| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| Chapter 1 Introduction | 第10-23页 |
| 1.1 Background and significance | 第10-11页 |
| 1.2 Review of related research | 第11-21页 |
| 1.2.1 3D Human brain atlas | 第11-15页 |
| 1.2.2 State of the art atlas construction methods | 第15-21页 |
| 1.3 Main research contents | 第21-23页 |
| Chapter 2 Data and processing | 第23-33页 |
| 2.1 MRI data | 第23页 |
| 2.2 International consortium of brain mapping (ICBM) template | 第23-24页 |
| 2.3 Software | 第24页 |
| 2.3.1 Statistical parametric mapping (SPM) | 第24页 |
| 2.3.2 MRIcro | 第24页 |
| 2.4 Data preprocessing | 第24-31页 |
| 2.4.1 Reorientation and bias correcting | 第25-26页 |
| 2.4.2 Scull stripping | 第26-29页 |
| 2.4.3 Set the origins | 第29-31页 |
| 2.5 Brief summary | 第31-33页 |
| Chapter 3 Image registration | 第33-40页 |
| 3.1 Introduction | 第33页 |
| 3.2 Affine transformation | 第33-35页 |
| 3.2.1 Rotation | 第33-34页 |
| 3.2.2 Scale | 第34-35页 |
| 3.2.3 Shears | 第35页 |
| 3.3 Rigid body registration | 第35-39页 |
| 3.3.1 Rigid body registration with the same modalities | 第36-37页 |
| 3.3.2 Estimated data parameters optimization | 第37-38页 |
| 3.3.3 Within modality registration application | 第38-39页 |
| 3.4 Brief summary | 第39-40页 |
| Chapter 4 Brain morphometry | 第40-53页 |
| 4.1 Introduction | 第40页 |
| 4.2 Stereotaxic space | 第40-47页 |
| 4.2.1 Talairach stereotaxic space | 第41-46页 |
| 4.2.2 The spatial mapping function | 第46-47页 |
| 4.2.3 Optimization procedure | 第47页 |
| 4.3 Voxel-based morphometry | 第47-52页 |
| 4.3.1 Spatial normalizations | 第48-49页 |
| 4.3.2 Warping | 第49页 |
| 4.3.3 Segmentation | 第49-51页 |
| 4.3.4 Smoothing | 第51-52页 |
| 4.4 Brief summary | 第52-53页 |
| Chapter 5 Experiments and results | 第53-75页 |
| 5.1 Preprocessing | 第53-55页 |
| 5.2 Coregistration | 第55-57页 |
| 5.3 Normalization | 第57-58页 |
| 5.4 Smoothing | 第58-59页 |
| 5.5 Segmentation | 第59页 |
| 5.6 Atlas construction | 第59-70页 |
| 5.7 Statistics and comparison | 第70-75页 |
| 5.7.1 Statistic brain templates age and gender related comparison | 第70-75页 |
| Conclusions | 第75-77页 |
| References | 第77-84页 |
| Acknowledgements | 第84页 |
