摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-7页 |
前言 | 第7-8页 |
第一章 文献综述 | 第8-25页 |
·药物研发的历史与现状 | 第8-9页 |
·计算机辅助药物分子设计 | 第9-13页 |
·概述 | 第9-10页 |
·计算机辅助药物设计方法的分类 | 第10-13页 |
·计算机辅助药物设计所涉及到的相关技术 | 第13-20页 |
·构象分析方法 | 第13-14页 |
·分子对接方法 | 第14-18页 |
·CoMFA 定量构效关系方法 | 第18-19页 |
·CoMSIA 定量构效关系方法 | 第19-20页 |
·抗肿瘤药物Discodermolide | 第20-23页 |
·Discodermolide 的简介 | 第20页 |
·Discodermolide 的抗癌机制及药理活性 | 第20-21页 |
·Discodermolide 与微管蛋白之间相互作用的研究状况 | 第21-23页 |
·抗肿瘤药物Dictyostatin | 第23-24页 |
·Dictyostatin 的简介 | 第23页 |
·Dictyostatin 的抗癌机制 | 第23-24页 |
·Dictyostatin 的研究现状 | 第24页 |
·本课题研究内容及选题意义 | 第24-25页 |
第二章 Discodermolide 及其衍生物的三维定量构效关系的研究 | 第25-55页 |
·实验材料 | 第25-29页 |
·计算平台 | 第29-30页 |
·硬件平台 | 第29页 |
·软件平台 | 第29-30页 |
·CoMFA 和CoMSIA 实验建立过程 | 第30-48页 |
·受体蛋白晶体结构的采集及discodermolide 衍生物的构建 | 第31页 |
·Discodermolide 及其衍生物分子生物活性数据的采集 | 第31页 |
·化合物分子构型的优化 | 第31-34页 |
·活性构象的确定 | 第34-36页 |
·分子叠合 | 第36-38页 |
·CoMFA QSAR 的建立和PLS 数理统计分析 | 第38-45页 |
·CoMSIA QSAR 的建立和PLS 数理统计分析 | 第45-48页 |
·QSAR 模型的验证 | 第48-50页 |
·讨论与分析 | 第50-54页 |
·CoMFA 模型 | 第50页 |
·CoMFA 系数等势图 | 第50-52页 |
·CoMSIA 模型 | 第52页 |
·CoMSIA 系数等势图 | 第52-54页 |
·小结 | 第54-55页 |
第三章 Dictyostatin 的分子对接及分子动力学研究 | 第55-67页 |
·实验材料 | 第55页 |
·计算平台 | 第55-56页 |
·硬件平台 | 第55页 |
·软件平台 | 第55-56页 |
·分子对接 | 第56-57页 |
·受体蛋白的准备 | 第56页 |
·配体的准备 | 第56页 |
·对接 | 第56-57页 |
·对接结果筛选 | 第57页 |
·动力学模拟 | 第57-61页 |
·初始化模型的预处理 | 第57-58页 |
·分子动力学模拟 | 第58-61页 |
·讨论与分析 | 第61-66页 |
·Dictyostatin 和微管蛋白复合物结构的合理性 | 第61-63页 |
·Dictyostatin 具体作用机制的研究 | 第63-66页 |
·小结 | 第66-67页 |
第四章结论与展望 | 第67-69页 |
·结论 | 第67页 |
·展望 | 第67-69页 |
参考文献 | 第69-76页 |
发表论文和参加科研情况说明 | 第76-77页 |
附录 | 第77-81页 |
致谢 | 第81页 |