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酵母核糖体大亚基的早期组装路线图

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
缩略词中英文对照表第13-14页
一、引言第14-34页
    1.1 真核生物核糖体的结构和功能第14-16页
    1.2 真核生物核糖体的生物发生过程第16-21页
        1.2.1 pre-rRNA的转录第17页
        1.2.2 pre-rRNA的剪切第17-19页
        1.2.3 pre-rRNA的修饰第19-20页
        1.2.4 核糖体发生过程中的核糖体蛋白和组装因子第20-21页
    1.3 早期核糖体前体的组装及成熟第21-24页
        1.3.1 90S核糖体前体复合物的组装与成熟第21-22页
        1.3.2 pre-40S颗粒的组装与成熟第22页
        1.3.3 pre-60S颗粒的组装与成熟第22-24页
    1.4 早期pre-60S颗粒的相关研究第24-26页
        1.4.1 A3因子第25-26页
        1.4.2 B因子第26页
    1.5 核糖体的发生是一个有层次的共转录发生的过程第26-29页
        1.5.1 真核生物核糖体的共转录组装第27-28页
        1.5.2 真核生物核糖体pre-rRNA的共转录修饰第28页
        1.5.3 真核生物核糖体pre-rRNA的共转录加工第28-29页
        1.5.4 真核生物核糖体的层次组装第29页
    1.6 真核生物核糖体前体共转录组装过程的研究方法第29-32页
        1.6.1 酿酒酵母表达系统第29页
        1.6.2 外源质粒可以在酿酒酵母体内表达并模拟转录过程中的pre-RNA第29-30页
        1.6.3 用于纯化rRNP的MS2标签亲和纯化及诱饵蛋白亲和纯化第30-32页
        1.6.4 液相色谱-质谱(LC-MS)联用技术第32页
    1.7 研究核糖体共转录组装过程的目的第32-34页
        1.7.1 研究核糖体发生过程的现实意义第32页
        1.7.2 早期pre-60S颗粒的共转录组装过程是需要解决的问题第32-34页
二、酵母核糖体大亚基早期组装过程的研究第34-87页
    2.1 实验背景第34-35页
    2.2 实验材料与实验方法第35-56页
        2.2.2 质粒克隆的构建和表达第35-42页
        2.2.3 酵母转化第42-43页
        2.2.4 MS2-MBP融合蛋白的表达纯化第43-45页
        2.2.5 磁力珠偶联IgG配体第45-46页
        2.2.6 一步TAP亲和纯化第46-47页
        2.2.7 MS2-IgG两步纯化第47-48页
        2.2.8 蛋白质样品的凝胶分离与银染染色第48-49页
        2.2.9 质谱样品的处理和分析第49-50页
        2.2.10 RNA样品的制备第50-51页
        2.2.11 Northern blot杂交实验第51-52页
        2.2.12 Primer Extension实验第52-56页
    2.3 实验结果第56-75页
        2.3.1 质粒表达的外源27S pre-rRNA在酵母体内可以被正常加工为成熟的25S rRNA第56-58页
        2.3.2 不同纯化策略的比较第58-61页
        2.3.3 含有不同长度pre-rRNA片段的早期pre-60S颗粒的纯化和质谱分析第61-64页
        2.3.4 早期pre-60S颗粒共转录组装过程中组装因子的组装顺序第64-65页
        2.3.5 早期pre-60S颗粒共转录组装过程中核糖体大亚基蛋白的组装顺序第65-68页
        2.3.6 用pre-rRNA片段纯化的早期pre-60S颗粒中rRNA的加工情况第68-71页
        2.3.7 5S rRNA在早期pre-60S颗粒中的组装时期第71页
        2.3.8 外源pre-rRNA纯化的pre-60S颗粒与内源纯化的pre-60S颗粒之间的比较第71-75页
    2.4 讨论第75-87页
        2.4.1 B位点的剪切与早期pre-60S颗粒共转录组装过程的联系第75-77页
        2.4.2 共转录组装过程中A3因子、B因子的组装顺序第77-78页
        2.4.3 一种比Ssf1颗粒更早期的pre-60S颗粒第78-79页
        2.4.4 蛋白因子组装顺序与ITS区域剪切顺序之间的联系第79页
        2.4.5 酵母共转录组装过程中的核糖体大亚基蛋白第79-82页
        2.4.6 3'ETS区域在早期pre-60S颗粒共转录组装中的作用第82-83页
        2.4.7 90S共转录组装与早期pre-60S共转录组装的比较第83-85页
        2.4.8 真核生物与原核生物核糖体大亚基蛋白组装过程的比较第85-86页
        2.4.9 本论文研究过程中的困难和不足第86-87页
三、结论与展望第87-88页
    3.1 结论第87页
    3.2 展望第87-88页
参考文献第88-94页
致谢第94-95页
简历第95-96页
附录第96-108页

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