摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
缩略语表 | 第11-12页 |
1 文献综述 | 第12-40页 |
1.1 分枝角度的研究进展 | 第12-24页 |
1.1.1 重力信号的感受 | 第12-14页 |
1.1.2 重力信号的转导 | 第14-16页 |
1.1.3 生长素的不对称分布 | 第16-20页 |
1.1.3.1 生长素合成、信号转导和代谢对重力反应的影响 | 第16-18页 |
1.1.3.2 生长素运输对重力反应的影响 | 第18-20页 |
1.1.4 重力反应器官的弯曲生长 | 第20-21页 |
1.1.5 几个影响分枝角度的关键基因 | 第21-24页 |
1.1.5.1 TAC1基因 | 第21-22页 |
1.1.5.2 LAZY1和DRO1基因 | 第22页 |
1.1.5.3 LPA1/SGR5/IDD15基因 | 第22-24页 |
1.2 株高的研究进展 | 第24-30页 |
1.2.1 赤霉素调控株高 | 第24-26页 |
1.2.2 油菜素内酯调控株高 | 第26-28页 |
1.2.3 生长素调控株高 | 第28-29页 |
1.2.4 其他途径调控株高 | 第29-30页 |
1.3 关联分析 | 第30-36页 |
1.3.1 连锁不平衡 | 第30-33页 |
1.3.1.1 连锁不平衡的衡量 | 第31-32页 |
1.3.1.2 影响连锁不平衡的因素 | 第32-33页 |
1.3.2 群体结构对关联分析的影响 | 第33-35页 |
1.3.3 关联分析的模型发展 | 第35-36页 |
1.4 甘蓝型油菜分枝角度的研究进展 | 第36页 |
1.5 甘蓝型油菜株高的研究进展 | 第36-39页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第39-40页 |
2 材料与方法 | 第40-45页 |
2.1 实验材料 | 第40页 |
2.2 表型考察与分析 | 第40-41页 |
2.3 基因型分析 | 第41-42页 |
2.3.1 高质量植物总DNA的提取 | 第41页 |
2.3.2 油菜60K芯片杂交 | 第41-42页 |
2.4 SNP标记的筛选 | 第42页 |
2.5 群体结构分析 | 第42-43页 |
2.5.1 STRUCTURE分析 | 第42页 |
2.5.2 亲缘关系分析 | 第42-43页 |
2.6 连锁不平衡分析 | 第43页 |
2.7 单倍型域分析 | 第43页 |
2.8 关联分析 | 第43-44页 |
2.9 选择扫荡分析 | 第44页 |
2.10 QTL比较 | 第44页 |
2.11 候选基因的预测 | 第44-45页 |
3 结果与分析 | 第45-70页 |
3.1 SNP标记的筛选、群体结构和亲缘关系 | 第45-47页 |
3.2 连锁不平衡分析 | 第47-48页 |
3.3 单倍型域分析 | 第48-50页 |
3.4 不同部位分枝的角度变化趋势 | 第50-51页 |
3.5 关联群体分枝角度的表型变异 | 第51-52页 |
3.6 分枝角度关联分析 | 第52-57页 |
3.7 分枝角度候选基因预测 | 第57-59页 |
3.8 关联群体株高的表型变异 | 第59-60页 |
3.9 株高关联分析 | 第60-66页 |
3.10 株高QTL比较 | 第66-67页 |
3.11 选择扫荡分析 | 第67-68页 |
3.12 株高候选基因预测 | 第68-70页 |
4 讨论 | 第70-79页 |
4.1 群体的连锁不平衡 | 第70-72页 |
4.2 染色体的连锁不平衡和单倍型域 | 第72-74页 |
4.3 关联模型的比较 | 第74-75页 |
4.4 油菜分枝角度遗传解析 | 第75-77页 |
4.5 油菜株高遗传解析 | 第77页 |
4.6 矮杆育种过程中的选择印迹 | 第77-79页 |
参考文献 | 第79-101页 |
附录 | 第101-122页 |
附录1 自然群体520份甘蓝型油菜自交系详单 | 第101-115页 |
附录2 油菜60K芯片杂交操作步骤 | 第115-119页 |
附录3 19 ,167SNP标记稀有等位基因频率(MAF)分布直方图 | 第119-120页 |
附录4 分枝角度关联位点LD衰减距离内的基因GO富集分析 | 第120-121页 |
附录5 作者简介和在读期间发表的文章 | 第121-122页 |
致谢 | 第122-124页 |