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丙酮丁醇梭菌多效调控因子AbrB的鉴定及功能研究

摘要第4-6页
abstract第6-7页
第一章 绪论第11-22页
    1.1 研究背景第11-21页
        1.1.1 产溶剂梭菌第11-12页
        1.1.2 产溶剂梭菌中产溶剂相关调控因子的研究进展第12-17页
            1.1.2.1 Spo0A第12-14页
            1.1.2.2 CcpA第14-16页
            1.1.2.3 Rex第16页
            1.1.2.4 sigma因子第16-17页
        1.1.3 微生物中AbrB的研究进展第17-20页
            1.1.3.1 AbrB功能的研究进展第17-18页
            1.1.3.2 AbrB结构的研究进展第18-20页
        1.1.4 丙酮丁醇梭菌AbrB的研究进展第20-21页
    1.2 立题意义第21页
    1.3 本课题主要研究内容第21-22页
第二章 丙酮丁醇梭菌AbrBs突变株表型分析第22-48页
    2.1 实验材料与方法第22-41页
        2.1.1 实验材料第22-26页
            2.1.1.1 实验对象第22-23页
            2.1.1.2 实验试剂及试剂盒第23页
            2.1.1.3 主要器材第23-24页
            2.1.1.4 培养基及缓冲液第24-26页
        2.1.2 实验方法第26-41页
            2.1.2.1 质粒pIMP1-P_(abrB1)-lacZ、pIMP1-P_(abrB2)-lacZ、pIMP1-P_(abrB3)-lacZ的构建第26页
            2.1.2.2 质粒pWJ1-abrB1、pSJ1-abrB2和pWJ1-abrB3的构建第26-27页
            2.1.2.3 基因abrB1、abrB2和abrB3的敲除第27页
            2.1.2.4 质粒pIMP1-P_(ptb)-abrB1、pIMP1-P_(ptb)-abrB2和pIMP1-P_(ptb)-abrB3的构建第27-34页
            2.1.2.5 丙酮丁醇梭菌的电穿孔转化、鉴定及保菌第34-35页
            2.1.2.6 菌株发酵第35-36页
            2.1.2.7 发酵底物和代谢产物分析方法第36页
            2.1.2.8 丙酮丁醇梭菌 β-半乳糖苷酶酶活的测定第36-37页
            2.1.2.9 丙酮丁醇梭菌基因组抽提方法第37-38页
            2.1.2.10 Southern实验流程第38-41页
    2.2 实验结果第41-47页
        2.2.1 利用lacZ报告基因系统检测abrB同源基因启动子的活性第41-42页
        2.2.2 abrB基因失活与突变株的发酵表型分析第42-45页
        2.2.3 丙酮丁醇梭菌中过表达abrB基因与表型观察第45-47页
    2.3 本章小结第47-48页
第三章 AbrB对丙酮丁醇梭菌产酸产溶剂相关基因转录的影响第48-58页
    3.1 实验材料与方法第48-52页
        3.1.1 实验材料第48页
            3.1.1.1 实验试剂及试剂盒第48页
            3.1.1.2 主要仪器第48页
        3.1.2 实验方法第48-52页
            3.1.2.1 丙酮丁醇梭菌培养条件第48-49页
            3.1.2.2 RNA制备第49-50页
            3.1.2.3 RNA反转录合成cDNA第50页
            3.1.2.4 实时定量RT-PCR第50页
            3.1.2.5 蛋白表达与纯化第50-51页
            3.1.2.6 凝胶阻滞实验 (Electrophoretic Mobility Shift Assays,EMSA)第51-52页
    3.2 实验结果第52-57页
        3.2.1 824AbrB1突变株产酸产溶剂途径相关基因的转录分析第52-54页
        3.2.2 824AbrB2突变株产酸产溶剂途径相关基因的转录分析第54-55页
        3.2.3 824AbrB3突变株产酸产溶剂途径相关基因的转录分析第55-57页
    3.3 本章小结第57-58页
第四章 AbrB3蛋白功能的分子调节第58-66页
    4.1 实验材料与方法第58-61页
        4.1.1 实验材料第58-59页
            4.1.1.1 引物及菌株培养条件第58-59页
            4.1.1.2 主要器材第59页
            4.1.1.3 实验试剂及试剂盒第59页
        4.1.2 实验方法第59-61页
            4.1.2.1 丙酮丁醇梭菌AbrBs蛋白序列比对分析第59页
            4.1.2.2 AbrB3蛋白定点突变和饱和突变相关质粒的构建第59页
            4.1.2.3 丙酮丁醇梭菌的电穿孔转化、鉴定及保菌第59-60页
            4.1.2.4 菌株发酵第60页
            4.1.2.5 发酵底物和代谢产物分析方法第60-61页
    4.2 实验结果与讨论第61-65页
        4.2.1 丙酮丁醇梭菌AbrB3蛋白序列比对分析第61-62页
        4.2.2 AbrB3关键氨基酸残基的定点突变及表型分析第62-63页
        4.2.3 AbrB3~(R23)的饱和突变及表型分析第63-65页
    4.3 本章小结第65-66页
第五章 全文总结第66-68页
参考文献第68-75页
附录A 常规实验方法第75-78页
附录B 主要术语与缩写第78-79页
附录C AbrB3蛋白突变引物第79-83页
发表论文和参加科研情况说明第83-84页
致谢第84-85页

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