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栉孔扇贝fosmid文库的构建及基因组结构特征分析

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 文献综述第13-27页
 0 引言第13页
 1 双壳类基因组研究现状第13-18页
   ·双壳类染色体研究概况第13-14页
   ·分子标记的发展和连锁图谱的构建第14-15页
   ·双壳类基因组中的重复序列第15-18页
 2 大片段基因组文库发展史第18-23页
   ·λ噬菌体文库第19页
   ·Cosmid 文库第19页
   ·Fosmid 文库第19-21页
   ·BAC 文库第21-22页
   ·YAC 文库第22页
   ·其它的大片段文库第22-23页
 3 大片段基因组文库的应用第23-25页
   ·物理作图第23页
   ·基因组测序第23-24页
   ·图位克隆第24-25页
   ·分子标记的发掘第25页
   ·染色体定位第25页
 4 本研究的目的和意义第25-27页
第二章 栉孔扇贝fosmid 基因组文库的构建和鉴定第27-47页
 第一节 栉孔扇贝fosmid 基因组文库的构建第27-39页
  0 引言第27页
  1 材料与方法第27-33页
   ·材料第27-28页
   ·试剂第28-29页
   ·仪器第29页
   ·方法第29-33页
  2 结果与分析第33-37页
   ·高质量DNA 的获得第33-34页
   ·合适DNA 片段的回收与连接第34-35页
   ·包装和转导第35-36页
   ·克隆的保存第36页
   ·超级池和二级池的构建第36-37页
  3 讨论第37-39页
   ·栉孔扇贝fosmid 文库构建技术体系的建立第37页
   ·超级池和二级池的构建第37-39页
 第二节 栉孔扇贝fosmid 基因组文库的质量鉴定第39-47页
  0 引言第39页
  1 材料与方法第39-40页
   ·栉孔扇贝基因组含量的测定第39页
   ·插入片段大小的检测第39-40页
   ·克隆的稳定性检测第40页
   ·微卫星与基因的PCR 筛选第40页
  2 结果与分析第40-44页
   ·克隆的限制性酶切分析第40-41页
   ·栉孔扇贝基因组DNA 含量的测定与文库覆盖率的估算第41-42页
   ·Fosmid 克隆的稳定性检测第42页
   ·Fosmid 文库的筛选第42-44页
  3 讨论第44-47页
   ·栉孔扇贝基因组含量的测定第44-45页
   ·Fosmid 文库的质量鉴定第45页
   ·Fosmid 文库构建的意义第45-47页
第三章 栉孔扇贝基因组的结构特征分析第47-86页
 0 引言第47页
 1 材料与方法第47页
 2 结果与分析第47-81页
   ·Fosmid 末端测序结果统计第47-48页
   ·栉孔扇贝基因组中串联重复序列的分布特征第48-66页
   ·栉孔扇贝基因组中散布重复序列的分布特征第66-67页
   ·Fosmid 末端测序的BLAST 比对结果第67-81页
 3 讨论第81-86页
   ·栉孔扇贝基因组中的卫星序列第81页
   ·栉孔扇贝基因组中微卫星序列的分布特征第81-83页
   ·栉孔扇贝基因组中小卫星序列分布特征第83-84页
   ·栉孔扇贝基因组中散布重复序列的分布特征第84-85页
   ·Fosmid 末端测序的BLAST 比对结果第85-86页
第四章 栉孔扇贝fosmid 克隆的染色体定位分析第86-104页
 0 引言第86页
 1 材料与方法第86-89页
   ·实验材料第86页
   ·主要试剂第86-87页
   ·主要仪器第87页
   ·方法第87-89页
 2 结果与分析第89-99页
   ·探针制备第89页
   ·FISH 定位结果第89-99页
 3 讨论第99-104页
   ·双壳类卫星序列的定位第99-100页
   ·利用fosmid 克隆进行栉孔扇贝染色体区分鉴定的可行性第100-101页
   ·栉孔扇贝单拷贝序列的染色体定位第101-102页
   ·栉孔扇贝 FISH 定位中尚待解决的难题第102-104页
本论文创新点第104-105页
参考文献第105-114页
学术成果第114-116页
致谢第116页

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