小麦栽培种与野生种的转录组组装及差异基因分析
| 符号说明 | 第4-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第11-19页 |
| 1.1 小麦属概述 | 第11-12页 |
| 1.1.1 小麦属分类 | 第11-12页 |
| 1.1.2 小麦属的进化 | 第12页 |
| 1.2 作物的驯化 | 第12-15页 |
| 1.2.1 驯化的研究现状 | 第12-14页 |
| 1.2.2 小麦属的驯化 | 第14页 |
| 1.2.3 多倍化与作物驯化 | 第14-15页 |
| 1.3 小麦属转录组测序 | 第15-17页 |
| 1.3.1 测序技术 | 第15页 |
| 1.3.2 转录组测序组装技术 | 第15-16页 |
| 1.3.3 小麦属参考基因组 | 第16-17页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第17-19页 |
| 2 材料和方法 | 第19-22页 |
| 2.1 实验材料 | 第19页 |
| 2.2 RNA提取和质量检测 | 第19页 |
| 2.3 文库构建及库检和上机测序 | 第19页 |
| 2.4 测序数据过滤和组装 | 第19-20页 |
| 2.5 栽培种和野生种差异检测 | 第20-21页 |
| 2.6 基因功能注释 | 第21-22页 |
| 3 结果与分析 | 第22-37页 |
| 3.1 测序与组装 | 第22-25页 |
| 3.1.1 测序质量 | 第22页 |
| 3.1.2 参考基因组质量 | 第22-23页 |
| 3.1.3 无参组装结果评估 | 第23页 |
| 3.1.4 有参组装过程和结果 | 第23-25页 |
| 3.2 差异基因分析 | 第25-37页 |
| 3.2.1 SNP位点深度 | 第25-27页 |
| 3.2.2 SNP位点碱基突变方向 | 第27页 |
| 3.2.3 SNP位点在各个染色体上的分布 | 第27-33页 |
| 3.2.4 SNP位点基因功能注释 | 第33-35页 |
| 3.2.5 表达量差异基因分析 | 第35-37页 |
| 4 讨论 | 第37-39页 |
| 4.1 转录组组装 | 第37页 |
| 4.2 差异基因分析 | 第37-39页 |
| 5 结论 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-47页 |
| 附录 | 第47-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
