| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-26页 |
| ·血管紧张素转化酶简介 | 第10-13页 |
| ·高血压与血管紧张素转化酶的关系 | 第10-11页 |
| ·血管紧张素转化酶的结构和类型 | 第11-13页 |
| ·血管紧张素转化酶抑制剂 | 第13-15页 |
| ·常见的血管紧张素转化酶抑制剂及其结构 | 第13-14页 |
| ·血管紧张素转化酶抑制剂的作用机制 | 第14-15页 |
| ·分子对接简介 | 第15-18页 |
| ·分子对接原理 | 第15-16页 |
| ·AUTODOCK简介 | 第16-18页 |
| ·常用对接软件介绍 | 第18页 |
| ·GAUSSIAN简介 | 第18-20页 |
| ·GAUSSIAN计算原理 | 第19页 |
| ·GAUSSIAN功能介绍 | 第19页 |
| ·常用量化程序介绍 | 第19-20页 |
| ·分子动力学模拟简介 | 第20-24页 |
| ·分子动力学原理 | 第20-22页 |
| ·GROMACS简介 | 第22-24页 |
| ·常用的动力学模拟软件 | 第24页 |
| ·本论文研究的主要内容和思路 | 第24-26页 |
| 第二章 蛋白质大分子和多肽抑制剂的预处理及对接过程 | 第26-34页 |
| ·前言 | 第26-27页 |
| ·计算方法 | 第27-28页 |
| ·总体方法 | 第27页 |
| ·酶的预处理 | 第27-28页 |
| ·小分子的生成与结构优化 | 第28页 |
| ·分子对接方法 | 第28页 |
| ·结果和讨论 | 第28-33页 |
| ·酶预处理结果 | 第28-30页 |
| ·分子对接结果 | 第30-33页 |
| ·结论 | 第33-34页 |
| 第三章 蛋白酶活性位点的量化计算 | 第34-44页 |
| ·前言 | 第34页 |
| ·计算方法 | 第34-35页 |
| ·GAUSSIAN计算方法 | 第34-35页 |
| ·RESP电荷拟合方法 | 第35页 |
| ·结果与讨论 | 第35-43页 |
| ·活性位点的高斯优化结果 | 第35-37页 |
| ·RESP电荷拟合结果 | 第37-38页 |
| ·动力学模拟过程中的平均键长 | 第38页 |
| ·动力学模拟过程中的平均键角 | 第38-39页 |
| ·动力学模拟过程中键长随时间的变化 | 第39页 |
| ·动力学模拟过程中角度随时间的变化 | 第39-43页 |
| ·结论 | 第43-44页 |
| 第四章 分子动力学模拟 | 第44-64页 |
| ·前言 | 第44-45页 |
| ·计算方法 | 第45-48页 |
| ·总体计算方法 | 第45-46页 |
| ·动力学模拟参数设置 | 第46页 |
| ·蛋白酶二级结构分析方法 | 第46-47页 |
| ·蛋白酶与抑制剂相互作用能分析方法 | 第47-48页 |
| ·多肽抑制剂与活性位点氨基酸残基的相互作用的分析 | 第48页 |
| ·结果和讨论 | 第48-63页 |
| ·模拟过程中RMSD的分析 | 第48-51页 |
| ·蛋白酶回转半径的分析 | 第51-52页 |
| ·模拟过程中蛋白酶α-螺旋半径随时间变化的分析 | 第52-53页 |
| ·蛋白质模拟过程中总体二级结构的变化 | 第53-57页 |
| ·蛋白酶与多肽抑制剂的相互作用能 | 第57-58页 |
| ·多肽抑制剂各个氨基酸残基与蛋白酶的相互作用能 | 第58-59页 |
| ·与抑制剂有相互作用的氨基酸残基的分析 | 第59-63页 |
| ·结论 | 第63-64页 |
| 第五章 结论 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-70页 |
| 致谢 | 第70-72页 |
| 研究成果及发表的学术论文 | 第72-74页 |
| 作者和导师简介 | 第74-75页 |
| 附录 | 第75-76页 |