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水稻纹枯病菌遗传多样性及侵染水稻早期上调表达基因的分析

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-15页
第一章 文献综述第15-41页
 1 水稻纹枯病及其防治问题第15-17页
 2 水稻纹枯病菌群体遗传多样性研究进展第17-19页
   ·水稻纹枯病菌遗传多样性特性第17页
   ·水稻纹枯病菌遗传多样性研究第17-19页
 3 独立于染色体外的遗传因子研究进展第19-29页
   ·真菌病毒研究进展第19-25页
     ·真菌病毒核酸类型第22-23页
     ·茄丝核菌中真菌病毒的研究进展第23-25页
   ·丝状真菌质粒的研究进展第25-29页
     ·真菌质粒第25-28页
     ·茄丝核菌中真菌质粒的研究进展第28-29页
 4 基因水平转移研究进展第29-37页
   ·基因水平转移第29-34页
     ·HGT发生的范围第30-31页
     ·HGT的检测方法第31-32页
     ·基因发生HGT事件的条件第32-33页
     ·HGT对传统的生物进化系统发育树的影响第33-34页
   ·在真菌中发生HGT事件第34-36页
     ·移动DNA遗传因子发生HGT事件第34页
     ·真菌中发生HGT的证据第34-35页
     ·HGT事件对植物病原菌的影响第35-36页
   ·水稻上的两种病原真菌第36页
   ·核糖体基因(rDNA)第36-37页
 5 水稻纹枯病菌致病机理的研究进展第37-40页
   ·水稻纹枯病菌致病机理的研究第37-38页
   ·病原菌致病相关基因的研究方法第38页
   ·抑制差减杂交法在植物病理学上的应用第38-40页
 6 本研究的目的和意义第40-41页
第二章 水稻纹枯病菌遗传多样性分析第41-57页
 1 材料与方法第41-44页
   ·试验材料第41页
     ·水稻纹枯病样品收集第41页
     ·供试水稻品种第41页
   ·试验方法第41-44页
     ·水稻纹枯病菌菌株分离第41-42页
     ·水稻纹枯病菌菌丝生长速率测定第42页
     ·水稻纹枯病菌致病力测定第42页
     ·水稻纹枯病菌菌丝直径测定第42-43页
     ·水稻纹枯病菌核型观察第43页
     ·供试水稻纹枯病菌菌株的RAPD分析第43-44页
     ·供试水稻纹枯病菌菌株RAPD聚类分析第44页
 2 结果与分析第44-55页
   ·水稻纹枯病菌的分离概述第44-47页
   ·水稻纹枯病菌菌株生长速率分析第47页
   ·水稻纹枯病菌菌株致病力分析第47-48页
   ·同一田块的水稻纹枯病菌菌株部分生物学特性分析第48-49页
   ·不省份稻区的纹枯病菌菌株部分生物学特性分析第49-51页
   ·RAPD随机引物筛选结果第51-52页
   ·来自同一田块的水稻纹枯病菌遗传多样性分析第52页
   ·来自不同省份稻区的水稻纹枯病菌遗传多样性分析第52-55页
 3 结论与讨论第55-57页
   ·结论第55页
   ·讨论第55-57页
     ·水稻纹枯病菌多样性分析第55-56页
     ·水稻纹枯病菌遗传多样性丰富的原因第56-57页
第三章:水稻纹枯病菌菌株GXE4及所含独立于染色体外的3.6-KBFRAGS基本特性的分析第57-78页
 1 材料和方法第57-63页
   ·材料第57页
     ·供试真菌菌株及培养方法第57页
     ·细菌菌株及培养方法第57页
   ·试验方法第57-63页
     ·菌株GXE4生物学特性第57-58页
     ·菌株GXE4的鉴定第58-59页
     ·菌株GXE4基因组DNA电泳分析第59页
     ·菌株GXE4中3.6-kb frags的稳定性第59-61页
     ·菌株GXE4中3.6-kb frags核苷酸属性分析第61页
     ·菌株GXE4中3.6-kb frags的克隆第61-62页
     ·菌株GXE4中3.6-kb frags Southern杂交第62-63页
 2 结果与分析第63-76页
   ·菌株GXE4生物学特性第63-65页
     ·菌株GXE4菌落形成过程的观察第63-64页
     ·菌株GXE4的生物学特性分析第64-65页
     ·菌株GXE4致病力测定第65页
   ·菌株GXE4的鉴定结果第65-67页
     ·菌株GXE4核型分析第65-66页
     ·菌株GXE4菌丝融合分析第66页
     ·菌株GXE4分子鉴定第66-67页
   ·菌株GXE4基因组总DNA电泳分析第67-68页
   ·独立于染色体外的3.6-kb frags稳定性分析第68-69页
   ·原生质体再生对菌株GXE4的菌落形态及3.6-kb frags的影响第69页
   ·溴化乙啶(EB)及SDS对菌株GXE4中3.6-kb frags的影响第69-70页
   ·菌株GXE4中3.6-kb frags的特性第70-71页
   ·水稻纹枯病菌菌株GXE4中3.6-kb frags的克隆及序列分析第71-74页
   ·3.6-kb frags的Southern杂交第74-76页
 3 结论与讨论第76-78页
   ·结论第76页
   ·讨论第76-78页
     ·引起病原真菌菌株毒力衰退的因素第76-77页
     ·水稻纹枯病菌GXE4中3.6-kb frags的特性第77-78页
第四章 水稻纹枯病菌菌株RCOL-1遗传特征性分析第78-89页
 1 材料与方法第78-80页
   ·材料第78页
     ·供试菌株及培养方法第78页
     ·细菌菌株及培养方法第78页
   ·试验方法第78-80页
     ·菌株RCOL-1生物学特性第78-79页
     ·菌株RCOL-1核型观察第79页
     ·菌株RCOL-1基因组DNA的提取第79页
     ·菌株RCOL-1核糖体基因ITS区域扩增第79-80页
     ·PCR扩增产物DNA测序及序列分析第80页
     ·Southern杂交验证第80页
 2 结果与分析第80-86页
   ·菌株RCOL-1生物学特性分析第80-81页
     ·菌株的菌落形态比较分析第80-81页
     ·菌株RCOL-1扩展速度分析第81页
   ·菌株RCOL-1核型分析第81-82页
   ·菌株RCOL-1分子鉴定第82页
   ·菌株RCOL-1中核糖体基因Southern杂交第82-84页
   ·菌株RCOL.1中含有的四种类型rDNA基因ITS序列验证第84-85页
   ·菌株RCOL-1中四种类型rDNA基因ITS所占比例分析第85-86页
 3 结论与讨论第86-89页
   ·结论第86页
   ·讨论第86-89页
     ·菌株RCOL-1中出现异常核糖体基因ITS序列的可能原因第86页
     ·瓜亡革菌和角担菌间发生HGT事件的可能性第86-87页
     ·核糖体基因发生HGT事件的意义第87-89页
第五章 水稻纹枯病菌侵染水稻早期上调裹达基因的分析第89-106页
 1 材料与方法第89-92页
   ·试验材料第89页
   ·试验方法第89-92页
     ·水稻纹枯病菌的侵染观察第89-90页
     ·水稻纹枯病菌总RNA的提取与mRNA的分离第90页
     ·水稻纹枯病菌致病相关基因SSH cDNA文库的构建第90-91页
     ·SSH cDNA文库插入片段大小的检测第91页
     ·反向Northern杂交验证第91-92页
     ·测序及生物信息学分析第92页
 2 结果与分析第92-103页
   ·水稻纹枯病菌菌株WH-1侵染水稻叶片的过程第92-93页
   ·差减文库的构建第93-95页
     ·差减杂交产物的选择性PCR扩增结果第93-94页
     ·差减杂交文库中克隆插入片段的大小第94-95页
   ·反向Northern杂交筛选差异表达克隆第95页
   ·差异克隆测序及同源性分析结果第95-102页
   ·功能分类第102-103页
 3 结论与讨论第103-106页
   ·结论第103页
   ·讨论第103-106页
     ·用于文库构建的材料的选取标准第103-104页
     ·SSH筛选的致病相关基因分析第104-106页
第六章 全文总结和研究展望第106-109页
 1 全文总结第106页
 2 研究展望第106-109页
   ·水稻纹枯病菌遗传多样性研究展望第106-107页
   ·3.6-kb frags遗传特性研究展望第107页
   ·菌株RCOL-1遗传特性研究展望第107页
   ·纹枯病菌侵染水稻早期表达基因分析研究展望第107-109页
参考文献第109-129页
致谢第129-130页
附录第130-133页

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