基于FM-index的DNA序列数据压缩算法
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-24页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第14-15页 |
| 1.2 研究现状 | 第15-18页 |
| 1.2.1 DNA数据压缩技术现状 | 第15-17页 |
| 1.2.2 通用全文压缩索引技术现状 | 第17-18页 |
| 1.3 FM-index | 第18-22页 |
| 1.4 本文工作 | 第22-24页 |
| 第二章 DNA序列集压缩索引基础 | 第24-34页 |
| 2.1 DNA数据特点 | 第24-26页 |
| 2.2 问题定义 | 第26-27页 |
| 2.3 双序列间信息映射结构 | 第27-32页 |
| 2.3.1 DNA序列间的差异对比 | 第27-29页 |
| 2.3.2 LCS映射结构 | 第29-32页 |
| 2.4 本章小结 | 第32-34页 |
| 第三章 ALCS-FM算法 | 第34-54页 |
| 3.1 ALCS映射结构 | 第34-37页 |
| 3.2 算法思想 | 第37-41页 |
| 3.3 压缩索引结构 | 第41-47页 |
| 3.3.1 混合编码结构 | 第42-45页 |
| 3.3.2 相似0/1序列存储结构 | 第45-47页 |
| 3.3.3 性能分析 | 第47页 |
| 3.4 查询定位操作 | 第47-52页 |
| 3.4.1 随机访问 | 第47-48页 |
| 3.4.2 模式匹配 | 第48-52页 |
| 3.5 本章小结 | 第52-54页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第54-64页 |
| 4.1 实验环境 | 第54页 |
| 4.2 ALCS结构性能分析 | 第54-56页 |
| 4.3 混合编码压缩索引结构性能分析 | 第56-59页 |
| 4.4 ALCS-FM算法性能分析 | 第59-63页 |
| 4.5 本章小结 | 第63-64页 |
| 第五章 总结与展望 | 第64-66页 |
| 5.1 总结 | 第64页 |
| 5.2 展望 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-70页 |
| 致谢 | 第70-72页 |
| 作者简介 | 第72-73页 |
