亚成体大熊猫肠道真菌多样性的初步研究
摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
符号说明 | 第7-10页 |
第一章 文献综述 | 第10-19页 |
1 微生物概述 | 第10-12页 |
1.1 古菌概述 | 第10页 |
1.2 细菌概述 | 第10页 |
1.3 真菌概述 | 第10-12页 |
2 大熊猫肠道菌群的概述 | 第12-14页 |
2.1 大熊猫肠道菌群研究意义 | 第12-13页 |
2.2 大熊猫肠道细菌概述 | 第13页 |
2.3 大熊猫肠道真菌概述 | 第13-14页 |
3 肠道真菌多样性研究方法 | 第14-17页 |
3.1 传统培养法 | 第14页 |
3.2 分子生物学方法 | 第14-17页 |
4 本实验研究意义及内容 | 第17-19页 |
4.1 研究意义 | 第17-18页 |
4.2 研究内容 | 第18-19页 |
第二章 实验研究 | 第19-47页 |
一 实验材料和方法 | 第19-28页 |
1 实验材料 | 第19-22页 |
1.1 实验的主要仪器 | 第19-20页 |
1.2 实验中的主要试剂及溶液的配制 | 第20-21页 |
1.2.1 实验中的主要试验 | 第20-21页 |
1.2.2 实验中主要溶液的配制 | 第21页 |
1.3 PCR引物 | 第21页 |
1.4 数据分析软件 | 第21-22页 |
2 熊猫粪便的采集 | 第22页 |
3 粪便真菌的粗提取 | 第22页 |
4 提取粪便真菌总DNA | 第22-23页 |
5 粪便总DNA的检测 | 第23-24页 |
6 粪便真菌菌群ITS片段的PCR扩增 | 第24页 |
7 纯化回收真菌ITS扩增片段 | 第24-25页 |
8 构建ITS克隆文库 | 第25-27页 |
8.1 目的片段与T载体相连接 | 第25页 |
8.2 转化 | 第25页 |
8.3 阳性克隆子的筛选 | 第25-26页 |
8.4 对筛选出来的阳性克隆子进行酶切 | 第26-27页 |
9 RFLP聚类分析 | 第27页 |
10 对构建的克隆文库进行统计分析 | 第27-28页 |
11 DNA序列的测定 | 第28页 |
12 ITS的系统发育分析 | 第28页 |
二 实验结果与分析 | 第28-43页 |
1 真菌ITS序列的PCR扩增 | 第28-29页 |
2 ITS克隆文库分析 | 第29-35页 |
3 RFLP分析 | 第35-41页 |
4 系统发育分析 | 第41-43页 |
三 讨论 | 第43-45页 |
1 大熊猫粪便的处理 | 第43页 |
2 粪便真菌总DNA的提取 | 第43页 |
3 真菌通用引物的选择 | 第43-44页 |
4 限制性内切酶的选择 | 第44页 |
5 数据的处理及分析 | 第44页 |
6 ITS-RFLP数据多样性分析 | 第44-45页 |
7 测序结果分析 | 第45页 |
四 结论与展望 | 第45-47页 |
1 结论 | 第45-46页 |
2 展望 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-53页 |
致谢 | 第53-54页 |
攻读学位期间待发表的学术论文 | 第54-55页 |
附录 | 第55-67页 |