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窄冠黑白杨杂种优势的MSAP和cDNA-AFLP的研究

符号说明第4-8页
中文摘要第8-10页
Abstract第10-11页
1 引言第13-22页
    1.1 窄冠型杨树第13页
    1.2 杂种优势第13-15页
    1.3 DNA 甲基化第15-18页
        1.3.1 DNA 甲基化的发生机制第15页
        1.3.2 DNA 甲基化的生物学意义第15-16页
            1.3.2.1 DNA 甲基化去甲基化作用第16页
            1.3.2.2 DNA 甲基化调节基因表达第16页
            1.3.2.3 DNA 甲基化与生长发育第16页
        1.3.3 DNA 甲基化的遗传与变异第16-17页
        1.3.4 基因组 DNA 甲基化的检测方法第17-18页
            1.3.4.1 DNA 甲基化敏感扩增多态性第17-18页
            1.3.4.2 高效液相色谱法第18页
            1.3.4.3 亚硫酸盐测序第18页
    1.5 DNA 甲基化与杂种优势第18-20页
    1.6 cDNA-AFLP 基因差显技术第20页
    1.7 研究的目的意义第20-22页
2 材料与方法第22-33页
    2.1 试验材料第22页
    2.2 试验试剂和仪器第22页
        2.2.1 试验试剂第22页
        2.2.2 仪器设备第22页
    2.3 试验方法第22-33页
        2.3.1 基因组 DNA 的提取第22-23页
        2.3.2 模板 DNA 纯度与浓度检测第23页
        2.3.3 基因组 DNA 的甲基化 MSAP 技术体系建立第23-28页
            2.3.3.1 样品 DNA 双酶切第24页
            2.3.3.2 接头的连接第24-25页
            2.3.3.3 基因组 DNA 的预扩增第25-26页
            2.3.3.4 基因组 DNA 的选择性扩增第26页
            2.3.3.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳第26-27页
            2.3.3.6 条带的读取以及数据分析第27页
            2.3.3.7 甲基化变异条带的回收、克隆以及测序第27-28页
        2.3.4 cDNA-AFLP 技术体系建立第28-33页
            2.3.4.1 基因组总 RNA 的提取和检测第28页
            2.3.4.2 cDNA 双链合成第28页
            2.3.4.3 cDNA 双链的酶切第28-29页
            2.3.4.4 接头的准备与连接第29页
            2.3.4.5 预扩增第29-31页
            2.3.4.6 选择性扩增第31页
            2.3.4.7 聚丙烯酰胺凝胶电泳第31页
            2.3.4.8 条带的读取以及数据分析第31-32页
            2.3.4.9 基因表达差异条带的回收、克隆以及测序第32-33页
3 结果与分析第33-49页
    3.1 总 DNA 的提取第33页
    3.2 基因组 DNA 甲基化水平和模式的研究第33-37页
        3.2.1 MSAP 扩增图谱的构建第33-35页
            3.2.1.1 双酶切第33页
            3.2.1.2 预扩增第33页
            3.2.1.3 选择性扩增第33-35页
        3.2.2 基因组 DNA 甲基化水平和模式第35-37页
    3.3 DNA 甲基化发生的变异模式第37-40页
    3.4 甲基化变异位点回收克隆以及测序第40-42页
        3.4.1 变异位点回收和二次扩增结果第40-41页
        3.4.2 甲基化变异位点回收、克隆及测序第41-42页
    3.5 cDNA-AFLP 图谱的构建第42-44页
        3.5.1 总 RNA 提取第42-43页
        3.5.2 双链 cDNA 的酶切第43页
        3.5.3 预扩增以及选择性扩增 cDNA-AFLP 图谱第43-44页
    3.6 cDNA-AFLP 图谱带型差异第44-46页
    3.7 cDNA-AFLP 图谱差异位点回收、克隆及测序第46-49页
4 讨论第49-54页
    4.1 全基因组 DNA 甲基化水平和模式分析第49-50页
    4.2 DNA 甲基化变异模式分析第50-51页
    4.3 cDNA-AFLP 图谱带型差异分析第51页
    4.4 回收位点的序列分析第51-54页
        4.4.1 回收的甲基化变异位点的序列分析第51-52页
        4.4.2 回收的 cDNA-AFLP 图谱变异带型差异位点的序列分析第52-54页
5 结论第54-55页
参考文献第55-63页
附录 I:回收的差异位点序列第63-67页
附录 II:相关试剂的配制第67-69页
致谢第69-70页
攻读学位期间发表的学术论文第70页

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