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RNA-seq结合QTL定位鉴别油菜花期候选功能基因

致谢第6-9页
摘要第9-10页
Abstract第10页
第一章 引言第11-21页
    1.1 油菜及花期的研究第11-17页
        1.1.1 油菜概括第11页
        1.1.2 花期相关代谢途径的研究第11-16页
        1.1.3 油菜开花期QTL的研究第16-17页
    1.2 高通量测序技术第17-20页
        1.2.1 测序技术的发展第17-19页
        1.2.2 转录组测序的研究第19-20页
    1.3 研究的目的和意义第20-21页
第二章 油菜花蕾转录组的基因差异表达分析第21-43页
    2.1 材料与方法第21-28页
        2.1.1 植物材料与RNA提取第21页
        2.1.2 cDNA文库构建和测序第21-22页
        2.1.3 测序数据质量控制第22-23页
        2.1.4 表达分析第23-25页
        2.1.5 基因注释第25-27页
            2.1.5.1 基因的功能注释第25-26页
            2.1.5.2 基因的GO注释第26页
            2.1.5.3 基因的KEGG注释及富集分析第26-27页
        2.1.6 QTL区域与表达基因的分析第27-28页
    2.2 研究结果与分析第28-40页
        2.2.1 数据预处理第28-29页
        2.2.2 基因的表达分析第29-33页
        2.2.3 GO分类分析第33-36页
        2.2.4 KEGG注释分析第36-37页
        2.2.5 花期相关的基因分析第37-40页
    2.3 确立花期候选基因的讨论第40-43页
第三章 油菜花期主效QTL(qFTC6)的精细定位第43-55页
    3.1 材料与方法第43-48页
        3.1.1 实验材料第43-44页
        3.1.2 实验方法第44-48页
            3.1.2.1 田间试验与表型考察第44页
            3.1.2.2 基因型分析第44-46页
            3.1.2.3 统计分析第46-47页
            3.1.2.4 qFTC6目标区间分子标记的发展第47-48页
    3.2 研究结果分析第48-51页
        3.2.1 田间试验表现型的分布第48-49页
        3.2.2 花期主效qFTC6的精细定位第49-51页
            3.2.2.1 BC_2F_2的基因型分布第49-50页
            3.2.2.2 BC_2F_2基因型与表现型的关联分析第50-51页
    3.3 小结与讨论第51-52页
        3.3.1 油菜花期的遗传基础第51-52页
        3.3.2 QTL定位技术与RNA-seq技术的结合第52页
    3.4 总结与展望第52-55页
参考文献第55-61页

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