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棉花PMEs基因家族进化分析与GhJAZ基因功能研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
缩略词表第9-14页
1 前言第14-24页
    1.1 棉纤维品质性状的研究意义第15页
    1.2 棉纤维的发育第15-19页
        1.2.1 起始期第16-17页
        1.2.2 伸长期第17-18页
        1.2.3 次生壁加厚期第18页
        1.2.4 成熟期第18-19页
    1.3 果胶甲酯酶的研究进展第19-20页
        1.3.1 果胶甲酯酶的研究意义第19页
        1.3.2 果胶第19页
        1.3.3 果胶甲酯酶第19-20页
    1.4 棉纤维次生壁加厚期的相关研究第20-21页
    1.5 本研究的目的和意义第21-24页
2 材料与方法第24-42页
    2.1 材料第24-27页
        2.1.1 实验材料的种植第24页
        2.1.2 取材第24页
        2.1.3 菌株第24-25页
        2.1.4 载体第25页
        2.1.5 所用试剂第25页
        2.1.6 缓冲液、培养基及抗生素第25-27页
    2.2 实验仪器第27-28页
    2.3 实验方法第28-42页
        2.3.1 相关数据下载第28页
        2.3.2 棉花PMEs家族基因的识别与鉴定第28页
        2.3.3 PMEs家族进化分析第28-29页
        2.3.4 亚洲棉PMEs基因家族的基本结构预测和分析第29页
        2.3.5 亚洲棉PMEs基因家族的EST电子频率分析第29页
        2.3.6 总RNA的提取和qRT-PCR第29-31页
        2.3.7 qRT-PCR表达特性分析第31-32页
        2.3.8 PMEs粗酶液的提取与酶活性测定第32-33页
        2.3.9 GhPME36转基因拟南芥植株的获得第33页
        2.3.10 陆地棉GhJAZ基因的克隆第33-42页
3 结果与分析第42-78页
    3.1 陆地棉69307和石系亚1号纤维品质概况第42页
    3.2 棉花总RNA提取第42-43页
    3.3 棉花PMEs基因家族的鉴定和分析第43-61页
        3.3.1 棉花全基因组水平PMEs基因家族成员鉴定第43-44页
        3.3.2 棉花PMEs基因家族的染色体定位第44-49页
        3.3.3 棉花果胶甲酯酶基因结构和蛋白结构域分析第49-52页
        3.3.4 陆地棉、亚洲棉、雷蒙德氏棉PMEs基因家族的进化关系分析第52页
        3.3.5 PMEs基因家族成员的进化分析第52-55页
        3.3.6 转录组分析第55-59页
        3.3.7 荧光定量表达分析第59-60页
        3.3.8 果胶甲酯酶活性测定第60-61页
    3.4 亚洲棉PMEs家族基因的分析第61-68页
        3.4.1 亚洲棉PME蛋白家族基本结构及理化性质分析第61-65页
        3.4.2 亚洲棉PMEs蛋白的三级结构第65页
        3.4.3 亚洲棉PMEs基因家族的EST电子频率分析第65-66页
        3.4.4 亚洲棉果胶甲酯酶第一亚家族基因的荧光定量表达分析第66-68页
    3.5 GhPME36转基因植株表型第68-70页
    3.6 GhJAZ基因基因的克隆与分析第70-78页
        3.6.1 GhJAZ基因的来源第70页
        3.6.2 GhJAZ基因的cDNA全长序列克隆第70-72页
        3.6.3 GhJAZ基因表达模式分析第72页
        3.6.4 GhJAZ基因功能的初步验证第72-78页
4 讨论第78-84页
    4.1 棉花果胶甲酯酶基因家族与棉花全基因组第78页
    4.2 棉花果胶甲酯酶家族基因的进化第78-79页
    4.3 棉花果胶甲酯酶基因研究的重要意义第79-80页
    4.4 直系同源基因的表达差异及原因第80页
    4.5 果胶甲酯酶家族基因与棉纤维发育的关系第80-81页
    4.6 基因来源的准确性第81页
    4.7 JAZ基因与棉纤维发育第81-84页
结论第84-86页
参考文献第86-94页
附录第94-114页
硕士期间论文发表情况第114-116页
致谢第116-117页

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