| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| ·生物信息学简介 | 第8-9页 |
| ·木聚糖酶 | 第9页 |
| ·本论文的主要研究内容 | 第9-12页 |
| 第二章 基本知识和序列比对方法 | 第12-18页 |
| ·基本知识 | 第12-13页 |
| ·蛋白质序列的经典HP 模型 | 第12页 |
| ·蛋白质序列的特征序列 | 第12-13页 |
| ·基因序列的比对及图谱表示方法 | 第13-18页 |
| 第三章 基于矩阵图谱表达法的蛋白质序列的相似性分析 | 第18-24页 |
| ·两木聚糖酶家族蛋白质序列的收集及处理 | 第18页 |
| ·理论与方法 | 第18-20页 |
| ·DNA 序列的矩阵图谱表示 | 第18-19页 |
| ·基于经典HP 模型的蛋白质序列的矩阵图谱表示 | 第19-20页 |
| ·数据处理与结果比较 | 第20-22页 |
| ·本章小结 | 第22-24页 |
| 第四章 F/10 和G/11 木聚糖酶家族蛋白质序列的相似性分析 | 第24-32页 |
| ·前言 | 第24页 |
| ·数据来源及处理 | 第24页 |
| ·理论与方法 | 第24-26页 |
| ·改进的特征序列及其数值刻划 | 第24-25页 |
| ·蛋白质序列的相似性分析算法 | 第25-26页 |
| ·结果与分析 | 第26-30页 |
| ·本章小结 | 第30-32页 |
| 第五章 基于RSCU 与QRSCU 的F | 第32-42页 |
| ·引言 | 第32页 |
| ·材料与方法 | 第32-34页 |
| ·数据库的构建 | 第32页 |
| ·密码子的相对使用度 | 第32-33页 |
| ·密码子偏好性强度划分 | 第33-34页 |
| ·结果与分析 | 第34-40页 |
| ·基于氨基酸编码方法下的密码子偏好情况分析 | 第37-38页 |
| ·基于拟氨基酸编码方法下的密码子偏好情况分析 | 第38-39页 |
| ·两种编码方法下密码子偏好性对比 | 第39-40页 |
| ·本章小结 | 第40-42页 |
| 第六章 总结与展望 | 第42-44页 |
| ·总结 | 第42页 |
| ·创新之处 | 第42页 |
| ·展望 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 附录: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49页 |