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激素性股骨头坏死BMSCs lncRNA异常表达谱及lncRNA HOTAIR在BMSCs成骨/成脂异常转分化作用机理的研究

中文摘要第4-8页
Abstract第8-12页
中英文缩略表第16-17页
第1章 绪论第17-21页
第2章 激素性股骨头坏死患者骨髓间充质干细胞分离、培养、鉴定及增殖能力研究第21-31页
    2.1 材料第21-24页
        2.1.1 SONFH入组病例选择与对照体系的建立第21-23页
        2.1.2 实验试剂第23页
        2.1.3 实验仪器第23-24页
        2.1.4 试剂配置第24页
    2.2 方法第24-25页
        2.2.1 BMSCs分离及培养第24页
        2.2.2 BMSCs表面抗原检测第24页
        2.2.3 BMSCs细胞周期检测第24-25页
        2.2.4 BMSCs增殖能力检测第25页
        2.2.5 统计学分析第25页
    2.3 结果第25-28页
        2.3.1 SONFH组与对照组BMSCs形态学特征第25-26页
        2.3.2 SONFH组与对照组BMSCs表面抗原表达结果第26页
        2.3.3 SONFH组与对照组BMSCs细胞周期无显著差异第26-27页
        2.3.4 SONFH组与对照组BMSCs增殖能力无显著差异第27-28页
    2.4 讨论第28-31页
第3章 激素性股骨头坏死骨髓间充质干细胞成骨、成脂分化能力研究第31-47页
    概述第31页
    3.1 材料第31-33页
        3.1.1 实验试剂第31-32页
        3.1.2 实验仪器第32页
        3.1.3 试剂配制第32-33页
    3.2 方法第33-38页
    3.3 结果第38-43页
        3.3.1 激素性股骨头坏死BMSCs成骨分化能力减弱第38-41页
        3.3.2 激素性股骨头坏死BMSCs成脂分化能力增强第41-43页
    3.4 讨论第43-47页
第4章 激素性股骨头坏死骨髓间充质干细胞LNCRNA及MRNA表达谱研究第47-71页
    概述第47页
    4.1 材料第47-48页
        4.1.1 实验试剂第47-48页
        4.1.2 实验仪器第48页
        4.1.3 基因芯片信息第48页
    4.2 方法第48-56页
    4.3 结果第56-67页
        4.3.1 样本提取总RNA及标记效率质控结果第56-57页
        4.3.2 基因芯片扫描结果第57-58页
        4.3.3 原始表达谱信息标准化及注释第58-60页
        4.3.4 芯片数据质量评估第60-61页
        4.3.5 差异表达lncRNA及mRNA筛选第61-64页
        4.3.6 通过qRT-PCR验证lncRNA和mRNA基因芯片准确性第64-67页
    4.4 讨论第67-71页
第5章 激素性股骨头坏死骨髓间充质干细胞LNCRNA及MRNA表达谱生物信息学分析第71-93页
    概述第71-72页
    5.1 生物信息学分析方法第72-74页
        5.1.1 基因本体论(Gene Ontology, GO)分析第72页
        5.1.2 信号通路分析(Pathway分析)第72-73页
        5.1.3 PPI (protein-protein interaction)互作网络的构建及分析第73页
        5.1.4 CNC (Coding-non-coding gene co-expression)共表达网络分析第73-74页
        5.1.5 ceRNA(competing endogenous RNA)调控网络构建第74页
        5.1.6 统计学分析第74页
    5.2 结果第74-88页
        5.2.1 激素性股骨头坏死BMSCs差异表达基因GO分析结果第74-81页
        5.2.2 激素性股骨头坏死BMSCs差异表达基因Pathway分析第81-84页
        5.2.3 PPI互作网络分析结果第84-86页
        5.2.4 CNC共表达网络分析第86-87页
        5.2.5 ceRNA调控网络分析第87-88页
    5.3 讨论第88-93页
第6章 LNCRNA-HOTAIR调控激素性股骨头坏死骨髓间充质干细胞成骨/成脂转分化异常机制研究第93-115页
    概述第93页
    6.1 材料第93-95页
        6.1.1 实验试剂第93-94页
        6.1.2 实验仪器第94-95页
    6.2 方法第95-97页
    6.3 结果第97-110页
        6.3.1 Knockdown HOTAIR促进SONFH-BMSCs成骨分化、抑制成脂分化第97-100页
        6.3.2 过表达HOTAIR抑制BMSCs成骨分化、促进成脂分化第100-103页
        6.3.3 HOTAIR及DKK1均与miR-217 有可结合位点第103-105页
        6.3.4 HOTAIR及DKK1均与miR-217 表达量呈显著负相关第105-106页
        6.3.5 HOTAIR通过结合miR-217 间接调控靶基因DKK1表达第106-108页
        6.3.6 低表达HOTAIR可抑制经典Wnt信号通路中OCT4表达,促进β-catenin表达第108-109页
        6.3.7 过表达HOTAIR可促进经典Wnt信号通路中OCT4表达,抑制β-catenin表达第109-110页
    6.4 讨论第110-115页
第7章 结论第115-117页
创新点与不足之处第117-119页
参考文献第119-127页
附录第127-155页
    综述1 骨髓间充质干细胞多能分化及骨疾病相关LNCRNA研究进展第127-139页
        1、长链非编码RNA分子功能及作用机制第128-129页
        2、长链非编码RNA与骨髓间充质干细胞多元性分化第129-132页
        3、LNCRNA与骨科疾病第132-134页
        4、结语第134页
        参考文献第134-139页
    综述2 生物信息学相关数据库及工具在长链非编码RNA研究中的应用进展第139-155页
        1、基因组学和基因组计划第141-142页
        2、基因测序与基因芯片第142-143页
        3、LNCRNA数据库及工具概述第143-148页
        4、LNCRNA与其它生物分子关联分析第148-149页
        5、LNCRNA数据库与组学数据集第149-150页
        6、展望第150页
        参考文献第150-155页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第155-157页
致谢第157页

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