符号说明 | 第4-8页 |
中文摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-11页 |
1 引言 | 第13-22页 |
1.1 窄冠型杨树 | 第13页 |
1.2 杂种优势 | 第13-15页 |
1.3 DNA 甲基化 | 第15-18页 |
1.3.1 DNA 甲基化的发生机制 | 第15页 |
1.3.2 DNA 甲基化的生物学意义 | 第15-16页 |
1.3.2.1 DNA 甲基化去甲基化作用 | 第16页 |
1.3.2.2 DNA 甲基化调节基因表达 | 第16页 |
1.3.2.3 DNA 甲基化与生长发育 | 第16页 |
1.3.3 DNA 甲基化的遗传与变异 | 第16-17页 |
1.3.4 基因组 DNA 甲基化的检测方法 | 第17-18页 |
1.3.4.1 DNA 甲基化敏感扩增多态性 | 第17-18页 |
1.3.4.2 高效液相色谱法 | 第18页 |
1.3.4.3 亚硫酸盐测序 | 第18页 |
1.5 DNA 甲基化与杂种优势 | 第18-20页 |
1.6 cDNA-AFLP 基因差显技术 | 第20页 |
1.7 研究的目的意义 | 第20-22页 |
2 材料与方法 | 第22-33页 |
2.1 试验材料 | 第22页 |
2.2 试验试剂和仪器 | 第22页 |
2.2.1 试验试剂 | 第22页 |
2.2.2 仪器设备 | 第22页 |
2.3 试验方法 | 第22-33页 |
2.3.1 基因组 DNA 的提取 | 第22-23页 |
2.3.2 模板 DNA 纯度与浓度检测 | 第23页 |
2.3.3 基因组 DNA 的甲基化 MSAP 技术体系建立 | 第23-28页 |
2.3.3.1 样品 DNA 双酶切 | 第24页 |
2.3.3.2 接头的连接 | 第24-25页 |
2.3.3.3 基因组 DNA 的预扩增 | 第25-26页 |
2.3.3.4 基因组 DNA 的选择性扩增 | 第26页 |
2.3.3.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第26-27页 |
2.3.3.6 条带的读取以及数据分析 | 第27页 |
2.3.3.7 甲基化变异条带的回收、克隆以及测序 | 第27-28页 |
2.3.4 cDNA-AFLP 技术体系建立 | 第28-33页 |
2.3.4.1 基因组总 RNA 的提取和检测 | 第28页 |
2.3.4.2 cDNA 双链合成 | 第28页 |
2.3.4.3 cDNA 双链的酶切 | 第28-29页 |
2.3.4.4 接头的准备与连接 | 第29页 |
2.3.4.5 预扩增 | 第29-31页 |
2.3.4.6 选择性扩增 | 第31页 |
2.3.4.7 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第31页 |
2.3.4.8 条带的读取以及数据分析 | 第31-32页 |
2.3.4.9 基因表达差异条带的回收、克隆以及测序 | 第32-33页 |
3 结果与分析 | 第33-49页 |
3.1 总 DNA 的提取 | 第33页 |
3.2 基因组 DNA 甲基化水平和模式的研究 | 第33-37页 |
3.2.1 MSAP 扩增图谱的构建 | 第33-35页 |
3.2.1.1 双酶切 | 第33页 |
3.2.1.2 预扩增 | 第33页 |
3.2.1.3 选择性扩增 | 第33-35页 |
3.2.2 基因组 DNA 甲基化水平和模式 | 第35-37页 |
3.3 DNA 甲基化发生的变异模式 | 第37-40页 |
3.4 甲基化变异位点回收克隆以及测序 | 第40-42页 |
3.4.1 变异位点回收和二次扩增结果 | 第40-41页 |
3.4.2 甲基化变异位点回收、克隆及测序 | 第41-42页 |
3.5 cDNA-AFLP 图谱的构建 | 第42-44页 |
3.5.1 总 RNA 提取 | 第42-43页 |
3.5.2 双链 cDNA 的酶切 | 第43页 |
3.5.3 预扩增以及选择性扩增 cDNA-AFLP 图谱 | 第43-44页 |
3.6 cDNA-AFLP 图谱带型差异 | 第44-46页 |
3.7 cDNA-AFLP 图谱差异位点回收、克隆及测序 | 第46-49页 |
4 讨论 | 第49-54页 |
4.1 全基因组 DNA 甲基化水平和模式分析 | 第49-50页 |
4.2 DNA 甲基化变异模式分析 | 第50-51页 |
4.3 cDNA-AFLP 图谱带型差异分析 | 第51页 |
4.4 回收位点的序列分析 | 第51-54页 |
4.4.1 回收的甲基化变异位点的序列分析 | 第51-52页 |
4.4.2 回收的 cDNA-AFLP 图谱变异带型差异位点的序列分析 | 第52-54页 |
5 结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-63页 |
附录 I:回收的差异位点序列 | 第63-67页 |
附录 II:相关试剂的配制 | 第67-69页 |
致谢 | 第69-70页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第70页 |