重复基因在分子互作网络中的分歧进化及相互作用网络构建
| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-13页 |
| 文献综述 | 第13-25页 |
| 第一章 重复基因的研究进展 | 第13-20页 |
| ·重复基因 | 第13-14页 |
| ·基因重复现象的发现 | 第14页 |
| ·基因重复的类型 | 第14-15页 |
| ·基因重复现象的普遍性 | 第15-16页 |
| ·基因重复在进化上的重要性 | 第16页 |
| ·产生重复基因的生化途径 | 第16-18页 |
| ·不等交换 | 第16页 |
| ·反转录转座 | 第16-17页 |
| ·全基因组重复 | 第17-18页 |
| ·重复基因的分化 | 第18-19页 |
| ·影响基因进化的多种因素 | 第19-20页 |
| 第二章 分子间相互作用网络 | 第20-25页 |
| ·蛋白质间相互作用 | 第20页 |
| ·分子相互作用研究方法 | 第20-23页 |
| ·免疫共沉淀法 | 第21页 |
| ·酵母双杂交技术 | 第21页 |
| ·串联亲和纯化技术 | 第21-22页 |
| ·生物信息学方法 | 第22页 |
| ·其它鉴定方法 | 第22-23页 |
| ·分子相互作用数据资源 | 第23页 |
| ·分子互作网络与基因进化 | 第23-25页 |
| 实验研究 | 第25-58页 |
| 第三章 重复基因的分子互作网络研究 | 第25-33页 |
| ·材料 | 第25-26页 |
| ·重复基因数据 | 第25页 |
| ·分子间相互作用数据 | 第25-26页 |
| ·方法 | 第26-29页 |
| ·相互作用数据假阳性去除与置信度提高 | 第26-28页 |
| ·相互作用网络分析 | 第28-29页 |
| ·数据结果的统计分析 | 第29页 |
| ·结果与分析 | 第29-31页 |
| ·讨论 | 第31-32页 |
| ·小结 | 第32-33页 |
| 第四章 重复基因在分子互作网络中的进化 | 第33-41页 |
| ·材料 | 第33页 |
| ·酵母核苷酸和氨基酸序列 | 第33页 |
| ·外群的选择 | 第33页 |
| ·方法 | 第33-36页 |
| ·重复基因的进化分析 | 第33-35页 |
| ·统计分析 | 第35-36页 |
| ·结果与分析 | 第36-39页 |
| ·讨论 | 第39页 |
| ·小结 | 第39-41页 |
| 第五章 网络效应对新基因和基因组的影响 | 第41-45页 |
| ·材料 | 第41页 |
| ·重复基因的网络属性 | 第41页 |
| ·重复基因两拷贝间的进化距离 | 第41页 |
| ·方法 | 第41-42页 |
| ·对重复基因分类 | 第41-42页 |
| ·统计分析 | 第42页 |
| ·结果与分析 | 第42-43页 |
| ·讨论 | 第43-44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 第六章 重复基因的功能分类与必要基因的维持 | 第45-52页 |
| ·材料 | 第45-46页 |
| ·重复基因数据 | 第45页 |
| ·重复基因的氨基酸序列 | 第45页 |
| ·必要基因数据 | 第45-46页 |
| ·方法 | 第46-50页 |
| ·重复基因的功能注释 | 第46-47页 |
| ·重复基因的功能分析 | 第47-49页 |
| ·祖先基因的网络连接估计 | 第49页 |
| ·统计分析 | 第49-50页 |
| ·结果与分析 | 第50-51页 |
| ·讨论 | 第51页 |
| ·小结 | 第51-52页 |
| 第七章 结论 | 第52-54页 |
| ·本研究的创新 | 第52页 |
| ·结论 | 第52-53页 |
| ·本科研领域的展望 | 第53-54页 |
| 第八章 蛋白质互作网络构建 | 第54-58页 |
| ·材料 | 第54页 |
| ·鸡的蛋白质序列 | 第54页 |
| ·人类相互作用数据 | 第54页 |
| ·人类蛋白质序列 | 第54页 |
| ·方法 | 第54-55页 |
| ·同源比对分析 | 第54-55页 |
| ·网络分析 | 第55页 |
| ·统计分析 | 第55页 |
| ·结果与分析 | 第55-56页 |
| ·讨论 | 第56-57页 |
| ·结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-68页 |
| 附录 | 第68-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 作者简介 | 第72页 |
