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副溶血性弧菌传播特征、O3:K6流行克隆分子生物学特性及多位点序列种群遗传研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-11页
目录第11-14页
符号说明第14-16页
综述一 副溶血性弧菌03:K6流行克隆全球流行状况第16-36页
 1 副溶血性弧菌03:K6大流行株起源及03:K6克隆形成第18-20页
 2 03:K6大流行株鉴定标准及不同血清型大流行株形成克隆能力第20-22页
 3 副溶血性弧菌大流行株的全球传播第22-23页
 4 03:K6流行克隆株和非流行克隆株之间生物特性及基因序列差异第23-24页
 5 副溶血性弧菌的生态学和流行病学第24-26页
 参考文献第26-36页
综述二 03:K6克隆毒力(岛)基因、遗传特征研究第36-58页
 1 副溶血性弧菌Ⅲ型分泌系统(T3SSs)第36-38页
 2 副溶血性弧菌毒力岛与不同致病性弧菌毒力岛间的关系第38-49页
   ·副溶血性弧菌基因与其它致病性弧菌基因组比较第38-41页
   ·副溶血性弧菌AQ3810与RIMD2210633基因组序列比较第41-42页
   ·高致病性副溶血性弧菌毒力岛第42-43页
   ·副溶血性弧菌毒力岛基因与其它致病性弧菌基因组比较第43-49页
 3 用多位点序列分型对副溶血性弧菌菌株进行分子系统发育学研究第49-51页
 参考文献第51-58页
第一章 副溶血性弧菌传播特性和血清型多样性分析第58-72页
 1 材料和方法第58-61页
   ·样品来源第58-59页
   ·副溶血性弧菌分离与鉴定第59页
   ·DNA提取第59页
   ·PCR法测定tdh、trh基因第59-60页
   ·RAPD分子分型第60页
   ·血清学分型第60-61页
 2 结果第61-64页
   ·食物链中、可疑熟食及病人粪便中副溶血性弧菌的检出情况第61页
   ·副溶血性弧菌毒力基因tdh和trh的检出情况第61-62页
   ·副溶血性弧菌RAPD分子分型结果第62-63页
   ·食源性副溶血性弧菌血清分型结果第63-64页
 3 讨论第64-67页
 4 小结第67-68页
 参考文献第68-72页
第二章 03:K6克隆流行特征及系统性功能基因研究第72-85页
 1 材料和方法第74-75页
   ·菌株来源第74页
   ·血清分型第74页
   ·PCR法测定tdh、trh、系统性功能基因第74-75页
 2 结果第75-77页
   ·食源株中致病株及大流行株分布情况第75页
   ·人源株中致病株及大流行株分布情况第75页
   ·系统性功能基因的分布情况第75-77页
 3 讨论第77-80页
 4 小结第80-81页
 参考文献第81-85页
第三章 副溶血性弧菌毒力岛研究第85-96页
 1 材料和方法第86-87页
   ·大流行株、致病株、非致病株的来源第86页
   ·PCR法测定毒力及毒力岛基因第86-87页
 2 结果第87-89页
   ·T3SS1阅读框分布第87页
   ·毒力岛VPaⅠ-1、VPaⅠ-5的分布情况第87页
   ·毒力岛VPaⅠ-4、PaⅠ-6分布情况第87-88页
   ·毒力岛VPaⅠ-7及T3ss2阅读框分布情况第88页
   ·毒力岛VPaⅠ-2分布情况第88页
   ·毒力岛VPaⅠ-3分布情况第88-89页
   ·T6SS、生物膜基因、Ⅰ型菌毛基因分布情况第89页
 3 讨论第89-92页
 4 小结第92-93页
 参考文献第93-96页
第四章 副溶血性弧菌多位点序列分析及03:K6克隆种群起源研究第96-113页
 1 材料和方法第97-98页
   ·菌株来源第97页
   ·系统性毒力基因及7个毒力岛的测定第97页
   ·MLST测定第97-98页
   ·确定同源(克隆)复合体第98页
   ·系统发育分析第98页
 2 结果第98-100页
   ·副溶血性弧菌ST型第98-99页
   ·ST型别与血清型、毒力基因以及系统性毒力基因及毒力岛间的关系第99页
   ·同源性复合体第99-100页
   ·集群和系统发育分析第100页
 3 讨论第100-109页
 4 小结第109-110页
 参考文献第110-113页
附件1第113-116页
附件2第116-117页
附件3第117-121页
附件4第121-125页
附件5第125-129页
全文总结第129-130页
致谢第130-131页
攻读学位期间发表的学术论文第131-132页

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