| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-13页 |
| 1.1 蛋白质结构及功能 | 第8页 |
| 1.2 比较蛋白质组学及相似性分析产生的背景、意义 | 第8-11页 |
| 1.3 本文的主要内容 | 第11-13页 |
| 第二章 基于因子模型对G蛋白偶联受体序列进行聚类 | 第13-21页 |
| 2.1 引言 | 第13-14页 |
| 2.2 因子模型 | 第14-15页 |
| 2.3 蛋白质序列的特征向量表示 | 第15-17页 |
| 2.3.1 蛋白质序列的11维、2维特征向量表示 | 第15-17页 |
| 2.3.2 蛋白质序列的16维、6维特征向量表示 | 第17页 |
| 2.4 蛋白质序列相似性及其聚类分析 | 第17-20页 |
| 2.5 总结 | 第20-21页 |
| 第三章 基于傅里叶功率谱的H1N1病毒血凝素蛋白质序列的比较分析 | 第21-28页 |
| 3.1 引言 | 第21页 |
| 3.2 材料与方法 | 第21-22页 |
| 3.2.1 材料选取 | 第21-22页 |
| 3.2.2 方法 | 第22页 |
| 3.3 符号序列的数字表达HP模型 | 第22-25页 |
| 3.3.1 基于20种氨基酸的功率谱 | 第22-23页 |
| 3.3.2 基于电荷和极性性质的功率谱 | 第23-24页 |
| 3.3.3 聚类 | 第24-25页 |
| 3.4 结果分析与讨论 | 第25-27页 |
| 3.5 总结 | 第27-28页 |
| 第四章 蛋白质序列的特征向量表示及其应用 | 第28-41页 |
| 4.1 引言 | 第28页 |
| 4.2 蛋白质序列的特征向量表示 | 第28-29页 |
| 4.3 相关性分析与聚类法 | 第29-30页 |
| 4.3.1 相关性分析 | 第29-30页 |
| 4.3.2 分层聚类法 | 第30页 |
| 4.4 应用举例 | 第30-39页 |
| 4.4.1 相关性分析的结果与讨论 | 第30-33页 |
| 4.4.2 不同特征下的聚类图分析 | 第33-39页 |
| 4.5 总结 | 第39-41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 本文总结 | 第41页 |
| 未来展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-47页 |
| 附录A 31条流感病毒所对应的序列号 | 第47页 |
| 附录B 28条流感病毒所对应的序列号 | 第47-48页 |
| 附录C MATLAB程序 | 第48-54页 |
| 附录D SAS程序 | 第54-55页 |
| 附录E 相关性计算程序 | 第55-57页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |