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Apn、MDH和IGF-Ⅰ基因对京海黄鸡重要经济性状的遗传效应研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-13页
第一章 文献综述第13-44页
 1. 鸡分子遗传标记第13-28页
   ·SSR第14-17页
     ·SSR的基本概念及特征第14-15页
     ·SSR的分布和组成第15-16页
     ·SSR的检测技术第16-17页
   ·SNP第17-28页
     ·SNP的基本概念和特点第17-18页
     ·SNP的检测技术第18-28页
       ·酶或PCR为基础的检测方法第18-21页
       ·以杂交为基础的SNP检测方法第21-25页
       ·以构象为基础的方法第25-28页
 2. 鸡脂肪沉积的研究概况第28-29页
   ·鸡体脂的沉积原理第28页
   ·鸡体脂的定位情况第28-29页
   ·影响脂肪沉积的基因第29页
 3. MDH研究进展第29-33页
   ·MDH概述第29-30页
   ·MDH结构第30-31页
   ·MDH功能第31-32页
   ·MDH表达第32页
   ·MDH基因与动物代谢第32-33页
 4. Apn的研究进展第33-38页
   ·Apn的结构第33-35页
   ·Apn对糖、脂代谢的调控作用第35-37页
   ·Apn的生物学作用第37页
   ·Apn在动物上的研究进展第37-38页
 5. IGF-Ⅰ的研究进展第38-42页
   ·IGF-Ⅰ的结构第38-39页
   ·IGF-Ⅰ的生物学作用第39-41页
     ·IGF-Ⅰ与生长发育第39-40页
     ·IGF-Ⅰ与蛋白代谢第40页
     ·IGF-Ⅰ与脂代谢第40-41页
     ·IGF-Ⅰ与矿物质代谢第41页
     ·IGF-Ⅰ与繁殖第41页
   ·IGF-Ⅰ基因与生产性状相关的多态性研究第41-42页
 6. 京海黄鸡第42-43页
 7. 研究的目的和意义第43-44页
第二章 材料和方法第44-54页
 1 材料第44-47页
   ·试验动物及样本的收集第44页
   ·主要仪器和试剂第44-47页
 2 实验方法第47-54页
   ·屠宰性能测定第47-48页
   ·肉质测定第48页
   ·基因组DNA的提取与检测第48-49页
   ·统计分析及引物设计软件第49页
   ·PCR-SSCP检测第49-52页
     ·引物设计第49-50页
     ·引物的合成与稀释第50-51页
     ·最佳PCR反应条件和反应体系的建立第51页
     ·扩增产物SSCP检测第51-52页
     ·扩增产物RFLP检测第52页
     ·产物测序第52页
   ·数据分析第52-54页
     ·等位基因频率和基因型频率第52页
     ·卡方适合性检验第52页
     ·遗传多态性分析第52-53页
     ·统计分析模型与软件第53页
     ·基因型对性状贡献率与基因主效应指数第53-54页
第三章 结果和分析第54-114页
 1. 基因组DNA提取结果第54页
 2. 京海黄鸡Apn基因序列遗传效应分析第54-90页
   ·Apn基因序列遗传多态性分析第54-63页
     ·Apn基因不同引物的扩增结果第54-55页
     ·Apn基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定第55-56页
     ·京海黄鸡Apn基因遗传变异与PCR-SSCP多态性检测结果第56-60页
     ·京海黄鸡Apn基因氨基酸序列分析第60-62页
     ·京海黄鸡Apn基因群体遗传学分析第62-63页
   ·Apn基因PCR-SSCP多态性与经济性状的关联分析第63-78页
     ·Apn基因AD2座位不同基因型与经济性状的关联分析第63-67页
     ·Apn基因AD5座位不同基因型与经济性状的关联分析第67-71页
     ·Apn基因AD6座位不同基因型与经济性状的关联分析第71-74页
     ·Apn基因AD7座位不同基因型与经济性状的关联分析第74-78页
   ·京海黄鸡Apn基因SNP不同基因型对经济性状的贡献率分析第78-87页
     ·京海黄鸡Apn基因SNP不同基因型对生长性状的贡献率第78页
     ·京海黄鸡Apn基因SNP不同基因型对繁殖性状的贡献率第78-79页
     ·京海黄鸡Apn基因不同基因型对屠宰性状的贡献率第79-85页
     ·京海黄鸡Apn基因不同基因型对肉质性状的贡献率第85-87页
   ·京海黄鸡Apn基因不同基因座对经济性状的主效应指数分析第87-90页
 3. 京海黄鸡MD基因序列遗传效应分析第90-100页
   ·MD基因序列遗传多态性分析第90-92页
     ·MDH基因不同引物的扩增结果第90-91页
     ·MDH基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定第91页
     ·京海黄鸡MDH基因遗传变异与PCR-RFLP多态性检测结果第91-92页
     ·京海黄鸡MDH基因群体遗传变异分析第92页
   ·MDH基因PCR-RFLP多态性与经济性状的关联分析第92-96页
     ·MDH基因不同基因型与生长性状的关联分析第92-93页
     ·MDH基因不同基因型与繁殖性状的关联分析第93页
     ·MDH基因不同基因型与屠宰和肉质性状的关联分析第93-96页
   ·MDH基因不同基因型对经济性状的贡献度和主效应指数分析第96-100页
     ·京海黄鸡MDH基因不同基因型对经济性状的贡献度第96-98页
     ·京海黄鸡MDH基因对经济性状的主效应指数分析第98-100页
 4. 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因序列遗传效应分析第100-109页
   ·IGF-Ⅰ基因序列遗传多态性分析第100-102页
     ·IGF-Ⅰ基因不同引物的扩增结果第100页
     ·IGF-Ⅰ基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定第100-101页
     ·京海黄鸡IGF-Ⅰ基因遗传变异与PCR-SSCP多态性检测结果第101页
     ·京海黄鸡IGF-Ⅰ基因群体遗传学分析第101-102页
   ·IGF-Ⅰ基因PCR-SSCP多态性与经济性状的关联分析第102-105页
   ·京海黄鸡IGF-Ⅰ基因基因不同基因型对经济性状的贡献度和主效应指数分析第105-109页
     ·京海黄鸡IGF-Ⅰ基因不同基因型对经济性状的贡献度第105-107页
     ·京海黄鸡IGF-Ⅰ基因不同基因型对经济性状的主效应指数分析第107-109页
 5. 京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对经济性状的互作效应第109-114页
   ·京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对生长性状的互作效应第109-110页
   ·京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对繁殖性状的互作效应第110-111页
   ·京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对屠宰性状的互作效应第111-113页
   ·京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对肉质性状的互作效应第113-114页
第四章 讨论第114-128页
 1. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因多态性第114-115页
   ·PCR-SSCP用于Apn基因和IGF-Ⅰ基因多态性第114页
   ·PCR-RFLP用于MDH基因多态性检测第114-115页
   ·SNP第115页
 2. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因群体遗传分析第115-116页
 3. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因多态性与经济性状的关联第116-123页
   ·京海黄鸡Apn基因多态性与经济性状的关联第116-120页
     ·京海黄鸡Apn基因多态性与生长性状的关联分析第117页
     ·京海黄鸡Apn基因多态性与繁殖性状的关联分析第117-119页
     ·京海黄鸡Apn基因多态性与屠宰性状的关联分析第119-120页
   ·京海黄鸡MDH基因多态性与经济性状的关联第120-122页
   ·京海黄鸡IGF-Ⅰ基因多态性与经济性状的关联第122-123页
 4. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因贡献率第123-125页
   ·京海黄鸡Apn基因贡献率第123-125页
   ·京海黄鸡MDH基因贡献率第125页
 5. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因对经济性状主效应指数第125-126页
   ·京海黄鸡Apn基因对经济性状的主效应指数第125-126页
   ·京海黄鸡MDH基因对经济性状的主效应指数第126页
   ·京海黄鸡IGF-Ⅰ基因对经济性状的主效应指数第126页
 6. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因对经济性状的互作效应第126-128页
第五章 结论第128-130页
参考文献第130-143页
附录第143-144页
致谢第144-145页
攻读学位期间发表的论文第145-146页

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