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水稻侧根发育基因OsCYP2(cyclophilin2)的克隆和功能分析

目录第1-10页
致谢第10-11页
缩略语表第11-12页
摘要第12-14页
Abstract第14-16页
第一章 文献综述第16-34页
 1. 引言第16-18页
 2. 拟南芥的侧根发育第18-30页
   ·侧根形成的发育过程第18-19页
   ·生长素介导的细胞周期的激活第19-20页
   ·生长素的生物合成、动态平衡和运输第20-23页
     ·生长素的生物合成和动态平衡相关突变体第20-21页
     ·生长素的运输相关突变体第21-23页
   ·侧根形成中的生长素信号转导第23-29页
     ·SCF~(TIR/AFBs)复合物蛋白降解途径第23页
     ·Anx/IAAs和ARFs:生长素介导的生长发育的转录调控因子第23-27页
     ·SLR/IAA14和ARF7/ARF19介导生长素响应的转录第27-28页
     ·侧根发育中组织特异的生长素信号转导的作用第28页
     ·其它生长素介导的侧根形成的调控因子第28-29页
   ·光信号和生长素介导的侧根形成之间的互作第29-30页
 3. 其它物种的侧根突变体第30-32页
   ·水稻的根系突变体研究第30-31页
   ·玉米侧根形成的突变体研究第31页
   ·番茄中侧根形成突变体的研究第31-32页
 4. Cyclophilins家族的研究进展第32-34页
第二章 突变体的筛选和表型分析第34-55页
 1. 材料与方法第34-39页
   ·材料第34页
   ·方法第34-39页
     ·突变体筛选第34-35页
     ·水稻生长条件第35-36页
     ·表型分析第36-38页
       ·表型观察第36页
       ·植株生长与根部参数分析第36页
       ·侧根原基形成的观察第36-37页
       ·根部向重力性反应分析第37页
       ·花药观察第37页
       ·花粉活性检测第37页
       ·全生育期性状分析第37-38页
     ·生长素相关分析第38-39页
       ·NPA抗性分析第38页
       ·NAA抗性分析第38页
       ·IAA含量的测定第38-39页
 2. 结果与分析第39-52页
   ·突变体的筛选和突变体的表型分析第39-46页
     ·突变体的筛选第39页
     ·突变体表型观察及根部参数变化第39-43页
     ·侧根原基形成的观察第43页
     ·根部向重力性反应分析第43-45页
     ·花药观察和花粉活性检测第45页
     ·全生育期性状分析第45-46页
   ·生长素相关分析第46-52页
     ·NPA抗性分析第46-49页
     ·NAA抗性分析第49-52页
     ·IAA含量测定的分析第52页
 3. 小结与讨论第52-55页
第三章 lrl1突变体基因定位第55-70页
 1. 材料与方法第55-62页
   ·材料第55页
   ·方法第55-62页
     ·F_2群体的创建第55-56页
     ·突变基因的遗传分析和F_2群体DNA的提取第56-57页
     ·突变基因的图位克隆第57-62页
       ·图位克隆的方法第57-62页
         ·SSR与STS分析方法第57-58页
         ·TILLING方法分析第58-60页
         ·dCAPS(derived cleaved amplified polymorphic sequence)分析第60-61页
         ·基因测序分析第61-62页
 2. 结果与分析第62-69页
   ·F2群体的创建和遗传分析第62-63页
   ·初步定位第63-64页
   ·准确定位第64-65页
   ·精细定位第65-67页
   ·候选基因测序分析第67-69页
 3. 小结与讨论第69-70页
第四章 lrl2与lrl3突变体等位验证第70-73页
 1. 材料与方法第70页
   ·材料第70页
   ·方法第70页
 2. 等位突变体的遗传分析与等位验证第70-72页
   ·lrl2与lrl3突变体遗传分析第70页
   ·初步定位第70-71页
   ·测序分析第71页
   ·等位突变体的凝胶电泳检测第71-72页
 3. 小结与讨论第72-73页
第五章 基因结构、表达与蛋白序列分析第73-88页
 1. 材料与方法第73-80页
   ·材料第73页
   ·方法第73-80页
     ·基因结构分析第73-76页
       ·野生型和突变体DNA和RNA的准备第74-75页
       ·逆转录第75-76页
       ·PCR反应第76页
     ·基因表达分析第76-77页
       ·实时定量RT-PCR分析OsCYP2基因在不同组织中的表达第76-77页
     ·IAA处理条件下生长素相关基因的表达分析第77-79页
       ·半定量RT-PCR检测生长素运输相关基因的表达第77-78页
       ·实时定量RT-PCR检测生长素相关基因的表达第78-79页
     ·OsCYP2蛋白序列分析第79页
     ·OsCYP2同源分析第79-80页
 2. 结果与分析第80-86页
   ·基因结构分析第80-81页
     ·基因结构第80-81页
   ·基因表达分析第81-82页
     ·OsCYP2基因的组织表达模式第81-82页
   ·IAA处理条件下生长素相关基因的表达分析第82-83页
     ·半定量RT-PCR检测生长素运输相关基因的表达第82-83页
     ·实时定量RT-PCR检测生长素相关基因的表达第83页
   ·OsCYP2蛋白序列分析第83-84页
     ·OsCYP2等位基因的蛋白序列预测第83-84页
   ·OsCYP2同源分析第84-86页
 3. 小结与讨论第86-88页
第六章 结论与展望第88-90页
 1. 结论第88-89页
 2. 展望第89-90页
参考文献第90-103页

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