| 致谢 | 第4-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-28页 |
| 1.1 土壤重金属污染概述 | 第11-17页 |
| 1.1.1 重金属概念 | 第11页 |
| 1.1.2 土壤重金属污染现状及来源 | 第11-12页 |
| 1.1.2.1 土壤重金属污染现状 | 第11-12页 |
| 1.1.2.2 土壤重金属污染来源 | 第12页 |
| 1.1.3 重金属污染的危害 | 第12-13页 |
| 1.1.3.1 重金属对植物的危害 | 第12-13页 |
| 1.1.3.2 重金属对人体的危害 | 第13页 |
| 1.1.4 植物对重金属积累及抗性 | 第13-15页 |
| 1.1.4.1 植物对重金属积累的基因型差异 | 第13页 |
| 1.1.4.2 植物不同组织中重金属的分布 | 第13-14页 |
| 1.1.4.3 植物对重金属的抗性机制 | 第14-15页 |
| 1.1.5 重金属污染治理措施 | 第15-17页 |
| 1.1.5.1 工程措施 | 第15-16页 |
| 1.1.5.2 生物措施 | 第16页 |
| 1.1.5.3 栽培措施 | 第16-17页 |
| 1.1.5.4 重金属低积累品种选育 | 第17页 |
| 1.2 QTL分析方法及应用 | 第17-23页 |
| 1.2.1 分子标记的选择 | 第18-19页 |
| 1.2.1.1 SSR标记 | 第18-19页 |
| 1.2.1.2 SNP标记 | 第19页 |
| 1.2.2 作图群体的构建 | 第19-20页 |
| 1.2.3 遗传连锁图的构建 | 第20-21页 |
| 1.2.4 QTL定位一般方法 | 第21-22页 |
| 1.2.4.1 单标记分析法(Individua1 Marker Mapping, IMM) | 第21页 |
| 1.2.4.2 区间作图法(Interval Mapping, IM) | 第21-22页 |
| 1.2.4.3 复合区间作图法(Composite Interva1 Mapping, CIM) | 第22页 |
| 1.2.4.4 完备区间作图法( Inclusive Composite Interval Mapping, ICIM ) | 第22页 |
| 1.2.5 重金属积累及抗性QTL定位研究 | 第22-23页 |
| 1.3 关联分析方法及应用 | 第23-26页 |
| 1.3.1 连锁不平衡 | 第23-24页 |
| 1.3.2 关联分析方法 | 第24-25页 |
| 1.3.2.1 策略与步骤 | 第24页 |
| 1.3.2.2 统计模型 | 第24-25页 |
| 1.3.3 关联分析的影响因素 | 第25页 |
| 1.3.3.1 连锁不平衡衰减 | 第25页 |
| 1.3.3.2 标记量大小 | 第25页 |
| 1.3.3.3 群体大小 | 第25页 |
| 1.3.3.4 群体结构 | 第25页 |
| 1.3.4 关联分析在玉米遗传研究中应用 | 第25-26页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第26页 |
| 1.5 研究内容及技术路线 | 第26-28页 |
| 第二章 玉米砷积累连锁定位与全基因组关联分析 | 第28-60页 |
| 2.1 引言 | 第28-29页 |
| 2.2 材料与方法 | 第29-31页 |
| 2.2.1 植株材料 | 第29页 |
| 2.2.2 试验设计 | 第29页 |
| 2.2.3 As含量检测 | 第29页 |
| 2.2.4 遗传连锁图 | 第29-30页 |
| 2.2.4.1 连锁分析遗传连锁图 | 第29-30页 |
| 2.2.4.2 关联分析基因型 | 第30页 |
| 2.2.5 数据统计与分析 | 第30-31页 |
| 2.2.5.1 关联群体基因型分析 | 第30页 |
| 2.2.5.2 表型数据分析 | 第30页 |
| 2.2.5.3 连锁群体QTL定位分析 | 第30-31页 |
| 2.2.5.4 全基因组关联分析 | 第31页 |
| 2.2.5.5 关联分析SNP标记与QTL比较 | 第31页 |
| 2.2.5.6 候选基因分析 | 第31页 |
| 2.3 结果与分析 | 第31-57页 |
| 2.3.1 连锁群体QTL定位分析 | 第31-38页 |
| 2.3.1.1 玉米不同组织砷含量表型变化 | 第31-33页 |
| 2.3.1.2 玉米不同组织砷含量的相关分析 | 第33页 |
| 2.3.1.3 玉米不同组织砷含量的分离特性 | 第33-34页 |
| 2.3.1.4 玉米不同组织砷含量QTL分析 | 第34-38页 |
| 2.3.2 玉米砷含量的关联分析 | 第38-48页 |
| 2.3.2.1 SNP标记统计信息 | 第38-39页 |
| 2.3.2.2 关联群体的表型数据分析 | 第39-45页 |
| 2.3.2.3 玉米不同组织砷含量的关联分析 | 第45-48页 |
| 2.3.3 关联SNP位点基因的功能分析 | 第48-56页 |
| 2.3.4 定位的QTL与关联标记比较 | 第56-57页 |
| 2.4 讨论 | 第57-60页 |
| 2.4.1 玉米不同组织砷积累 | 第57页 |
| 2.4.2 PSC品种的选育 | 第57-58页 |
| 2.4.3 砷积累的QTL定位分析 | 第58页 |
| 2.4.4 连锁分析结合关联分析在数量性状基因研究中应用 | 第58-59页 |
| 2.4.5 砷积累候选基因分析 | 第59-60页 |
| 第三章 玉米汞积累连锁定位与全基因组关联分析 | 第60-88页 |
| 3.1 引言 | 第60-61页 |
| 3.2 材料与方法 | 第61-62页 |
| 3.2.1 植株材料 | 第61页 |
| 3.2.2 试验设计 | 第61页 |
| 3.2.3 汞含量检测 | 第61页 |
| 3.2.4 遗传连锁图 | 第61页 |
| 3.2.5 数据统计与分析 | 第61-62页 |
| 3.3 结果与分析 | 第62-85页 |
| 3.3.1 连锁群体QTL定位分析 | 第62-68页 |
| 3.3.1.1 玉米不同组织汞含量表型变化 | 第62-63页 |
| 3.3.1.2 玉米不同组织汞含量的相关分析 | 第63-64页 |
| 3.3.1.3 玉米不同组织汞含量的分离特性 | 第64-65页 |
| 3.3.1.4 玉米不同组织汞含量QTL分析 | 第65-68页 |
| 3.3.2 关联分析 | 第68-76页 |
| 3.3.2.1 表型统计分析 | 第68-74页 |
| 3.3.2.3 关联分析 | 第74-76页 |
| 3.3.3 关联SNP位点附近基因的功能分析 | 第76-85页 |
| 3.3.4 QTL定位结果与关联标记的整合 | 第85页 |
| 3.4 讨论 | 第85-88页 |
| 3.4.1 汞在玉米中的积累分配规律 | 第85-86页 |
| 3.4.2 选育低积累品种降低作物重金属积累 | 第86页 |
| 3.4.3 汞积累及抗性的遗传研究 | 第86-87页 |
| 3.4.4 汞积累的全基因组关联分析 | 第87页 |
| 3.4.5 汞积累候选基因分析 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-105页 |
| 附表 | 第105-119页 |
| 英文摘要 | 第119-120页 |
| 攻读博士学位期间发表论文情况 | 第121页 |
