致谢 | 第6-9页 |
摘要 | 第9-10页 |
Abstract | 第10页 |
第一章 引言 | 第11-21页 |
1.1 油菜及花期的研究 | 第11-17页 |
1.1.1 油菜概括 | 第11页 |
1.1.2 花期相关代谢途径的研究 | 第11-16页 |
1.1.3 油菜开花期QTL的研究 | 第16-17页 |
1.2 高通量测序技术 | 第17-20页 |
1.2.1 测序技术的发展 | 第17-19页 |
1.2.2 转录组测序的研究 | 第19-20页 |
1.3 研究的目的和意义 | 第20-21页 |
第二章 油菜花蕾转录组的基因差异表达分析 | 第21-43页 |
2.1 材料与方法 | 第21-28页 |
2.1.1 植物材料与RNA提取 | 第21页 |
2.1.2 cDNA文库构建和测序 | 第21-22页 |
2.1.3 测序数据质量控制 | 第22-23页 |
2.1.4 表达分析 | 第23-25页 |
2.1.5 基因注释 | 第25-27页 |
2.1.5.1 基因的功能注释 | 第25-26页 |
2.1.5.2 基因的GO注释 | 第26页 |
2.1.5.3 基因的KEGG注释及富集分析 | 第26-27页 |
2.1.6 QTL区域与表达基因的分析 | 第27-28页 |
2.2 研究结果与分析 | 第28-40页 |
2.2.1 数据预处理 | 第28-29页 |
2.2.2 基因的表达分析 | 第29-33页 |
2.2.3 GO分类分析 | 第33-36页 |
2.2.4 KEGG注释分析 | 第36-37页 |
2.2.5 花期相关的基因分析 | 第37-40页 |
2.3 确立花期候选基因的讨论 | 第40-43页 |
第三章 油菜花期主效QTL(qFTC6)的精细定位 | 第43-55页 |
3.1 材料与方法 | 第43-48页 |
3.1.1 实验材料 | 第43-44页 |
3.1.2 实验方法 | 第44-48页 |
3.1.2.1 田间试验与表型考察 | 第44页 |
3.1.2.2 基因型分析 | 第44-46页 |
3.1.2.3 统计分析 | 第46-47页 |
3.1.2.4 qFTC6目标区间分子标记的发展 | 第47-48页 |
3.2 研究结果分析 | 第48-51页 |
3.2.1 田间试验表现型的分布 | 第48-49页 |
3.2.2 花期主效qFTC6的精细定位 | 第49-51页 |
3.2.2.1 BC_2F_2的基因型分布 | 第49-50页 |
3.2.2.2 BC_2F_2基因型与表现型的关联分析 | 第50-51页 |
3.3 小结与讨论 | 第51-52页 |
3.3.1 油菜花期的遗传基础 | 第51-52页 |
3.3.2 QTL定位技术与RNA-seq技术的结合 | 第52页 |
3.4 总结与展望 | 第52-55页 |
参考文献 | 第55-61页 |