛤属(Placamen)第70-71页
   ·杓拿蛤属(Anomalodiscus)第71-72页
   ·畸心蛤属(Cryptonema)第72-73页
   ·提加芒蛤属(Tigammona)第73-74页
   ·格特蛤属(Marcia)第74-75页
   ·浅蛤属(Macridiscus)第75-76页
第四章 帘蛤科贝类 DNA 条形码研究第76-123页
 0 引言第76-78页
 1 材料与方法第78-104页
   ·样品的采集第78-101页
   ·分子数据的收集第101-103页
   ·DNA 条形码分析第103-104页
 2 结果第104-115页
 3 讨论第115-122页
   ·用线粒体 COI 序列界定种的有效性第115-116页
   ·区域性 DNA 条形码研究的作用第116-119页
     ·确定鉴别性形态特征第117页
     ·为分类修订提供有用信息第117-119页
     ·揭示隐存种第119页
   ·BOLD 数据库现存的问题及其未来的应用第119-122页
 4 结论第122-123页
第五章 帘蛤科贝类隐存种现象研究第123-135页
 0 引言第123-124页
 1 材料与方法第124-129页
   ·样品的采集第124页
   ·分子数据的收集第124-128页
   ·物种多样性分析第128-129页
     ·基于遗传距离的分析第128页
     ·基于系统发生树的分析第128-129页
 2 结果第129-131页
   ·序列变化第129-130页
   ·多分子标记确定种的地位第130-131页
 3 讨论第131-134页
 4 结论第134-135页
参考文献第135-164页
致谢第164-165页
个人简历第165-166页
学术成果第166页

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