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DNA序列相关性结构研究综述及人类基因组序列相关性分析

1. 引言第1-8页
2. DNA序列的相关性结构第8-27页
 2.1 相关性的直接度量第8-10页
  2.1.1 从一个序列获得样本数据第8页
  2.1.2 不同碱基对对相关性的贡献大小第8-9页
  2.1.3 所有相关函数的平均第9-10页
 2.2 有限长序列的相关性估计第10-11页
  2.2.1 频率估计量第10页
  2.2.2 间接贝叶斯估计第10-11页
  2.2.3 直接贝叶斯估计第11页
 2.3 谱分析第11-13页
 2.4 DNA步(DNA Walk)第13-18页
 2.5 DNA序列的大尺度波动分析第18-25页
 2.6 相关性分析的一些结论第25-27页
3. DNA序列中的异质性和复杂性第27-30页
 3.1 分割算法第27-29页
 3.2 方法的扩展第29页
 3.3 递归分割及观测到的DNA序列中的复杂性第29-30页
 3.4 DNA序列复杂性的度量第30页
4. 长程相关性的可能的起源第30-36页
 4.1 插入—删除模型第31-32页
 4.2 变异—复制模型(扩充—修改系统)第32-36页
5. 结论第36-37页
致谢第37-38页
参考文献第38-41页
附录A: 分形集,分形维数,分形函数的自相关第41-44页
附录B: 布朗运动和分数布朗运动第44-46页
附录C: 临界点附近的涨落和相关性第46-47页

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