DNA序列相关性结构研究综述及人类基因组序列相关性分析
1. 引言 | 第1-8页 |
2. DNA序列的相关性结构 | 第8-27页 |
2.1 相关性的直接度量 | 第8-10页 |
2.1.1 从一个序列获得样本数据 | 第8页 |
2.1.2 不同碱基对对相关性的贡献大小 | 第8-9页 |
2.1.3 所有相关函数的平均 | 第9-10页 |
2.2 有限长序列的相关性估计 | 第10-11页 |
2.2.1 频率估计量 | 第10页 |
2.2.2 间接贝叶斯估计 | 第10-11页 |
2.2.3 直接贝叶斯估计 | 第11页 |
2.3 谱分析 | 第11-13页 |
2.4 DNA步(DNA Walk) | 第13-18页 |
2.5 DNA序列的大尺度波动分析 | 第18-25页 |
2.6 相关性分析的一些结论 | 第25-27页 |
3. DNA序列中的异质性和复杂性 | 第27-30页 |
3.1 分割算法 | 第27-29页 |
3.2 方法的扩展 | 第29页 |
3.3 递归分割及观测到的DNA序列中的复杂性 | 第29-30页 |
3.4 DNA序列复杂性的度量 | 第30页 |
4. 长程相关性的可能的起源 | 第30-36页 |
4.1 插入—删除模型 | 第31-32页 |
4.2 变异—复制模型(扩充—修改系统) | 第32-36页 |
5. 结论 | 第36-37页 |
致谢 | 第37-38页 |
参考文献 | 第38-41页 |
附录A: 分形集,分形维数,分形函数的自相关 | 第41-44页 |
附录B: 布朗运动和分数布朗运动 | 第44-46页 |
附录C: 临界点附近的涨落和相关性 | 第46-47页 |