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环渤海湾苹果产区再植障碍园与丰产园土壤细菌遗传多样性分析

中文摘要第1-11页
英文摘要第11-13页
1 前言第13-29页
   ·再植障碍研究概述第13-16页
     ·再植障碍的危害第13-14页
     ·再植障碍的研究现状第14-16页
       ·再植障碍的特征第14页
       ·再植障碍的发生机理研究现状第14-16页
     ·再植障碍的应对措施第16页
   ·细菌群落分析方法第16-22页
     ·环境基因组16S rDNA 的PCR 扩增第17-19页
     ·T-RFLP第19-20页
     ·DGGE第20-21页
     ·连载体测序第21-22页
   ·生物群落多样性的测度第22-25页
     ·α多样性的测度第22-24页
       ·物种丰富度第22-23页
       ·物种相对多度模型第23页
       ·物种多样性指数第23页
       ·物种均匀度指数第23-24页
     ·β多样性的测度第24-25页
       ·二元属性数据测度法第24页
       ·数量数据测度法第24-25页
   ·生物群落梯度分析第25-27页
     ·直接梯度分析第26页
     ·间接梯度分析第26页
     ·约束直接梯度分析第26-27页
       ·典型变量分析第26-27页
       ·典型相关分析第27页
       ·冗余分析第27页
       ·典型对应分析第27页
   ·本研究的立项依据、研究内容与技术路线第27-29页
     ·立项依据第27-28页
     ·研究内容第28页
     ·技术路线第28-29页
2 材料与方法第29-41页
   ·材料第29-31页
     ·样品的采集第29页
     ·仪器设备第29页
     ·生化试剂第29页
     ·主要溶液的配制第29-31页
       ·LB 培养基第29页
       ·PDA 培养基第29-30页
       ·根皮苷培养基第30页
       ·鉴定培养基第30页
       ·氨苄青霉素(Amp)溶液第30-31页
       ·X-Gal 贮液第31页
       ·IPTG 贮液第31页
     ·样品理化指标测定第31页
     ·PCR 引物第31页
     ·病原菌株第31页
   ·方法第31-41页
     ·样品总DNA 的提取及PCR 扩增第31-33页
       ·样品总DNA 的提取第31-32页
       ·PCR 扩增第32页
       ·PCR 扩增的反应条件第32页
       ·PCR 扩增产物的纯化第32-33页
     ·T-RFLP 分析第33页
       ·荧光PCR 产物的限制性酶切第33页
       ·酶切产物的基因扫描第33页
     ·DGGE第33-36页
       ·PCR 产物的定量第33页
       ·DGGE第33-34页
       ·连载体测序第34-36页
     ·数据分析第36-37页
       ·细菌群落多样性分析第36页
       ·去趋势对应分析(DCA)第36-37页
       ·典型对应分析(CCA)第37页
     ·苹果常见土传病害拮抗菌的筛选第37-38页
       ·含有拮抗菌的土壤样品的筛选第37页
       ·苹果常见土传病害拮抗菌的筛选第37-38页
     ·根皮苷降解菌的筛选第38-39页
       ·以根皮苷为碳源的微生物的富集第38页
       ·以根皮苷为碳源的微生物的分离及纯化第38页
       ·分光光度法筛选根皮苷高效降解菌第38页
       ·盆栽试验第38-39页
       ·165 rDNA 序列的测定第39页
     ·菌种生理生化鉴定第39-41页
       ·接触酶第39页
       ·淀粉水解第39页
       ·V-P 测定第39页
       ·吲哚第39页
       ·甲基红第39-40页
       ·葡萄糖发酵第40页
       ·乳糖发酵第40页
       ·蔗糖发酵第40页
       ·麦芽糖发酵第40页
       ·脂酶第40-41页
3 结果与分析第41-55页
   ·果园土壤理化指标分析第41-42页
     ·青县果园土壤理化指标分析第41页
     ·昌邑果园土壤理化指标分析第41-42页
     ·瓦房店果园土壤理化指标分析第42页
   ·T-RFLP 分析第42-48页
     ·T-RFLP 图谱的分析第42-45页
     ·多样性指数分析第45页
     ·T-RFLP 图谱中主要片段的定性分析第45-46页
     ·基于T-RFLP 的主成分分析第46-47页
     ·环渤海苹果产区果园土壤的细菌群落结构与环境因子之间的关系第47-48页
   ·DGGE 结果分析第48-50页
     ·青县样品DGGE 图谱与结果分析第48页
     ·昌邑样品DGGE 图谱与结果分析第48-49页
     ·瓦房店样品DGGE 图谱与结果分析第49-50页
   ·苹果常见土传病害的拮抗菌的筛选第50-51页
     ·拮抗菌X 的抗菌效果照片第50-51页
     ·拮抗菌X 的16S rDNA 序列分析第51页
   ·根皮苷降解菌的筛选第51-55页
     ·以根皮苷为碳源的微生物的筛选第51-52页
     ·根皮苷光谱第52-53页
     ·360nm 波长下根皮苷标准吸光曲线的制备第53页
     ·根皮苷降解菌的初步筛选第53-54页
     ·根皮苷降解菌pd6-3 的盆栽试验第54页
       ·砧木株高第54页
       ·根系扫描第54页
     ·16S rDNA 的测定第54-55页
4 讨论第55-57页
   ·种植方式不同的两类果园土壤中细菌群落结构的差异性第55页
   ·环渤海湾苹果产区果园土壤中的细菌群落构成第55-56页
   ·环渤海湾苹果产区果园土壤中主要菌群与环境因子的相关性研究第56页
   ·拮抗菌与降解菌的筛选第56-57页
5 结论第57-58页
   ·分子生物学方法的比较第57页
   ·环渤海湾苹果产区果园土壤细菌群落构成第57页
   ·细菌群落结构变化的相关性研究第57页
   ·拮抗菌与降解菌的筛选第57-58页
参考文献第58-66页
致谢第66页

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