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大白菜PHK1基因的分离和序列分析

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
第一章 引言第9-15页
   ·双组分信号系统概述第9-11页
     ·双组分信号系统的特征第10页
     ·高等植物的双组分信号系统第10-11页
   ·蛋白激酶研究概述第11-12页
   ·细胞分裂素信号通路第12页
   ·拟南芥AHK1 蛋白第12-13页
   ·生物信息学分析第13页
   ·实验目的和意义第13-15页
     ·PHK1 基因的分离第14页
     ·PHK1 基因的序列分析第14-15页
第二章 实验材料和方法第15-25页
   ·实验材料第15页
   ·实验仪器与试剂第15-16页
     ·实验仪器第15页
     ·实验试剂和药品第15-16页
     ·引物第16页
   ·实验方法第16-25页
     ·大白菜AB-81 植株的培养第16页
     ·CTAB 法提取大白菜基因组DNA第16页
     ·反向PCR 反应第16-18页
     ·PCR 产物的回收第18页
     ·连接反应第18页
     ·转化反应第18-20页
     ·测序第20-21页
     ·染色体步移实验第21页
     ·Trizol 法提取大白菜总RNA第21-22页
     ·RT-PCR 反应第22-23页
     ·3’RACE 反应第23页
     ·利用生物信息学方法对PHK1 基因及氨基酸序列的分析第23-25页
第三章 PHK1 基因DNA 和cDNA 的分离第25-31页
   ·PHK1 基因DNA 序列的分离第25-28页
     ·反向PCR 扩增 PHK1 基因2513 bp 片段第25页
     ·常规PCR 扩增 PHK1 基因的2707 bp 片段第25-27页
     ·用染色体步移技术获得PHK1 基因2707 bp 的3’端侧翼未知序列第27页
     ·PHK1 基因7598 bp 片段的获得第27-28页
   ·PHK1 基因的部分cDNA 序列的分离第28-30页
     ·大白菜总RNA 的提取第28页
     ·PHK1 基因cDNA 序列2009 bp 片段的获得第28-29页
     ·3’RACE 扩增PHK1 基因cDNA 的3’末端序列第29-30页
     ·PHK1 基因cDNA 序列2848 bp 片段的获得第30页
   ·常规 PCR 验证 2513 bp 片段第30-31页
第四章 生物信息学分析第31-38页
   ·大白菜PHK1 基因的DNA 序列分析第31-32页
   ·PHK1 基因的cDNA 序列分析第32-38页
     ·拟南芥AHK1 的保守结构域分析第32页
     ·大白菜PHK1 氨基酸序列的保守结构域分析第32-33页
     ·大白菜PHK1 保守结构域的三级结构预测分析第33-34页
     ·进化树分析第34-37页
     ·大白菜PHK1 基因和拟南芥AHK1 基因的3’UTR 区比较第37-38页
第五章 讨论第38-42页
   ·基因序列获得方法的比较第38-40页
     ·反向PCR第38页
     ·常规PCR第38页
     ·染色体步移技术第38-39页
     ·cDNA 序列的获得第39-40页
     ·小结第40页
   ·生物信息学分析第40-42页
     ·编码序列的生物信息学分析第40-41页
     ·小结第41-42页
第六章 结论第42-43页
参考文献第43-46页
缩略语表第46-47页
致谢第47页

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