| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-17页 |
| ·选题依据 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-15页 |
| ·生物数据的集成方法 | 第11-13页 |
| ·数据仓库 | 第11-12页 |
| ·联邦数据库系统 | 第12页 |
| ·MEDIATOR系统 | 第12页 |
| ·导航或超链接方式的生物数据集成 | 第12-13页 |
| ·基于本体的生物数据集成 | 第13页 |
| ·本体的管理 | 第13-14页 |
| ·生物数据的访问 | 第14-15页 |
| ·主要研究内容 | 第15-16页 |
| ·论文的主要创新点 | 第16页 |
| ·论文的组织结构 | 第16-17页 |
| 第二章 本体的基本概念及相关技术 | 第17-25页 |
| ·本体论概述 | 第17-18页 |
| ·本体表示语言 | 第18-21页 |
| ·本体表示语言的发展历程 | 第18-19页 |
| ·OWL | 第19-21页 |
| ·本体的分类 | 第21页 |
| ·本体的构建 | 第21-24页 |
| ·本体的构建原则 | 第21-22页 |
| ·本体构建的基本方式 | 第22页 |
| ·本体的构建方法 | 第22-24页 |
| ·骨架法 | 第23页 |
| ·企业建模法 | 第23-24页 |
| ·METHONTOLOGY方法 | 第24页 |
| ·其他本体构建方法 | 第24页 |
| ·本章小结 | 第24-25页 |
| 第三章 基于本体的生物信息集成系统架构 | 第25-38页 |
| ·概述 | 第25-26页 |
| ·基于本体的生物信息集成系统架构 | 第26-27页 |
| ·总体架构 | 第26-27页 |
| ·资源注册中心及信息集成系统中本体的设计 | 第27页 |
| ·基于本体的包装器的设计 | 第27-31页 |
| ·HTML 页面包装器的设计 | 第28-29页 |
| ·DB 包装器的设计 | 第29-30页 |
| ·包装器的构建原则 | 第30-31页 |
| ·基于本体的中介器的构建 | 第31-37页 |
| ·基于本体的查询重写 | 第31-35页 |
| ·查询重写的定义及研究现状 | 第31-33页 |
| ·DRSNPGRID中的查询重写 | 第33-35页 |
| ·查询策略的制定 | 第33-34页 |
| ·查询策略内数据源访问顺序的制定 | 第34-35页 |
| ·基于本体的结果集成 | 第35-37页 |
| ·查询策略内部的垂直集成 | 第36-37页 |
| ·查询策略间的水平集成 | 第37页 |
| ·小结 | 第37-38页 |
| 第四章 DRSNPGRID 中本体的管理 | 第38-55页 |
| ·资源注册中心与本体管理 | 第38-39页 |
| ·领域本体的管理 | 第39-45页 |
| ·生物本体的重用 | 第40-42页 |
| ·已有的生物本体的评估和选择 | 第40-41页 |
| ·DAG 格式的GO 向OWL 格式的转换 | 第41-42页 |
| ·DAML本体向OWL 本体的转换 | 第42页 |
| ·领域本体的手工构建 | 第42-44页 |
| ·领域本体的演化 | 第44-45页 |
| ·模式本体的构建 | 第45-52页 |
| ·数据库模式本体的构建 | 第46-49页 |
| ·以HTML 为代表的半结构化数据源模式本体的构建 | 第49-51页 |
| ·模式本体构建的一般规则 | 第51-52页 |
| ·映射本体——模式本体与领域本体间的语义映射 | 第52-54页 |
| ·数据源的修改与模式本体和映射本体的维护 | 第54页 |
| ·小结 | 第54-55页 |
| 第五章 基于本体的语义查询的实现 | 第55-65页 |
| ·语义查询模型及语义查询层次 | 第55-56页 |
| ·客户端查询语义的确定 | 第56-57页 |
| ·查询的重写 | 第57-60页 |
| ·查询策略的生成 | 第57-58页 |
| ·查询策略内数据源访问顺序的制定 | 第58-60页 |
| ·数据源的访问和查询策略内结果本体的垂直集成 | 第60-63页 |
| ·以关系数据库为代表的结构化数据源的访问 | 第60-61页 |
| ·以HTML 页面为代表的半结构化数据源的访问 | 第61-62页 |
| ·查询策略内结果本体的垂直集成 | 第62-63页 |
| ·多个查询策略结果的水平集成及最终结果的显示 | 第63页 |
| ·查询的优化 | 第63-64页 |
| ·查询结果的标注 | 第64页 |
| ·小结 | 第64-65页 |
| 第六章 总结与展望 | 第65-66页 |
| ·论文总结 | 第65页 |
| ·未来工作展望 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 附录 | 第72页 |
| 附录一 参与的科研项目 | 第72页 |
| 附录二 攻读硕士期间发表的论文及录用情况 | 第72页 |