| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-12页 |
| 缩略语 | 第12-13页 |
| 引言 | 第13-23页 |
| 1. 鼠疫的流行与危害 | 第13-14页 |
| 2. 鼠疫菌的病原学与致病性 | 第14-16页 |
| 3. 鼠疫菌的基因组学研究 | 第16-17页 |
| 4. 细菌基因芯片转录组学研究 | 第17-20页 |
| 5. 本研究的目的及意义 | 第20-22页 |
| 参考文献 | 第22-23页 |
| 第一部分 不同抗生素作用鼠疫菌的转录谱研究 | 第23-77页 |
| 1. 前言 | 第23-24页 |
| 2. 材料与方法 | 第24-38页 |
| ·材料 | 第24-27页 |
| ·方法 | 第27-38页 |
| ·菌株的鉴定 | 第27页 |
| ·TMH培养基制备 | 第27-30页 |
| ·鼠疫菌在 TMH培养基中的培养 | 第30页 |
| ·链霉素氯霉素四环素最小抑菌浓度的测定 | 第30-31页 |
| ·鼠疫菌全基因组 DNA芯片的制备 | 第31页 |
| ·抗生素作用鼠疫菌转录谱 | 第31-36页 |
| ·RT-PCR对链霉素作用鼠疫菌转录谱结果的验证 | 第36-37页 |
| ·三种抗生素作用鼠疫菌转录谱的聚类分析 | 第37-38页 |
| 3. 结果与讨论 | 第38-73页 |
| ·菌株的鉴定 | 第38页 |
| ·最小抑菌浓度 | 第38页 |
| ·芯片转录谱的结果 | 第38-41页 |
| ·实时定量 RT-PCR与转录谱的相关性比较 | 第41页 |
| ·抗生素作用鼠疫菌转录谱实验设计 | 第41-42页 |
| ·链霉素作用鼠疫菌转录谱分析 | 第42-48页 |
| ·氯霉素作用鼠疫菌转录谱分析 | 第48-52页 |
| ·四环素作用鼠疫菌转录谱分析 | 第52-54页 |
| ·三种抗生素作用鼠疫菌转录谱聚类分析 | 第54-73页 |
| 4. 小结 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-77页 |
| 第二部分 鼠疫菌不同生长阶段转录谱研究 | 第77-89页 |
| 1. 前言 | 第77-78页 |
| 2. 材料与方法 | 第78-79页 |
| ·实验菌株 | 第78页 |
| ·培养基的制备 | 第78页 |
| ·生长曲线的测定 | 第78页 |
| ·细菌的培养 | 第78-79页 |
| ·BHI培养基中鼠疫菌不同生长阶段 DNA芯片转录谱实验 | 第79页 |
| ·TMH培养基中鼠疫菌不同生长阶段 DNA芯片转录谱实验 | 第79页 |
| 3. 结果与讨论 | 第79-86页 |
| ·鼠疫菌的生长曲线 | 第79-80页 |
| ·实验设计 | 第80页 |
| ·BHI培养基中鼠疫菌不同生长阶段 DNA芯片转录谱分析 | 第80-85页 |
| ·TMH培养基中鼠疫菌不同生长阶段 DNA芯片转录谱分析 | 第85-86页 |
| 4. 小结 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-89页 |
| 第三部分 不同营养条件鼠疫菌的转录谱研究 | 第89-103页 |
| 1. 前言 | 第89-91页 |
| 2. 材料与方法 | 第91-92页 |
| ·实验菌株 | 第91页 |
| ·培养基的制备 | 第91页 |
| ·生长曲线的测定 | 第91页 |
| ·细菌的培养 | 第91页 |
| ·对数生长期不同营养条件鼠疫菌 DNA芯片转录谱实验 | 第91-92页 |
| ·稳定期不同营养条件鼠疫菌 DNA芯片转录谱实验 | 第92页 |
| 3. 结果与讨论 | 第92-99页 |
| ·鼠疫菌生长曲线 | 第92页 |
| ·实验设计 | 第92页 |
| ·鼠疫菌在不同营养环境中的整体应答 | 第92-99页 |
| 4. 小结 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-103页 |
| 第四部分 鼠疫菌与小鼠腹腔巨噬细胞相互作用体内转录谱的初步研究 | 第103-125页 |
| 1. 前言 | 第103-105页 |
| 2. 材料与方法 | 第105-107页 |
| ·实验材料 | 第105页 |
| ·实验方法 | 第105-107页 |
| ·感染模型的建立 | 第105-106页 |
| ·鼠疫菌 DNA芯片转录谱实验 | 第106页 |
| ·鼠疫菌体内转录谱与体外转录谱的聚类 | 第106页 |
| ·小鼠巨噬细胞芯片转录谱实验 | 第106-107页 |
| 3. 结果与讨论 | 第107-121页 |
| ·鼠疫菌与巨噬细胞作用感染菌量与时间的选择 | 第107-108页 |
| ·感染鼠疫菌与腹腔巨噬细胞的分离 | 第108-109页 |
| ·鼠疫菌与腹腔巨噬细胞相互作用鼠疫菌体内转录谱分析 | 第109-113页 |
| ·鼠疫菌体内转录谱与体外转录谱的聚类分析 | 第113-118页 |
| ·小鼠腹腔巨噬细胞转录谱的分析 | 第118-121页 |
| 4. 小结 | 第121-122页 |
| 参考文献 | 第122-125页 |
| 综述 | 第125-135页 |
| 附表 | 第135-262页 |
| 发表的论文 | 第262-263页 |
| 致谢 | 第263页 |
