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胃癌相关基因的筛选及其功能预测

中文摘要第1-3页
英文摘要第3-7页
1 引言第7-16页
   ·胃癌的发病进程第7-10页
     ·慢性胃炎第7-8页
     ·慢性萎缩性胃炎第8-9页
     ·肠化生第9页
     ·胃上皮异型增生第9-10页
   ·胃癌的分子生物学第10-15页
     ·基因组不稳定性第10-11页
     ·癌基因第11-12页
     ·抑癌基因第12-13页
     ·基因表达水平的变化第13-14页
     ·肿瘤转移相关基因第14-15页
   ·本研究的理论分析第15-16页
2 材料与方法第16-25页
   ·材料第16-17页
   ·实验方法第17-25页
     ·总RNA抽提(TRIzol)第17-18页
     ·总RNA质量检测(Lab on chip检测)第18-19页
     ·总RNA的纯化(QIAGEN RNeasy(Mini Kit)第19页
     ·cDNA第一链和第二链一步法合成第19-20页
     ·荧光标记cRNA合成第20-21页
     ·cRNA纯化(QIAGEN RNeasy( Mini Kit)第21页
     ·cRNA浓度测定第21页
     ·cRNA探针后标记第21页
     ·cRNA探针纯化(QIAGEN RNeasy(Mini Kit)第21-22页
     ·探针浓度及插入率计算第22页
     ·芯片杂交第22-23页
     ·芯片洗涤第23页
     ·Real Time RT-PCR验证第23-25页
3 数据处理第25-28页
   ·获取原始数据第25页
   ·Cy3(Cy5)原始值的检验第25页
   ·计算每个芯片的检出率第25页
   ·片内标准化第25-26页
   ·片间标准化第26页
   ·计算剩余基因的上(下)调数目第26页
   ·计算所有芯片的同一点的变异系数(CV值)第26页
   ·Real Time RT-PCR数据的处理第26-28页
4 结果第28-36页
5 讨论第36-43页
   ·上调基因第36-40页
     ·STEAP1第36-37页
     ·AURKA和CENPF第37-39页
     ·SFRP2和β-catenin第39-40页
   ·下调基因第40-43页
     ·DUSP1第40-41页
     ·POU6F2第41-43页
参考文献第43-49页
附图第49-54页
致谢第54页

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