| 目录 | 第1-8页 |
| 序言 | 第8-10页 |
| 第一章 计算化学简介 | 第10-27页 |
| 1．1 计算化学概述 | 第10-11页 |
| 1．2 量子化学 | 第11-20页 |
| 1．2．1 从头算方法(Ab initio) | 第11-14页 |
| 1．2．2 半经验方法(Semi-empirical) | 第14-15页 |
| 1．2．3 密度泛函方法(Density Functional Theory) | 第15-17页 |
| 1．2．4 基组 | 第17-20页 |
| 1．3 分子力学 | 第20-26页 |
| 1．3．1 力场的分类 | 第22-24页 |
| 1．3．2 力场参数的拟合 | 第24-26页 |
| [参考文献] | 第26-27页 |
| 第二章 白藜芦醇、袖皮素和洋芹素的结构与性质的理论研究 | 第27-44页 |
| 2．1 引言 | 第27-28页 |
| 2．2 白藜芦醇的结构与活性的关系 | 第28-36页 |
| 2．2．1 研究思路和相关概念 | 第28-29页 |
| 2．2．2 软件，方法与基组的选择 | 第29-30页 |
| 2．2．3 计算细节 | 第30页 |
| 2．2．4 结果与讨论 | 第30-36页 |
| 2．2．4．1 顺式与反式白藜芦醇的结构 | 第30-32页 |
| 2．2．4．2 顺式与反式白藜芦醇的结构与活性的关系 | 第32-36页 |
| 2．2．4．3 C_α=C_β双键在消除自由基功效中的重要作用 | 第36页 |
| 2．3 抽皮素与洋芹素的结构及活性的关系 | 第36-42页 |
| 2．3．1 研究思路和相关概念 | 第37页 |
| 2．3．2 软件，方法与基组的选择 | 第37页 |
| 2．3．3 计算细节 | 第37-38页 |
| 2．3．4 结果与讨论 | 第38-42页 |
| 2．3．4．1 a键、e键抽皮素和洋芹素的稳定构象 | 第38-39页 |
| 2．3．4．2 抽皮素和洋芹素的自由基比较 | 第39-42页 |
| [参考文献] | 第42-44页 |
| 第三章 密度泛函理论研究分子识别膜的作用机理 | 第44-63页 |
| 3．1 引言 | 第44-46页 |
| 3．1．1 分子识别膜简介 | 第44-45页 |
| 3．1．2 量化研究小分子间相互作用 | 第45-46页 |
| 3．2 研究思路与相关概念简介 | 第46-47页 |
| 3．3 尿嘧啶与它的分子识别膜之间的作用机理研究 | 第47-55页 |
| 3．3．1 软硬件，方法与基组的选择 | 第47页 |
| 3．3．2 建模 | 第47-48页 |
| 3．3．3 计算细节 | 第48-49页 |
| 3．3．4 计算结果与讨论 | 第49-55页 |
| 3．3．4．1 丙烷腈，甲基丙酸和尿嘧啶分子单体的结构 | 第49-50页 |
| 3．3．4．2 四个复合物的几何结构和结合能 | 第50-52页 |
| 3．3．4．3 单体与复合物中电荷转移 | 第52-53页 |
| 3．3．4．4 分子单体与复合物的振动分析 | 第53-55页 |
| 3．3．5 结论 | 第55页 |
| 3．4 茶碱与它的分子识别膜之间的作用机理研究 | 第55-61页 |
| 3．4．1 建模 | 第55-56页 |
| 3．4．2 计算细节 | 第56页 |
| 3．4．3 结果与讨论 | 第56-59页 |
| 3．4．3．1 茶碱分子与3个复合物的结构 | 第56-58页 |
| 3．4．3．2 电荷转移与振动分析 | 第58-59页 |
| 3．4．4 结论 | 第59-61页 |
| [参考文献] | 第61-63页 |
| 第四章 有机小分子与蛋白质大分子间相互作用的理论研究 | 第63-80页 |
| 4．1 引言 | 第63-65页 |
| 4．2 表皮生长因子受体(EGFR)与其抑制剂的相互作用研究 | 第65-73页 |
| 4．2．1 简介 | 第65-66页 |
| 4．2．2 研究思路与相关概念简介 | 第66页 |
| 4．2．3 具体的计算方法 | 第66-67页 |
| 4．2．4 结果与分析 | 第67-72页 |
| 4．2．4．1 配体小分子的构象搜索 | 第67-68页 |
| 4．2．4．2 分子对接结果分析 | 第68-72页 |
| 4．2．5 结论 | 第72-73页 |
| 4．3 α-糖苷酶(AGLA)与糖苷酶抑制剂相互作用机理的研究 | 第73-78页 |
| 4．3．1 简介 | 第73页 |
| 4．3．2 研究思路和概念 | 第73页 |
| 4．2．3 具体的计算方法 | 第73-74页 |
| 4．3．3 结果与分析 | 第74-77页 |
| 4．3．3．1 蛋白质与配体麦芽糖小分子结合位点结构的分析 | 第74-75页 |
| 4．3．3．2 蛋白质与抑制剂氨基糖的结合位点结构的分析 | 第75-77页 |
| 4．3．4 结论 | 第77-78页 |
| [参考文献] | 第78-80页 |
| 第五章 结论 | 第80-82页 |
| 附录Ⅰ | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83页 |
