| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 系统生物学简介 | 第10页 |
| 1.2 表型及相关分子网络 | 第10-17页 |
| 1.2.1 蛋白质相互作用网络 | 第13-14页 |
| 1.2.2 基因调控网络 | 第14页 |
| 1.2.3 代谢网络 | 第14-15页 |
| 1.2.4 信号转导网络 | 第15-16页 |
| 1.2.5 翻译后修饰网络 | 第16-17页 |
| 1.3 表型相关分子网络的研究意义 | 第17-18页 |
| 1.4 国内外研究概况 | 第18-20页 |
| 1.5 论文的主要研究内容 | 第20-21页 |
| 第二章 表型相关分子通路的识别 | 第21-39页 |
| 2.1 引言 | 第21页 |
| 2.2 基于分子相互作用网络的表型相关分子通路识别 | 第21-28页 |
| 2.2.1 基于图论模型的表型相关分子通路识别 | 第23-25页 |
| 2.2.2 基于最优化方法的表型相关分子通路识别 | 第25-27页 |
| 2.2.3 基于启发式方法的表型相关分子通路识别 | 第27-28页 |
| 2.3 乳腺癌相关分子通路的识别 | 第28-38页 |
| 2.3.1 实验数据 | 第28-29页 |
| 2.3.2 乳腺癌相关分子通路的识别模型 | 第29-31页 |
| 2.3.3 结果与分析 | 第31-38页 |
| 2.4 总结 | 第38-39页 |
| 第三章 基于蛋白质翻译后修饰网络的表型相关分子网络标记识别 | 第39-56页 |
| 3.1 引言 | 第39-40页 |
| 3.2 数据与方法 | 第40-44页 |
| 3.2.1 数据 | 第40-41页 |
| 3.2.2 蛋白质翻译后修饰网络模块的识别 | 第41页 |
| 3.2.3 药物靶蛋白和致病基因富集模块的识别 | 第41-42页 |
| 3.2.4 基于网络模块的药物靶蛋白预测 | 第42-44页 |
| 3.3 研究结果与分析 | 第44-55页 |
| 3.3.1 与表型相关的分子网络模块 | 第44-45页 |
| 3.3.2 表型相关分子网络模块与药物靶蛋白的关系 | 第45-47页 |
| 3.3.3 表型相关分子网络模块与致病基因的关系 | 第47-52页 |
| 3.3.4 预测的药物靶蛋白验证 | 第52-55页 |
| 3.4 总结 | 第55-56页 |
| 第四章 结论与展望 | 第56-58页 |
| 4.1 结论 | 第56-57页 |
| 4.2 展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-68页 |
| 附录 | 第68-71页 |
| 作者在攻读硕士学位期间公开发表的论文 | 第71-72页 |
| 作者在攻读硕士学位期间所参与的项目 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
