基于进化神经网络的真核生物基因启动子位点确定模型的建立
中文摘要 | 第1-5页 |
英文摘要 | 第5-8页 |
1 绪论 | 第8-12页 |
1.1 本课题研究背景 | 第8页 |
1.2 国内外的研究现状 | 第8-10页 |
1.3 遗传算法和人工神经网络简介 | 第10-11页 |
1.3.1 遗传算法简介 | 第10页 |
1.3.2 人工神经网络简介 | 第10-11页 |
1.4 本论文的工作 | 第11-12页 |
2 人工神经网络概述 | 第12-22页 |
2.1 生物神经网络 | 第12-13页 |
2.2 人工神经网络基础 | 第13-14页 |
2.3 BP神经网络的算法描述 | 第14-18页 |
2.3.1 BP神经网络的结构 | 第14页 |
2.3.2 BP神经网络的学习算法 | 第14-18页 |
2.4 BP神经网络的设计 | 第18-20页 |
2.4.1 BP神经网络的层数 | 第19页 |
2.4.2 隐含层神经元的数目 | 第19页 |
2.4.3 初始连接权值的选取 | 第19页 |
2.4.4 学习速率的选取 | 第19-20页 |
2.4.5 期望误差的设置 | 第20页 |
2.5 BP神经网络的限制和不足 | 第20-22页 |
3 遗传算法概述 | 第22-33页 |
3.1 遗传算法的生物学背景 | 第22页 |
3.2 遗传算法的结构 | 第22-23页 |
3.3 遗传算法的基本特征 | 第23-24页 |
3.4 遗传算法的编码和解码 | 第24-27页 |
3.5 遗传算法模型的理论研究 | 第27-31页 |
3.5.1 广义遗传算法和传统遗传算法 | 第27-28页 |
3.5.2 遗传算法的数学理论 | 第28-31页 |
3.6 遗传算法模型现存的问题和发展方向 | 第31-33页 |
4 基于神经网络和遗传算法的结合算法研究 | 第33-47页 |
4.1 人工神经网络和遗传算法的相容性 | 第33-34页 |
4.1.1 遗传算法在神经网络中的应用 | 第33-34页 |
4.1.2 神经网络在遗传算法中的应用 | 第34页 |
4.2 神经网络和遗传算法的结合方式 | 第34-35页 |
4.3 已有的神经网络和遗传算法的结合算法 | 第35-37页 |
4.3.1 融合结合算法 | 第35-36页 |
4.3.2 GA_BP算法 | 第36页 |
4.3.3 BP_GA算法 | 第36-37页 |
4.4 结合算法与BP神经网络算法和遗传算法对比 | 第37-38页 |
4.5 新结合算法的理论改进和突破 | 第38-40页 |
4.6 几类新方法实现结合算法 | 第40-47页 |
5 真核生物启动子进化网络模型的实现 | 第47-63页 |
5.1 真核生物启动子的保守序列 | 第47-48页 |
5.2 碱基序列的编码方案 | 第48-52页 |
5.3 进化神经网络模型 | 第52-56页 |
5.3.1 进化神经网络的网络结构 | 第52页 |
5.3.2 遗传算法中选择算子的设定 | 第52-53页 |
5.3.3 遗传算法中交叉算子的设定 | 第53-54页 |
5.3.4 遗传算法中变异算子的设定 | 第54页 |
5.3.5 遗传算法参数的选择 | 第54-55页 |
5.3.6 进化神经网络模型的设计 | 第55-56页 |
5.4 进化神经网络模型的建立 | 第56-57页 |
5.5 进化神经网络模型的仿真和预测 | 第57-63页 |
5.5.1 进化神经网络模型的仿真程序设计 | 第57页 |
5.5.2 利用进化神经网络模型进行预测 | 第57-61页 |
5.5.3 讨论 | 第61-63页 |
6 结论与展望 | 第63-65页 |
6.1 结论 | 第63页 |
6.2 对未来工作的展望 | 第63-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-67页 |