| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 图表清单 | 第12-15页 |
| 第一章 序言 | 第15-34页 |
| ·栖热菌(Thermus)的基本特征 | 第15-17页 |
| ·栖热菌的地理分布及分类 | 第17-19页 |
| ·栖热菌的高温噬菌体 | 第19-24页 |
| ·长尾噬菌体科(Spihoviuse) | 第20-21页 |
| ·肌尾噬菌体科(Myoviridae) | 第21-22页 |
| ·丝状噬菌体科(Inoviridae) | 第22-23页 |
| ·覆盖层噬菌体科(Tectiviridae) | 第23-24页 |
| ·栖热菌噬菌体基因组 | 第24-29页 |
| ·ΦYS40基因组特征 | 第24-26页 |
| ·P23-45和P74-26基因组特征 | 第26-27页 |
| ·ΦIN93基因组特征 | 第27-28页 |
| ·P23-77基因组特征 | 第28-29页 |
| ·栖热菌噬菌体主要功能蛋白研究进展 | 第29页 |
| ·解旋酶 | 第29-32页 |
| ·解旋酶概述 | 第29-30页 |
| ·解旋酶活性测定方法 | 第30-31页 |
| ·噬菌体解旋酶的研究进展 | 第31-32页 |
| ·研究目的和意义 | 第32-34页 |
| 第二章 TSP4噬菌体的分离及其基因组的提取测序 | 第34-37页 |
| ·材料 | 第34页 |
| ·方法 | 第34-35页 |
| ·宿主菌栖热菌的培养 | 第34-35页 |
| ·TSP4噬菌体的培养 | 第35页 |
| ·TSP4噬菌体基因组的提取 | 第35页 |
| ·TSP4噬菌体基因组的测序拼接 | 第35页 |
| ·结果与讨论 | 第35-37页 |
| 第三章 TSP4噬菌体基因组的解析 | 第37-85页 |
| ·材料 | 第37页 |
| ·方法 | 第37-39页 |
| ·开放阅读框(open reading frame,ORF)的预测 | 第37页 |
| ·可能基因的预测和tRNA编码序列的分析 | 第37页 |
| ·假定基因编码产物在NCBI数据库中的同源性检索 | 第37-38页 |
| ·基因编码产物的多重序列对比分析和系统发生树的绘制 | 第38页 |
| ·基因组一般特性分析 | 第38页 |
| ·基因组上重复序列和转录终止子的分析 | 第38-39页 |
| ·基因组上启动子的预测 | 第39页 |
| ·基因组上GC岛的分析 | 第39页 |
| ·使用遗传密码子的偏嗜性(codon usage bias)分析 | 第39页 |
| ·结果 | 第39-83页 |
| ·基因组中ORFs的预测和可能的编码基因序列结果 | 第39-40页 |
| ·TSP4噬菌体基因组概述 | 第40-58页 |
| ·TSP4噬菌体基因组ORF的序列分析 | 第58-61页 |
| ·TSP4噬菌体部分蛋白结构和功能的预测 | 第61-83页 |
| ·讨论 | 第83-85页 |
| 第四章 TSP4噬菌体解旋酶tsp4-h42基因的克隆表达 | 第85-101页 |
| ·材料 | 第85页 |
| ·细菌和质粒 | 第85页 |
| ·培养基 | 第85页 |
| ·方法 | 第85-94页 |
| ·引物的合成 | 第85-86页 |
| ·引物稀释 | 第86页 |
| ·PCR扩增目的片段 | 第86页 |
| ·PCR产物的胶回收 | 第86页 |
| ·感受态细胞的制作 | 第86-87页 |
| ·表达载体的构建 | 第87-91页 |
| ·目的蛋白在大肠杆菌中的诱导表达 | 第91页 |
| ·SDS-PAGE检测 | 第91页 |
| ·重组解旋酶蛋白的纯化 | 第91-92页 |
| ·重组解旋酶蛋白的ATP酶酶活的测定 | 第92页 |
| ·重组解旋酶蛋白的解旋酶酶活的测定 | 第92-94页 |
| ·结果 | 第94-99页 |
| ·重组解旋酶tsp4-h42基因克隆结果 | 第94-95页 |
| ·重组解旋酶tsp4-h42基因的表达 | 第95页 |
| ·重组解旋酶tsp4-h42 ATP酶活的测定 | 第95-97页 |
| ·重组解旋酶tsp4-h42解旋酶活性的测定 | 第97-99页 |
| ·讨论 | 第99-101页 |
| 第五章 总结与展望 | 第101-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-108页 |
| 附录A Sequence similarity and predicted molecular function for geneproducts of TSP4 and P23-45 | 第108-118页 |
| 附录B TSP4基因组启动子序列聚类分析 | 第118-123页 |
| 附录C 攻读硕士期间发表论文目录 | 第123-124页 |
| 附录D 实验药品与设备 | 第124-128页 |
| D.1主要溶液及其配制 | 第124-127页 |
| D.1.1醋酸钠(NaAc)溶液:3 M,pH 5.2 | 第124页 |
| D.1.2 TE缓冲液:pH8.0 | 第124页 |
| D.1.3 TAE电泳缓冲液 | 第124页 |
| D.1.4 CaCl_2溶液:1 mol/L | 第124页 |
| D.1.5 甘油溶液 | 第124页 |
| D.1.6 SOC培养基 | 第124-125页 |
| D.1.7 CTAB抽提液 | 第125页 |
| D.1.8 CTAB/NaCl溶液 | 第125页 |
| D.1.9 溴化乙锭溶液 | 第125页 |
| D.1.10 1%琼脂糖凝胶的配制 | 第125页 |
| D.1.11 2×SDS-PAGE加样缓冲液 | 第125-126页 |
| D.1.12 SDS-PAGE电泳阴极缓冲液 | 第126页 |
| D.1.13 SDS-PAGE 5%浓缩胶 | 第126页 |
| D.1.14 SDS-PAGE 10%分离胶 | 第126页 |
| D.1.15 SDS-PAGE电泳阳极缓冲液 | 第126页 |
| D.1.16 脱色液 | 第126-127页 |
| D.1.17 染色液 | 第127页 |
| D.1.18 电转移缓冲液 | 第127页 |
| D.2 主要仪器 | 第127-128页 |
| D.3 试剂及酶制品 | 第128页 |
